Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFZ8

CADM4, Cell adhesion molecule 4, humanhuman

Predictions only

Length 388 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CADM4Q8NFZ8 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CADM4Q8NFZ8 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CADM4Q8NFZ8 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CADM4Q8NFZ8 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CADM4Q8NFZ8 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CADM4Q8NFZ8 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CADM4Q8NFZ8 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CADM4Q8NFZ8 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CADM4Q8NFZ8 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CADM4Q8NFZ8 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CADM4Q8NFZ8 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CADM4Q8NFZ8 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
CADM4Q8NFZ8 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CADM4Q8NFZ8 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CADM4Q8NFZ8 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CADM4Q8NFZ8 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CADM4Q8NFZ8 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CADM4Q8NFZ8 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
CADM4Q8NFZ8 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CADM4Q8NFZ8 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CADM4Q8NFZ8 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
CADM4Q8NFZ8 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CADM4Q8NFZ8 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CADM4Q8NFZ8 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CADM4Q8NFZ8 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CADM4Q8NFZ8 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CADM4Q8NFZ8 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CADM4Q8NFZ8 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CADM4Q8NFZ8 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CADM4Q8NFZ8 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CADM4Q8NFZ8 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CADM4Q8NFZ8 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
CADM4Q8NFZ8 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
CADM4Q8NFZ8 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CADM4Q8NFZ8 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CADM4Q8NFZ8 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CADM4Q8NFZ8 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CADM4Q8NFZ8 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CADM4Q8NFZ8 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CADM4Q8NFZ8 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
CADM4Q8NFZ8 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CADM4Q8NFZ8 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CADM4Q8NFZ8 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
CADM4Q8NFZ8 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CADM4Q8NFZ8 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CADM4Q8NFZ8 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CADM4Q8NFZ8 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CADM4Q8NFZ8 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CADM4Q8NFZ8 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
CADM4Q8NFZ8 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CADM4Q8NFZ8 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CADM4Q8NFZ8 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CADM4Q8NFZ8 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CADM4Q8NFZ8 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CADM4Q8NFZ8 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CADM4Q8NFZ8 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CADM4Q8NFZ8 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CADM4Q8NFZ8 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
CADM4Q8NFZ8 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CADM4Q8NFZ8 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CADM4Q8NFZ8 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CADM4Q8NFZ8 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CADM4Q8NFZ8 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CADM4Q8NFZ8 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
CADM4Q8NFZ8 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
CADM4Q8NFZ8 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CADM4Q8NFZ8 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CADM4Q8NFZ8 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CADM4Q8NFZ8 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CADM4Q8NFZ8 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CADM4Q8NFZ8 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CADM4Q8NFZ8 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CADM4Q8NFZ8 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CADM4Q8NFZ8 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CADM4Q8NFZ8 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CADM4Q8NFZ8 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
CADM4Q8NFZ8 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CADM4Q8NFZ8 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CADM4Q8NFZ8 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CADM4Q8NFZ8 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CADM4Q8NFZ8 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CADM4Q8NFZ8 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CADM4Q8NFZ8 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
CADM4Q8NFZ8 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CADM4Q8NFZ8 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CADM4Q8NFZ8 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CADM4Q8NFZ8 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CADM4Q8NFZ8 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CADM4Q8NFZ8 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CADM4Q8NFZ8 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CADM4Q8NFZ8 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CADM4Q8NFZ8 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CADM4Q8NFZ8 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CADM4Q8NFZ8 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
CADM4Q8NFZ8 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CADM4Q8NFZ8 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CADM4Q8NFZ8 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CADM4Q8NFZ8 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC25.7■■□□□ 1.71
CADM4Q8NFZ8 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CADM4Q8NFZ8 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.9 ms