Protein–RNA interactions for Protein: Q92629

SGCD, Delta-sarcoglycan, humanhuman

Predictions only

Length 289 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCDQ92629 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SGCDQ92629 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SGCDQ92629 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SGCDQ92629 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SGCDQ92629 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SGCDQ92629 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SGCDQ92629 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
SGCDQ92629 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
SGCDQ92629 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.38
SGCDQ92629 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
SGCDQ92629 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
SGCDQ92629 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
SGCDQ92629 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
SGCDQ92629 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SGCDQ92629 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SGCDQ92629 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
SGCDQ92629 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SGCDQ92629 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SGCDQ92629 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SGCDQ92629 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SGCDQ92629 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SGCDQ92629 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SGCDQ92629 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SGCDQ92629 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SGCDQ92629 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SGCDQ92629 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SGCDQ92629 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SGCDQ92629 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SGCDQ92629 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SGCDQ92629 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SGCDQ92629 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SGCDQ92629 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SGCDQ92629 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SGCDQ92629 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SGCDQ92629 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
SGCDQ92629 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SGCDQ92629 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SGCDQ92629 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SGCDQ92629 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SGCDQ92629 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SGCDQ92629 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SGCDQ92629 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SGCDQ92629 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SGCDQ92629 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SGCDQ92629 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SGCDQ92629 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SGCDQ92629 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SGCDQ92629 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SGCDQ92629 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SGCDQ92629 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SGCDQ92629 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SGCDQ92629 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SGCDQ92629 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SGCDQ92629 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SGCDQ92629 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SGCDQ92629 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SGCDQ92629 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SGCDQ92629 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SGCDQ92629 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SGCDQ92629 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SGCDQ92629 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SGCDQ92629 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SGCDQ92629 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SGCDQ92629 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SGCDQ92629 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
SGCDQ92629 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SGCDQ92629 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SGCDQ92629 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SGCDQ92629 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SGCDQ92629 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SGCDQ92629 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SGCDQ92629 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SGCDQ92629 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SGCDQ92629 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SGCDQ92629 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SGCDQ92629 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SGCDQ92629 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SGCDQ92629 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SGCDQ92629 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SGCDQ92629 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SGCDQ92629 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SGCDQ92629 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SGCDQ92629 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SGCDQ92629 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
SGCDQ92629 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SGCDQ92629 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SGCDQ92629 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SGCDQ92629 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SGCDQ92629 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SGCDQ92629 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SGCDQ92629 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SGCDQ92629 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SGCDQ92629 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SGCDQ92629 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SGCDQ92629 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SGCDQ92629 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SGCDQ92629 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SGCDQ92629 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SGCDQ92629 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SGCDQ92629 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.9 ms