Protein–RNA interactions for Protein: Q92772

CDKL2, Cyclin-dependent kinase-like 2, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKL2Q92772 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CDKL2Q92772 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CDKL2Q92772 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CDKL2Q92772 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
CDKL2Q92772 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CDKL2Q92772 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CDKL2Q92772 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CDKL2Q92772 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CDKL2Q92772 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CDKL2Q92772 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CDKL2Q92772 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CDKL2Q92772 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CDKL2Q92772 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CDKL2Q92772 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CDKL2Q92772 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CDKL2Q92772 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CDKL2Q92772 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
CDKL2Q92772 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CDKL2Q92772 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CDKL2Q92772 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CDKL2Q92772 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CDKL2Q92772 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CDKL2Q92772 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CDKL2Q92772 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CDKL2Q92772 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CDKL2Q92772 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CDKL2Q92772 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CDKL2Q92772 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CDKL2Q92772 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CDKL2Q92772 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.75
CDKL2Q92772 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
CDKL2Q92772 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CDKL2Q92772 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CDKL2Q92772 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CDKL2Q92772 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CDKL2Q92772 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
CDKL2Q92772 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CDKL2Q92772 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CDKL2Q92772 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CDKL2Q92772 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CDKL2Q92772 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CDKL2Q92772 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CDKL2Q92772 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CDKL2Q92772 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CDKL2Q92772 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CDKL2Q92772 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CDKL2Q92772 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CDKL2Q92772 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
CDKL2Q92772 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CDKL2Q92772 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CDKL2Q92772 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CDKL2Q92772 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CDKL2Q92772 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
CDKL2Q92772 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CDKL2Q92772 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
CDKL2Q92772 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CDKL2Q92772 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CDKL2Q92772 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CDKL2Q92772 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CDKL2Q92772 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CDKL2Q92772 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CDKL2Q92772 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CDKL2Q92772 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
CDKL2Q92772 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
CDKL2Q92772 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CDKL2Q92772 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CDKL2Q92772 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CDKL2Q92772 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CDKL2Q92772 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CDKL2Q92772 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CDKL2Q92772 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CDKL2Q92772 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CDKL2Q92772 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CDKL2Q92772 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CDKL2Q92772 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CDKL2Q92772 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CDKL2Q92772 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CDKL2Q92772 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CDKL2Q92772 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CDKL2Q92772 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CDKL2Q92772 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CDKL2Q92772 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CDKL2Q92772 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CDKL2Q92772 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CDKL2Q92772 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CDKL2Q92772 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CDKL2Q92772 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CDKL2Q92772 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
CDKL2Q92772 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
CDKL2Q92772 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CDKL2Q92772 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CDKL2Q92772 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
CDKL2Q92772 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CDKL2Q92772 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CDKL2Q92772 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CDKL2Q92772 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CDKL2Q92772 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CDKL2Q92772 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CDKL2Q92772 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CDKL2Q92772 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.5 ms