Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCB2

CAMKV, CaM kinase-like vesicle-associated protein, humanhuman

Predictions only

Length 501 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAMKVQ8NCB2 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CAMKVQ8NCB2 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CAMKVQ8NCB2 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CAMKVQ8NCB2 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CAMKVQ8NCB2 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CAMKVQ8NCB2 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CAMKVQ8NCB2 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CAMKVQ8NCB2 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CAMKVQ8NCB2 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CAMKVQ8NCB2 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CAMKVQ8NCB2 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CAMKVQ8NCB2 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CAMKVQ8NCB2 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CAMKVQ8NCB2 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CAMKVQ8NCB2 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CAMKVQ8NCB2 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CAMKVQ8NCB2 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CAMKVQ8NCB2 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CAMKVQ8NCB2 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CAMKVQ8NCB2 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CAMKVQ8NCB2 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CAMKVQ8NCB2 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CAMKVQ8NCB2 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CAMKVQ8NCB2 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CAMKVQ8NCB2 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CAMKVQ8NCB2 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
CAMKVQ8NCB2 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CAMKVQ8NCB2 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
CAMKVQ8NCB2 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CAMKVQ8NCB2 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CAMKVQ8NCB2 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CAMKVQ8NCB2 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CAMKVQ8NCB2 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CAMKVQ8NCB2 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CAMKVQ8NCB2 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CAMKVQ8NCB2 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CAMKVQ8NCB2 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CAMKVQ8NCB2 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CAMKVQ8NCB2 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CAMKVQ8NCB2 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CAMKVQ8NCB2 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
CAMKVQ8NCB2 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CAMKVQ8NCB2 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CAMKVQ8NCB2 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CAMKVQ8NCB2 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CAMKVQ8NCB2 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CAMKVQ8NCB2 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CAMKVQ8NCB2 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CAMKVQ8NCB2 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CAMKVQ8NCB2 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CAMKVQ8NCB2 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CAMKVQ8NCB2 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CAMKVQ8NCB2 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CAMKVQ8NCB2 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
CAMKVQ8NCB2 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CAMKVQ8NCB2 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CAMKVQ8NCB2 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CAMKVQ8NCB2 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CAMKVQ8NCB2 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
CAMKVQ8NCB2 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
CAMKVQ8NCB2 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CAMKVQ8NCB2 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CAMKVQ8NCB2 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CAMKVQ8NCB2 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CAMKVQ8NCB2 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CAMKVQ8NCB2 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CAMKVQ8NCB2 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CAMKVQ8NCB2 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
CAMKVQ8NCB2 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CAMKVQ8NCB2 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CAMKVQ8NCB2 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CAMKVQ8NCB2 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CAMKVQ8NCB2 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
CAMKVQ8NCB2 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CAMKVQ8NCB2 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CAMKVQ8NCB2 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CAMKVQ8NCB2 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CAMKVQ8NCB2 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CAMKVQ8NCB2 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
CAMKVQ8NCB2 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
CAMKVQ8NCB2 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
CAMKVQ8NCB2 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CAMKVQ8NCB2 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CAMKVQ8NCB2 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CAMKVQ8NCB2 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CAMKVQ8NCB2 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CAMKVQ8NCB2 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CAMKVQ8NCB2 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CAMKVQ8NCB2 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CAMKVQ8NCB2 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CAMKVQ8NCB2 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CAMKVQ8NCB2 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CAMKVQ8NCB2 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
CAMKVQ8NCB2 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
CAMKVQ8NCB2 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CAMKVQ8NCB2 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CAMKVQ8NCB2 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CAMKVQ8NCB2 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CAMKVQ8NCB2 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CAMKVQ8NCB2 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.8 ms