Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXC3

PYDC1, Pyrin domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 89 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PYDC1Q8WXC3 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PYDC1Q8WXC3 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PYDC1Q8WXC3 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PYDC1Q8WXC3 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PYDC1Q8WXC3 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
PYDC1Q8WXC3 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PYDC1Q8WXC3 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PYDC1Q8WXC3 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
PYDC1Q8WXC3 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PYDC1Q8WXC3 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PYDC1Q8WXC3 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PYDC1Q8WXC3 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PYDC1Q8WXC3 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PYDC1Q8WXC3 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PYDC1Q8WXC3 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PYDC1Q8WXC3 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PYDC1Q8WXC3 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PYDC1Q8WXC3 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PYDC1Q8WXC3 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PYDC1Q8WXC3 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PYDC1Q8WXC3 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PYDC1Q8WXC3 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PYDC1Q8WXC3 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
PYDC1Q8WXC3 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
PYDC1Q8WXC3 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PYDC1Q8WXC3 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PYDC1Q8WXC3 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PYDC1Q8WXC3 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PYDC1Q8WXC3 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PYDC1Q8WXC3 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PYDC1Q8WXC3 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PYDC1Q8WXC3 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PYDC1Q8WXC3 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PYDC1Q8WXC3 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PYDC1Q8WXC3 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PYDC1Q8WXC3 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PYDC1Q8WXC3 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PYDC1Q8WXC3 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PYDC1Q8WXC3 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PYDC1Q8WXC3 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PYDC1Q8WXC3 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PYDC1Q8WXC3 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PYDC1Q8WXC3 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PYDC1Q8WXC3 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
PYDC1Q8WXC3 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
PYDC1Q8WXC3 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PYDC1Q8WXC3 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PYDC1Q8WXC3 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PYDC1Q8WXC3 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PYDC1Q8WXC3 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PYDC1Q8WXC3 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PYDC1Q8WXC3 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PYDC1Q8WXC3 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PYDC1Q8WXC3 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PYDC1Q8WXC3 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PYDC1Q8WXC3 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PYDC1Q8WXC3 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PYDC1Q8WXC3 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PYDC1Q8WXC3 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PYDC1Q8WXC3 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PYDC1Q8WXC3 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PYDC1Q8WXC3 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PYDC1Q8WXC3 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PYDC1Q8WXC3 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PYDC1Q8WXC3 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PYDC1Q8WXC3 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PYDC1Q8WXC3 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PYDC1Q8WXC3 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PYDC1Q8WXC3 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PYDC1Q8WXC3 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PYDC1Q8WXC3 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PYDC1Q8WXC3 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PYDC1Q8WXC3 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PYDC1Q8WXC3 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PYDC1Q8WXC3 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PYDC1Q8WXC3 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PYDC1Q8WXC3 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PYDC1Q8WXC3 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PYDC1Q8WXC3 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PYDC1Q8WXC3 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PYDC1Q8WXC3 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PYDC1Q8WXC3 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PYDC1Q8WXC3 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PYDC1Q8WXC3 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PYDC1Q8WXC3 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PYDC1Q8WXC3 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PYDC1Q8WXC3 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PYDC1Q8WXC3 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PYDC1Q8WXC3 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PYDC1Q8WXC3 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PYDC1Q8WXC3 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PYDC1Q8WXC3 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PYDC1Q8WXC3 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PYDC1Q8WXC3 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PYDC1Q8WXC3 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PYDC1Q8WXC3 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PYDC1Q8WXC3 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PYDC1Q8WXC3 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PYDC1Q8WXC3 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PYDC1Q8WXC3 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.1 ms