Protein–RNA interactions for Protein: Q96B33

CLDN23, Claudin-23, humanhuman

Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN23Q96B33 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CLDN23Q96B33 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
CLDN23Q96B33 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC26.63■■□□□ 1.85
CLDN23Q96B33 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CLDN23Q96B33 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
CLDN23Q96B33 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CLDN23Q96B33 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CLDN23Q96B33 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CLDN23Q96B33 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CLDN23Q96B33 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CLDN23Q96B33 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
CLDN23Q96B33 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CLDN23Q96B33 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
CLDN23Q96B33 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
CLDN23Q96B33 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.84
CLDN23Q96B33 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
CLDN23Q96B33 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CLDN23Q96B33 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CLDN23Q96B33 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CLDN23Q96B33 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
CLDN23Q96B33 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
CLDN23Q96B33 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CLDN23Q96B33 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CLDN23Q96B33 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
CLDN23Q96B33 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
CLDN23Q96B33 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CLDN23Q96B33 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CLDN23Q96B33 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CLDN23Q96B33 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CLDN23Q96B33 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CLDN23Q96B33 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
CLDN23Q96B33 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
CLDN23Q96B33 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CLDN23Q96B33 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CLDN23Q96B33 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
CLDN23Q96B33 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CLDN23Q96B33 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
CLDN23Q96B33 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CLDN23Q96B33 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
CLDN23Q96B33 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CLDN23Q96B33 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CLDN23Q96B33 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CLDN23Q96B33 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CLDN23Q96B33 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CLDN23Q96B33 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CLDN23Q96B33 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CLDN23Q96B33 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CLDN23Q96B33 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
CLDN23Q96B33 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
CLDN23Q96B33 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
CLDN23Q96B33 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
CLDN23Q96B33 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CLDN23Q96B33 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CLDN23Q96B33 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CLDN23Q96B33 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CLDN23Q96B33 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CLDN23Q96B33 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
CLDN23Q96B33 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
CLDN23Q96B33 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CLDN23Q96B33 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CLDN23Q96B33 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CLDN23Q96B33 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CLDN23Q96B33 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CLDN23Q96B33 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
CLDN23Q96B33 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CLDN23Q96B33 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CLDN23Q96B33 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CLDN23Q96B33 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
CLDN23Q96B33 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
CLDN23Q96B33 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
CLDN23Q96B33 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CLDN23Q96B33 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CLDN23Q96B33 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CLDN23Q96B33 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
CLDN23Q96B33 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CLDN23Q96B33 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
CLDN23Q96B33 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CLDN23Q96B33 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CLDN23Q96B33 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
CLDN23Q96B33 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
CLDN23Q96B33 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CLDN23Q96B33 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
CLDN23Q96B33 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
CLDN23Q96B33 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
CLDN23Q96B33 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CLDN23Q96B33 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CLDN23Q96B33 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
CLDN23Q96B33 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
CLDN23Q96B33 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CLDN23Q96B33 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
CLDN23Q96B33 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
CLDN23Q96B33 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
CLDN23Q96B33 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CLDN23Q96B33 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
CLDN23Q96B33 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
CLDN23Q96B33 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC26.31■■□□□ 1.8
CLDN23Q96B33 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CLDN23Q96B33 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CLDN23Q96B33 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CLDN23Q96B33 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.7 ms