Protein–RNA interactions for Protein: Q92543

SNX19, Sorting nexin-19, humanhuman

Predictions only

Length 992 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX19Q92543 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
SNX19Q92543 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SNX19Q92543 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
SNX19Q92543 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
SNX19Q92543 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
SNX19Q92543 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
SNX19Q92543 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
SNX19Q92543 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
SNX19Q92543 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
SNX19Q92543 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
SNX19Q92543 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
SNX19Q92543 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
SNX19Q92543 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
SNX19Q92543 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
SNX19Q92543 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
SNX19Q92543 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SNX19Q92543 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SNX19Q92543 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
SNX19Q92543 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
SNX19Q92543 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SNX19Q92543 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SNX19Q92543 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
SNX19Q92543 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
SNX19Q92543 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC26.18■■□□□ 1.78
SNX19Q92543 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
SNX19Q92543 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
SNX19Q92543 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
SNX19Q92543 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SNX19Q92543 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
SNX19Q92543 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
SNX19Q92543 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
SNX19Q92543 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SNX19Q92543 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SNX19Q92543 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SNX19Q92543 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SNX19Q92543 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SNX19Q92543 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
SNX19Q92543 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
SNX19Q92543 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
SNX19Q92543 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
SNX19Q92543 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
SNX19Q92543 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
SNX19Q92543 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
SNX19Q92543 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SNX19Q92543 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
SNX19Q92543 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SNX19Q92543 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
SNX19Q92543 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
SNX19Q92543 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SNX19Q92543 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SNX19Q92543 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
SNX19Q92543 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SNX19Q92543 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
SNX19Q92543 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SNX19Q92543 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SNX19Q92543 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SNX19Q92543 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SNX19Q92543 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
SNX19Q92543 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
SNX19Q92543 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
SNX19Q92543 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SNX19Q92543 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SNX19Q92543 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SNX19Q92543 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SNX19Q92543 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SNX19Q92543 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SNX19Q92543 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
SNX19Q92543 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SNX19Q92543 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SNX19Q92543 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SNX19Q92543 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
SNX19Q92543 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
SNX19Q92543 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
SNX19Q92543 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
SNX19Q92543 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
SNX19Q92543 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
SNX19Q92543 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SNX19Q92543 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
SNX19Q92543 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SNX19Q92543 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
SNX19Q92543 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SNX19Q92543 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
SNX19Q92543 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SNX19Q92543 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
SNX19Q92543 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
SNX19Q92543 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SNX19Q92543 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SNX19Q92543 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SNX19Q92543 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SNX19Q92543 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SNX19Q92543 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SNX19Q92543 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SNX19Q92543 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SNX19Q92543 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SNX19Q92543 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SNX19Q92543 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SNX19Q92543 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SNX19Q92543 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.75
SNX19Q92543 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
SNX19Q92543 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.4 ms