Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXH6

RAB40A, Ras-related protein Rab-40A, humanhuman

Predictions only

Length 277 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB40AQ8WXH6 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RAB40AQ8WXH6 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RAB40AQ8WXH6 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RAB40AQ8WXH6 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RAB40AQ8WXH6 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RAB40AQ8WXH6 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RAB40AQ8WXH6 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RAB40AQ8WXH6 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RAB40AQ8WXH6 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RAB40AQ8WXH6 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RAB40AQ8WXH6 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RAB40AQ8WXH6 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RAB40AQ8WXH6 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RAB40AQ8WXH6 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
RAB40AQ8WXH6 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RAB40AQ8WXH6 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
RAB40AQ8WXH6 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RAB40AQ8WXH6 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
RAB40AQ8WXH6 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RAB40AQ8WXH6 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RAB40AQ8WXH6 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RAB40AQ8WXH6 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RAB40AQ8WXH6 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RAB40AQ8WXH6 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RAB40AQ8WXH6 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RAB40AQ8WXH6 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RAB40AQ8WXH6 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
RAB40AQ8WXH6 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
RAB40AQ8WXH6 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RAB40AQ8WXH6 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RAB40AQ8WXH6 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RAB40AQ8WXH6 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RAB40AQ8WXH6 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
RAB40AQ8WXH6 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RAB40AQ8WXH6 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RAB40AQ8WXH6 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RAB40AQ8WXH6 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RAB40AQ8WXH6 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RAB40AQ8WXH6 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RAB40AQ8WXH6 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RAB40AQ8WXH6 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RAB40AQ8WXH6 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
RAB40AQ8WXH6 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
RAB40AQ8WXH6 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RAB40AQ8WXH6 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RAB40AQ8WXH6 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RAB40AQ8WXH6 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RAB40AQ8WXH6 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RAB40AQ8WXH6 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RAB40AQ8WXH6 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RAB40AQ8WXH6 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RAB40AQ8WXH6 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RAB40AQ8WXH6 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RAB40AQ8WXH6 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RAB40AQ8WXH6 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RAB40AQ8WXH6 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RAB40AQ8WXH6 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RAB40AQ8WXH6 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RAB40AQ8WXH6 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RAB40AQ8WXH6 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RAB40AQ8WXH6 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
RAB40AQ8WXH6 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RAB40AQ8WXH6 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RAB40AQ8WXH6 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RAB40AQ8WXH6 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RAB40AQ8WXH6 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RAB40AQ8WXH6 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RAB40AQ8WXH6 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RAB40AQ8WXH6 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RAB40AQ8WXH6 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RAB40AQ8WXH6 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RAB40AQ8WXH6 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RAB40AQ8WXH6 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RAB40AQ8WXH6 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RAB40AQ8WXH6 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RAB40AQ8WXH6 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RAB40AQ8WXH6 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RAB40AQ8WXH6 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RAB40AQ8WXH6 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RAB40AQ8WXH6 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RAB40AQ8WXH6 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
RAB40AQ8WXH6 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RAB40AQ8WXH6 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
RAB40AQ8WXH6 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
RAB40AQ8WXH6 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
RAB40AQ8WXH6 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RAB40AQ8WXH6 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RAB40AQ8WXH6 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RAB40AQ8WXH6 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RAB40AQ8WXH6 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RAB40AQ8WXH6 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
RAB40AQ8WXH6 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RAB40AQ8WXH6 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RAB40AQ8WXH6 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
RAB40AQ8WXH6 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RAB40AQ8WXH6 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RAB40AQ8WXH6 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RAB40AQ8WXH6 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RAB40AQ8WXH6 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RAB40AQ8WXH6 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.2 ms