Protein–RNA interactions for Protein: Q8WVP5

TNFAIP8L1, Tumor necrosis factor alpha-induced protein 8-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 186 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFAIP8L1Q8WVP5 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TNFAIP8L1Q8WVP5 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TNFAIP8L1Q8WVP5 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TNFAIP8L1Q8WVP5 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TNFAIP8L1Q8WVP5 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TNFAIP8L1Q8WVP5 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
TNFAIP8L1Q8WVP5 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TNFAIP8L1Q8WVP5 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TNFAIP8L1Q8WVP5 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TNFAIP8L1Q8WVP5 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TNFAIP8L1Q8WVP5 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TNFAIP8L1Q8WVP5 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TNFAIP8L1Q8WVP5 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TNFAIP8L1Q8WVP5 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TNFAIP8L1Q8WVP5 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TNFAIP8L1Q8WVP5 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TNFAIP8L1Q8WVP5 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TNFAIP8L1Q8WVP5 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TNFAIP8L1Q8WVP5 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TNFAIP8L1Q8WVP5 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TNFAIP8L1Q8WVP5 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TNFAIP8L1Q8WVP5 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TNFAIP8L1Q8WVP5 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TNFAIP8L1Q8WVP5 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TNFAIP8L1Q8WVP5 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TNFAIP8L1Q8WVP5 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TNFAIP8L1Q8WVP5 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TNFAIP8L1Q8WVP5 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TNFAIP8L1Q8WVP5 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TNFAIP8L1Q8WVP5 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TNFAIP8L1Q8WVP5 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TNFAIP8L1Q8WVP5 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TNFAIP8L1Q8WVP5 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
TNFAIP8L1Q8WVP5 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TNFAIP8L1Q8WVP5 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TNFAIP8L1Q8WVP5 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TNFAIP8L1Q8WVP5 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TNFAIP8L1Q8WVP5 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
TNFAIP8L1Q8WVP5 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TNFAIP8L1Q8WVP5 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TNFAIP8L1Q8WVP5 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TNFAIP8L1Q8WVP5 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TNFAIP8L1Q8WVP5 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TNFAIP8L1Q8WVP5 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TNFAIP8L1Q8WVP5 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TNFAIP8L1Q8WVP5 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TNFAIP8L1Q8WVP5 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TNFAIP8L1Q8WVP5 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TNFAIP8L1Q8WVP5 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TNFAIP8L1Q8WVP5 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TNFAIP8L1Q8WVP5 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TNFAIP8L1Q8WVP5 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TNFAIP8L1Q8WVP5 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TNFAIP8L1Q8WVP5 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TNFAIP8L1Q8WVP5 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
TNFAIP8L1Q8WVP5 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TNFAIP8L1Q8WVP5 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TNFAIP8L1Q8WVP5 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TNFAIP8L1Q8WVP5 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TNFAIP8L1Q8WVP5 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TNFAIP8L1Q8WVP5 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TNFAIP8L1Q8WVP5 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TNFAIP8L1Q8WVP5 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TNFAIP8L1Q8WVP5 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TNFAIP8L1Q8WVP5 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TNFAIP8L1Q8WVP5 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TNFAIP8L1Q8WVP5 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TNFAIP8L1Q8WVP5 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TNFAIP8L1Q8WVP5 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
TNFAIP8L1Q8WVP5 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TNFAIP8L1Q8WVP5 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TNFAIP8L1Q8WVP5 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TNFAIP8L1Q8WVP5 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TNFAIP8L1Q8WVP5 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TNFAIP8L1Q8WVP5 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TNFAIP8L1Q8WVP5 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TNFAIP8L1Q8WVP5 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TNFAIP8L1Q8WVP5 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TNFAIP8L1Q8WVP5 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TNFAIP8L1Q8WVP5 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TNFAIP8L1Q8WVP5 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TNFAIP8L1Q8WVP5 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TNFAIP8L1Q8WVP5 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TNFAIP8L1Q8WVP5 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
TNFAIP8L1Q8WVP5 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TNFAIP8L1Q8WVP5 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TNFAIP8L1Q8WVP5 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TNFAIP8L1Q8WVP5 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TNFAIP8L1Q8WVP5 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TNFAIP8L1Q8WVP5 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TNFAIP8L1Q8WVP5 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TNFAIP8L1Q8WVP5 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TNFAIP8L1Q8WVP5 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TNFAIP8L1Q8WVP5 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TNFAIP8L1Q8WVP5 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TNFAIP8L1Q8WVP5 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TNFAIP8L1Q8WVP5 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TNFAIP8L1Q8WVP5 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TNFAIP8L1Q8WVP5 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TNFAIP8L1Q8WVP5 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 7.5 ms