Protein–RNA interactions for Protein: Q96CT2

KLHL29, Kelch-like protein 29, humanhuman

Predictions only

Length 875 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL29Q96CT2 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
KLHL29Q96CT2 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
KLHL29Q96CT2 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
KLHL29Q96CT2 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
KLHL29Q96CT2 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
KLHL29Q96CT2 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
KLHL29Q96CT2 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
KLHL29Q96CT2 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
KLHL29Q96CT2 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
KLHL29Q96CT2 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
KLHL29Q96CT2 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
KLHL29Q96CT2 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
KLHL29Q96CT2 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
KLHL29Q96CT2 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
KLHL29Q96CT2 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
KLHL29Q96CT2 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
KLHL29Q96CT2 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
KLHL29Q96CT2 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
KLHL29Q96CT2 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
KLHL29Q96CT2 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
KLHL29Q96CT2 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
KLHL29Q96CT2 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
KLHL29Q96CT2 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC25.62■■□□□ 1.69
KLHL29Q96CT2 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
KLHL29Q96CT2 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
KLHL29Q96CT2 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
KLHL29Q96CT2 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
KLHL29Q96CT2 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
KLHL29Q96CT2 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
KLHL29Q96CT2 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
KLHL29Q96CT2 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
KLHL29Q96CT2 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
KLHL29Q96CT2 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
KLHL29Q96CT2 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
KLHL29Q96CT2 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
KLHL29Q96CT2 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
KLHL29Q96CT2 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
KLHL29Q96CT2 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
KLHL29Q96CT2 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
KLHL29Q96CT2 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
KLHL29Q96CT2 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
KLHL29Q96CT2 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
KLHL29Q96CT2 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
KLHL29Q96CT2 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
KLHL29Q96CT2 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
KLHL29Q96CT2 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
KLHL29Q96CT2 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
KLHL29Q96CT2 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
KLHL29Q96CT2 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
KLHL29Q96CT2 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
KLHL29Q96CT2 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
KLHL29Q96CT2 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
KLHL29Q96CT2 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
KLHL29Q96CT2 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
KLHL29Q96CT2 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
KLHL29Q96CT2 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC25.52■■□□□ 1.68
KLHL29Q96CT2 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
KLHL29Q96CT2 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
KLHL29Q96CT2 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
KLHL29Q96CT2 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
KLHL29Q96CT2 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
KLHL29Q96CT2 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
KLHL29Q96CT2 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
KLHL29Q96CT2 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
KLHL29Q96CT2 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
KLHL29Q96CT2 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
KLHL29Q96CT2 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
KLHL29Q96CT2 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
KLHL29Q96CT2 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
KLHL29Q96CT2 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
KLHL29Q96CT2 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
KLHL29Q96CT2 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
KLHL29Q96CT2 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
KLHL29Q96CT2 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
KLHL29Q96CT2 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
KLHL29Q96CT2 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
KLHL29Q96CT2 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
KLHL29Q96CT2 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
KLHL29Q96CT2 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
KLHL29Q96CT2 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
KLHL29Q96CT2 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
KLHL29Q96CT2 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
KLHL29Q96CT2 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
KLHL29Q96CT2 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
KLHL29Q96CT2 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
KLHL29Q96CT2 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
KLHL29Q96CT2 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
KLHL29Q96CT2 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
KLHL29Q96CT2 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
KLHL29Q96CT2 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
KLHL29Q96CT2 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
KLHL29Q96CT2 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
KLHL29Q96CT2 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
KLHL29Q96CT2 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
KLHL29Q96CT2 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
KLHL29Q96CT2 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
KLHL29Q96CT2 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
KLHL29Q96CT2 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
KLHL29Q96CT2 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
KLHL29Q96CT2 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.9 ms