Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCU1

CCDC197, Putative uncharacterized protein CCDC197, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC197Q8NCU1 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CCDC197Q8NCU1 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CCDC197Q8NCU1 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CCDC197Q8NCU1 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CCDC197Q8NCU1 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CCDC197Q8NCU1 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CCDC197Q8NCU1 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CCDC197Q8NCU1 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CCDC197Q8NCU1 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CCDC197Q8NCU1 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CCDC197Q8NCU1 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CCDC197Q8NCU1 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CCDC197Q8NCU1 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CCDC197Q8NCU1 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CCDC197Q8NCU1 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CCDC197Q8NCU1 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CCDC197Q8NCU1 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CCDC197Q8NCU1 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CCDC197Q8NCU1 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CCDC197Q8NCU1 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CCDC197Q8NCU1 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CCDC197Q8NCU1 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CCDC197Q8NCU1 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CCDC197Q8NCU1 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CCDC197Q8NCU1 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CCDC197Q8NCU1 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CCDC197Q8NCU1 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CCDC197Q8NCU1 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CCDC197Q8NCU1 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CCDC197Q8NCU1 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CCDC197Q8NCU1 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CCDC197Q8NCU1 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CCDC197Q8NCU1 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CCDC197Q8NCU1 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CCDC197Q8NCU1 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CCDC197Q8NCU1 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CCDC197Q8NCU1 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CCDC197Q8NCU1 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CCDC197Q8NCU1 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CCDC197Q8NCU1 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CCDC197Q8NCU1 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CCDC197Q8NCU1 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CCDC197Q8NCU1 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CCDC197Q8NCU1 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CCDC197Q8NCU1 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CCDC197Q8NCU1 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CCDC197Q8NCU1 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CCDC197Q8NCU1 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CCDC197Q8NCU1 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CCDC197Q8NCU1 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CCDC197Q8NCU1 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CCDC197Q8NCU1 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CCDC197Q8NCU1 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CCDC197Q8NCU1 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CCDC197Q8NCU1 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
CCDC197Q8NCU1 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
CCDC197Q8NCU1 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CCDC197Q8NCU1 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CCDC197Q8NCU1 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CCDC197Q8NCU1 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CCDC197Q8NCU1 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CCDC197Q8NCU1 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CCDC197Q8NCU1 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CCDC197Q8NCU1 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CCDC197Q8NCU1 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CCDC197Q8NCU1 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CCDC197Q8NCU1 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CCDC197Q8NCU1 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.68
CCDC197Q8NCU1 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CCDC197Q8NCU1 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CCDC197Q8NCU1 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CCDC197Q8NCU1 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CCDC197Q8NCU1 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CCDC197Q8NCU1 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CCDC197Q8NCU1 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CCDC197Q8NCU1 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CCDC197Q8NCU1 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CCDC197Q8NCU1 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CCDC197Q8NCU1 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CCDC197Q8NCU1 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CCDC197Q8NCU1 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CCDC197Q8NCU1 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CCDC197Q8NCU1 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CCDC197Q8NCU1 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CCDC197Q8NCU1 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CCDC197Q8NCU1 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CCDC197Q8NCU1 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CCDC197Q8NCU1 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CCDC197Q8NCU1 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CCDC197Q8NCU1 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CCDC197Q8NCU1 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CCDC197Q8NCU1 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CCDC197Q8NCU1 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CCDC197Q8NCU1 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CCDC197Q8NCU1 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CCDC197Q8NCU1 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CCDC197Q8NCU1 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CCDC197Q8NCU1 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CCDC197Q8NCU1 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CCDC197Q8NCU1 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.4 ms