Protein–RNA interactions for Protein: Q96DD0

LRRC39, Leucine-rich repeat-containing protein 39, humanhuman

Predictions only

Length 335 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC39Q96DD0 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
LRRC39Q96DD0 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
LRRC39Q96DD0 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
LRRC39Q96DD0 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
LRRC39Q96DD0 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
LRRC39Q96DD0 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
LRRC39Q96DD0 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
LRRC39Q96DD0 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
LRRC39Q96DD0 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
LRRC39Q96DD0 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
LRRC39Q96DD0 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
LRRC39Q96DD0 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
LRRC39Q96DD0 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
LRRC39Q96DD0 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
LRRC39Q96DD0 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
LRRC39Q96DD0 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
LRRC39Q96DD0 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
LRRC39Q96DD0 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
LRRC39Q96DD0 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
LRRC39Q96DD0 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
LRRC39Q96DD0 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
LRRC39Q96DD0 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
LRRC39Q96DD0 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
LRRC39Q96DD0 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
LRRC39Q96DD0 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
LRRC39Q96DD0 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
LRRC39Q96DD0 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
LRRC39Q96DD0 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
LRRC39Q96DD0 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
LRRC39Q96DD0 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC26.14■■□□□ 1.77
LRRC39Q96DD0 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
LRRC39Q96DD0 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
LRRC39Q96DD0 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
LRRC39Q96DD0 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
LRRC39Q96DD0 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
LRRC39Q96DD0 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
LRRC39Q96DD0 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
LRRC39Q96DD0 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
LRRC39Q96DD0 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
LRRC39Q96DD0 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
LRRC39Q96DD0 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
LRRC39Q96DD0 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
LRRC39Q96DD0 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
LRRC39Q96DD0 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC26.1■■□□□ 1.77
LRRC39Q96DD0 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
LRRC39Q96DD0 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
LRRC39Q96DD0 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
LRRC39Q96DD0 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
LRRC39Q96DD0 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
LRRC39Q96DD0 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
LRRC39Q96DD0 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
LRRC39Q96DD0 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
LRRC39Q96DD0 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
LRRC39Q96DD0 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
LRRC39Q96DD0 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
LRRC39Q96DD0 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
LRRC39Q96DD0 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
LRRC39Q96DD0 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
LRRC39Q96DD0 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
LRRC39Q96DD0 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
LRRC39Q96DD0 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
LRRC39Q96DD0 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
LRRC39Q96DD0 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
LRRC39Q96DD0 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
LRRC39Q96DD0 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
LRRC39Q96DD0 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
LRRC39Q96DD0 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
LRRC39Q96DD0 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
LRRC39Q96DD0 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
LRRC39Q96DD0 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
LRRC39Q96DD0 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
LRRC39Q96DD0 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
LRRC39Q96DD0 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
LRRC39Q96DD0 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
LRRC39Q96DD0 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
LRRC39Q96DD0 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
LRRC39Q96DD0 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
LRRC39Q96DD0 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
LRRC39Q96DD0 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
LRRC39Q96DD0 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
LRRC39Q96DD0 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
LRRC39Q96DD0 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
LRRC39Q96DD0 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
LRRC39Q96DD0 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
LRRC39Q96DD0 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
LRRC39Q96DD0 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
LRRC39Q96DD0 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
LRRC39Q96DD0 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
LRRC39Q96DD0 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
LRRC39Q96DD0 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
LRRC39Q96DD0 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
LRRC39Q96DD0 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
LRRC39Q96DD0 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
LRRC39Q96DD0 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
LRRC39Q96DD0 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
LRRC39Q96DD0 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
LRRC39Q96DD0 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
LRRC39Q96DD0 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
LRRC39Q96DD0 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
LRRC39Q96DD0 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.8 ms