Protein–RNA interactions for Protein: Q8NI29

FBXO27, F-box only protein 27, humanhuman

Predictions only

Length 283 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXO27Q8NI29 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
FBXO27Q8NI29 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
FBXO27Q8NI29 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
FBXO27Q8NI29 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
FBXO27Q8NI29 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
FBXO27Q8NI29 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
FBXO27Q8NI29 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.61
FBXO27Q8NI29 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
FBXO27Q8NI29 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
FBXO27Q8NI29 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
FBXO27Q8NI29 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
FBXO27Q8NI29 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
FBXO27Q8NI29 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
FBXO27Q8NI29 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
FBXO27Q8NI29 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
FBXO27Q8NI29 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
FBXO27Q8NI29 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
FBXO27Q8NI29 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
FBXO27Q8NI29 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
FBXO27Q8NI29 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
FBXO27Q8NI29 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
FBXO27Q8NI29 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
FBXO27Q8NI29 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
FBXO27Q8NI29 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
FBXO27Q8NI29 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
FBXO27Q8NI29 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
FBXO27Q8NI29 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
FBXO27Q8NI29 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
FBXO27Q8NI29 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
FBXO27Q8NI29 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
FBXO27Q8NI29 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
FBXO27Q8NI29 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
FBXO27Q8NI29 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
FBXO27Q8NI29 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
FBXO27Q8NI29 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
FBXO27Q8NI29 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
FBXO27Q8NI29 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
FBXO27Q8NI29 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
FBXO27Q8NI29 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
FBXO27Q8NI29 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
FBXO27Q8NI29 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
FBXO27Q8NI29 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
FBXO27Q8NI29 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
FBXO27Q8NI29 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
FBXO27Q8NI29 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
FBXO27Q8NI29 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
FBXO27Q8NI29 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC25■■□□□ 1.59
FBXO27Q8NI29 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
FBXO27Q8NI29 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
FBXO27Q8NI29 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
FBXO27Q8NI29 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
FBXO27Q8NI29 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
FBXO27Q8NI29 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
FBXO27Q8NI29 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
FBXO27Q8NI29 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
FBXO27Q8NI29 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
FBXO27Q8NI29 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
FBXO27Q8NI29 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
FBXO27Q8NI29 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
FBXO27Q8NI29 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
FBXO27Q8NI29 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
FBXO27Q8NI29 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
FBXO27Q8NI29 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
FBXO27Q8NI29 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
FBXO27Q8NI29 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
FBXO27Q8NI29 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
FBXO27Q8NI29 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
FBXO27Q8NI29 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.58
FBXO27Q8NI29 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
FBXO27Q8NI29 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
FBXO27Q8NI29 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
FBXO27Q8NI29 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
FBXO27Q8NI29 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
FBXO27Q8NI29 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
FBXO27Q8NI29 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
FBXO27Q8NI29 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
FBXO27Q8NI29 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
FBXO27Q8NI29 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
FBXO27Q8NI29 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
FBXO27Q8NI29 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
FBXO27Q8NI29 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
FBXO27Q8NI29 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
FBXO27Q8NI29 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
FBXO27Q8NI29 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
FBXO27Q8NI29 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
FBXO27Q8NI29 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC24.92■■□□□ 1.58
FBXO27Q8NI29 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
FBXO27Q8NI29 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
FBXO27Q8NI29 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
FBXO27Q8NI29 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
FBXO27Q8NI29 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
FBXO27Q8NI29 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
FBXO27Q8NI29 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
FBXO27Q8NI29 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
FBXO27Q8NI29 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
FBXO27Q8NI29 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
FBXO27Q8NI29 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
FBXO27Q8NI29 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC24.89■■□□□ 1.57
FBXO27Q8NI29 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
FBXO27Q8NI29 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms