Protein–RNA interactions for Protein: Q8NE63

HIPK4, Homeodomain-interacting protein kinase 4, humanhuman

Predictions only

Length 616 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIPK4Q8NE63 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
HIPK4Q8NE63 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
HIPK4Q8NE63 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
HIPK4Q8NE63 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
HIPK4Q8NE63 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
HIPK4Q8NE63 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
HIPK4Q8NE63 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
HIPK4Q8NE63 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
HIPK4Q8NE63 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
HIPK4Q8NE63 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
HIPK4Q8NE63 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
HIPK4Q8NE63 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
HIPK4Q8NE63 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
HIPK4Q8NE63 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
HIPK4Q8NE63 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
HIPK4Q8NE63 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
HIPK4Q8NE63 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
HIPK4Q8NE63 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
HIPK4Q8NE63 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
HIPK4Q8NE63 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
HIPK4Q8NE63 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
HIPK4Q8NE63 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
HIPK4Q8NE63 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
HIPK4Q8NE63 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
HIPK4Q8NE63 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
HIPK4Q8NE63 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
HIPK4Q8NE63 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
HIPK4Q8NE63 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
HIPK4Q8NE63 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
HIPK4Q8NE63 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
HIPK4Q8NE63 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
HIPK4Q8NE63 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
HIPK4Q8NE63 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
HIPK4Q8NE63 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
HIPK4Q8NE63 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
HIPK4Q8NE63 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
HIPK4Q8NE63 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
HIPK4Q8NE63 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
HIPK4Q8NE63 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
HIPK4Q8NE63 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
HIPK4Q8NE63 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
HIPK4Q8NE63 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
HIPK4Q8NE63 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
HIPK4Q8NE63 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
HIPK4Q8NE63 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
HIPK4Q8NE63 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
HIPK4Q8NE63 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
HIPK4Q8NE63 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
HIPK4Q8NE63 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
HIPK4Q8NE63 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
HIPK4Q8NE63 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
HIPK4Q8NE63 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
HIPK4Q8NE63 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
HIPK4Q8NE63 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
HIPK4Q8NE63 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
HIPK4Q8NE63 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
HIPK4Q8NE63 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
HIPK4Q8NE63 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
HIPK4Q8NE63 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
HIPK4Q8NE63 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
HIPK4Q8NE63 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
HIPK4Q8NE63 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
HIPK4Q8NE63 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
HIPK4Q8NE63 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
HIPK4Q8NE63 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
HIPK4Q8NE63 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
HIPK4Q8NE63 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
HIPK4Q8NE63 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
HIPK4Q8NE63 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
HIPK4Q8NE63 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
HIPK4Q8NE63 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
HIPK4Q8NE63 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
HIPK4Q8NE63 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
HIPK4Q8NE63 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
HIPK4Q8NE63 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
HIPK4Q8NE63 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
HIPK4Q8NE63 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
HIPK4Q8NE63 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
HIPK4Q8NE63 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
HIPK4Q8NE63 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
HIPK4Q8NE63 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
HIPK4Q8NE63 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
HIPK4Q8NE63 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
HIPK4Q8NE63 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
HIPK4Q8NE63 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
HIPK4Q8NE63 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
HIPK4Q8NE63 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
HIPK4Q8NE63 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
HIPK4Q8NE63 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
HIPK4Q8NE63 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
HIPK4Q8NE63 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
HIPK4Q8NE63 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
HIPK4Q8NE63 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
HIPK4Q8NE63 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
HIPK4Q8NE63 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
HIPK4Q8NE63 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
HIPK4Q8NE63 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
HIPK4Q8NE63 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
HIPK4Q8NE63 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
HIPK4Q8NE63 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.1 ms