Protein–RNA interactions for Protein: Q92623

TTC9, Tetratricopeptide repeat protein 9A, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC9Q92623 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TTC9Q92623 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TTC9Q92623 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TTC9Q92623 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TTC9Q92623 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TTC9Q92623 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TTC9Q92623 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TTC9Q92623 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TTC9Q92623 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TTC9Q92623 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TTC9Q92623 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TTC9Q92623 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TTC9Q92623 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TTC9Q92623 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TTC9Q92623 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TTC9Q92623 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TTC9Q92623 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TTC9Q92623 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TTC9Q92623 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TTC9Q92623 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TTC9Q92623 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TTC9Q92623 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TTC9Q92623 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TTC9Q92623 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TTC9Q92623 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TTC9Q92623 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
TTC9Q92623 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TTC9Q92623 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.54
TTC9Q92623 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TTC9Q92623 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TTC9Q92623 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
TTC9Q92623 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TTC9Q92623 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
TTC9Q92623 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TTC9Q92623 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TTC9Q92623 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TTC9Q92623 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TTC9Q92623 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TTC9Q92623 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TTC9Q92623 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
TTC9Q92623 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
TTC9Q92623 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
TTC9Q92623 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
TTC9Q92623 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TTC9Q92623 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TTC9Q92623 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TTC9Q92623 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TTC9Q92623 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TTC9Q92623 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TTC9Q92623 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TTC9Q92623 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TTC9Q92623 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TTC9Q92623 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TTC9Q92623 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TTC9Q92623 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TTC9Q92623 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TTC9Q92623 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TTC9Q92623 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
TTC9Q92623 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TTC9Q92623 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TTC9Q92623 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TTC9Q92623 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TTC9Q92623 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TTC9Q92623 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TTC9Q92623 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
TTC9Q92623 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TTC9Q92623 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TTC9Q92623 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TTC9Q92623 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TTC9Q92623 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TTC9Q92623 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TTC9Q92623 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TTC9Q92623 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TTC9Q92623 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TTC9Q92623 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TTC9Q92623 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TTC9Q92623 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TTC9Q92623 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TTC9Q92623 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TTC9Q92623 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TTC9Q92623 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TTC9Q92623 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TTC9Q92623 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TTC9Q92623 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TTC9Q92623 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TTC9Q92623 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TTC9Q92623 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TTC9Q92623 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TTC9Q92623 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TTC9Q92623 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TTC9Q92623 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TTC9Q92623 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TTC9Q92623 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TTC9Q92623 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TTC9Q92623 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TTC9Q92623 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TTC9Q92623 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TTC9Q92623 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TTC9Q92623 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TTC9Q92623 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.1 ms