Protein–RNA interactions for Protein: Q969T4

UBE2E3, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 E3, humanhuman

Predictions only

Length 207 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2E3Q969T4 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
UBE2E3Q969T4 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
UBE2E3Q969T4 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
UBE2E3Q969T4 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
UBE2E3Q969T4 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
UBE2E3Q969T4 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
UBE2E3Q969T4 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
UBE2E3Q969T4 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
UBE2E3Q969T4 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
UBE2E3Q969T4 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
UBE2E3Q969T4 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
UBE2E3Q969T4 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
UBE2E3Q969T4 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
UBE2E3Q969T4 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
UBE2E3Q969T4 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
UBE2E3Q969T4 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
UBE2E3Q969T4 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
UBE2E3Q969T4 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
UBE2E3Q969T4 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
UBE2E3Q969T4 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
UBE2E3Q969T4 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
UBE2E3Q969T4 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
UBE2E3Q969T4 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
UBE2E3Q969T4 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
UBE2E3Q969T4 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
UBE2E3Q969T4 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
UBE2E3Q969T4 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
UBE2E3Q969T4 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
UBE2E3Q969T4 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
UBE2E3Q969T4 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
UBE2E3Q969T4 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
UBE2E3Q969T4 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
UBE2E3Q969T4 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
UBE2E3Q969T4 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
UBE2E3Q969T4 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
UBE2E3Q969T4 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
UBE2E3Q969T4 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
UBE2E3Q969T4 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
UBE2E3Q969T4 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
UBE2E3Q969T4 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
UBE2E3Q969T4 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
UBE2E3Q969T4 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
UBE2E3Q969T4 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
UBE2E3Q969T4 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
UBE2E3Q969T4 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
UBE2E3Q969T4 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
UBE2E3Q969T4 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
UBE2E3Q969T4 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
UBE2E3Q969T4 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
UBE2E3Q969T4 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
UBE2E3Q969T4 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
UBE2E3Q969T4 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
UBE2E3Q969T4 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
UBE2E3Q969T4 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
UBE2E3Q969T4 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
UBE2E3Q969T4 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
UBE2E3Q969T4 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
UBE2E3Q969T4 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
UBE2E3Q969T4 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
UBE2E3Q969T4 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
UBE2E3Q969T4 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
UBE2E3Q969T4 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
UBE2E3Q969T4 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
UBE2E3Q969T4 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
UBE2E3Q969T4 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
UBE2E3Q969T4 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
UBE2E3Q969T4 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
UBE2E3Q969T4 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
UBE2E3Q969T4 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
UBE2E3Q969T4 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
UBE2E3Q969T4 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
UBE2E3Q969T4 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
UBE2E3Q969T4 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
UBE2E3Q969T4 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
UBE2E3Q969T4 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
UBE2E3Q969T4 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC24.71■■□□□ 1.55
UBE2E3Q969T4 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
UBE2E3Q969T4 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
UBE2E3Q969T4 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
UBE2E3Q969T4 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
UBE2E3Q969T4 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.54
UBE2E3Q969T4 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
UBE2E3Q969T4 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
UBE2E3Q969T4 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
UBE2E3Q969T4 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
UBE2E3Q969T4 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
UBE2E3Q969T4 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
UBE2E3Q969T4 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
UBE2E3Q969T4 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
UBE2E3Q969T4 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
UBE2E3Q969T4 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
UBE2E3Q969T4 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
UBE2E3Q969T4 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
UBE2E3Q969T4 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
UBE2E3Q969T4 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
UBE2E3Q969T4 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
UBE2E3Q969T4 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
UBE2E3Q969T4 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
UBE2E3Q969T4 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
UBE2E3Q969T4 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.5 ms