Protein–RNA interactions for Protein: Q969X6

UTP4, U3 small nucleolar RNA-associated protein 4 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 686 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UTP4Q969X6 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
UTP4Q969X6 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
UTP4Q969X6 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
UTP4Q969X6 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
UTP4Q969X6 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
UTP4Q969X6 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
UTP4Q969X6 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
UTP4Q969X6 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
UTP4Q969X6 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
UTP4Q969X6 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
UTP4Q969X6 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
UTP4Q969X6 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
UTP4Q969X6 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
UTP4Q969X6 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
UTP4Q969X6 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
UTP4Q969X6 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
UTP4Q969X6 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
UTP4Q969X6 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
UTP4Q969X6 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
UTP4Q969X6 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
UTP4Q969X6 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
UTP4Q969X6 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
UTP4Q969X6 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
UTP4Q969X6 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
UTP4Q969X6 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
UTP4Q969X6 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
UTP4Q969X6 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
UTP4Q969X6 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
UTP4Q969X6 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
UTP4Q969X6 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
UTP4Q969X6 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
UTP4Q969X6 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
UTP4Q969X6 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
UTP4Q969X6 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
UTP4Q969X6 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
UTP4Q969X6 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
UTP4Q969X6 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
UTP4Q969X6 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
UTP4Q969X6 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
UTP4Q969X6 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
UTP4Q969X6 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
UTP4Q969X6 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
UTP4Q969X6 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
UTP4Q969X6 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
UTP4Q969X6 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
UTP4Q969X6 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
UTP4Q969X6 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
UTP4Q969X6 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
UTP4Q969X6 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
UTP4Q969X6 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
UTP4Q969X6 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
UTP4Q969X6 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
UTP4Q969X6 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
UTP4Q969X6 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
UTP4Q969X6 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
UTP4Q969X6 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
UTP4Q969X6 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
UTP4Q969X6 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
UTP4Q969X6 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
UTP4Q969X6 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
UTP4Q969X6 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
UTP4Q969X6 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
UTP4Q969X6 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
UTP4Q969X6 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
UTP4Q969X6 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
UTP4Q969X6 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
UTP4Q969X6 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
UTP4Q969X6 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
UTP4Q969X6 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
UTP4Q969X6 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
UTP4Q969X6 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
UTP4Q969X6 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
UTP4Q969X6 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
UTP4Q969X6 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
UTP4Q969X6 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
UTP4Q969X6 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
UTP4Q969X6 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
UTP4Q969X6 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
UTP4Q969X6 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
UTP4Q969X6 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
UTP4Q969X6 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
UTP4Q969X6 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
UTP4Q969X6 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
UTP4Q969X6 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
UTP4Q969X6 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
UTP4Q969X6 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
UTP4Q969X6 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
UTP4Q969X6 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
UTP4Q969X6 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
UTP4Q969X6 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
UTP4Q969X6 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
UTP4Q969X6 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
UTP4Q969X6 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
UTP4Q969X6 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
UTP4Q969X6 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
UTP4Q969X6 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
UTP4Q969X6 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
UTP4Q969X6 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
UTP4Q969X6 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
UTP4Q969X6 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms