Protein–RNA interactions for Protein: Q969E2

SCAMP4, Secretory carrier-associated membrane protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAMP4Q969E2 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC25.91■■□□□ 1.74
SCAMP4Q969E2 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SCAMP4Q969E2 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SCAMP4Q969E2 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SCAMP4Q969E2 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SCAMP4Q969E2 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SCAMP4Q969E2 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SCAMP4Q969E2 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
SCAMP4Q969E2 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
SCAMP4Q969E2 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
SCAMP4Q969E2 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC25.89■■□□□ 1.73
SCAMP4Q969E2 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
SCAMP4Q969E2 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
SCAMP4Q969E2 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SCAMP4Q969E2 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC25.87■■□□□ 1.73
SCAMP4Q969E2 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC25.87■■□□□ 1.73
SCAMP4Q969E2 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
SCAMP4Q969E2 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SCAMP4Q969E2 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SCAMP4Q969E2 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SCAMP4Q969E2 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SCAMP4Q969E2 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SCAMP4Q969E2 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SCAMP4Q969E2 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SCAMP4Q969E2 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
SCAMP4Q969E2 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
SCAMP4Q969E2 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC25.83■■□□□ 1.73
SCAMP4Q969E2 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
SCAMP4Q969E2 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
SCAMP4Q969E2 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
SCAMP4Q969E2 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
SCAMP4Q969E2 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
SCAMP4Q969E2 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SCAMP4Q969E2 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SCAMP4Q969E2 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SCAMP4Q969E2 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SCAMP4Q969E2 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
SCAMP4Q969E2 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SCAMP4Q969E2 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SCAMP4Q969E2 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SCAMP4Q969E2 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SCAMP4Q969E2 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SCAMP4Q969E2 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SCAMP4Q969E2 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SCAMP4Q969E2 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SCAMP4Q969E2 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SCAMP4Q969E2 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SCAMP4Q969E2 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SCAMP4Q969E2 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SCAMP4Q969E2 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SCAMP4Q969E2 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SCAMP4Q969E2 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SCAMP4Q969E2 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SCAMP4Q969E2 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SCAMP4Q969E2 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SCAMP4Q969E2 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SCAMP4Q969E2 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SCAMP4Q969E2 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SCAMP4Q969E2 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
SCAMP4Q969E2 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SCAMP4Q969E2 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SCAMP4Q969E2 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SCAMP4Q969E2 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SCAMP4Q969E2 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
SCAMP4Q969E2 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
SCAMP4Q969E2 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
SCAMP4Q969E2 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
SCAMP4Q969E2 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SCAMP4Q969E2 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SCAMP4Q969E2 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SCAMP4Q969E2 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
SCAMP4Q969E2 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
SCAMP4Q969E2 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SCAMP4Q969E2 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SCAMP4Q969E2 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SCAMP4Q969E2 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SCAMP4Q969E2 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
SCAMP4Q969E2 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
SCAMP4Q969E2 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
SCAMP4Q969E2 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
SCAMP4Q969E2 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
SCAMP4Q969E2 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SCAMP4Q969E2 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
SCAMP4Q969E2 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SCAMP4Q969E2 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
SCAMP4Q969E2 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
SCAMP4Q969E2 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SCAMP4Q969E2 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SCAMP4Q969E2 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SCAMP4Q969E2 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SCAMP4Q969E2 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
SCAMP4Q969E2 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SCAMP4Q969E2 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
SCAMP4Q969E2 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SCAMP4Q969E2 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
SCAMP4Q969E2 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SCAMP4Q969E2 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SCAMP4Q969E2 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SCAMP4Q969E2 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SCAMP4Q969E2 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 454.8 ms