Protein–RNA interactions for Protein: Q8N8D7

NKAIN3, Sodium/potassium-transporting ATPase subunit beta-1-interacting protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 197 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKAIN3Q8N8D7 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NKAIN3Q8N8D7 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
NKAIN3Q8N8D7 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
NKAIN3Q8N8D7 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NKAIN3Q8N8D7 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
NKAIN3Q8N8D7 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
NKAIN3Q8N8D7 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
NKAIN3Q8N8D7 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NKAIN3Q8N8D7 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NKAIN3Q8N8D7 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NKAIN3Q8N8D7 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NKAIN3Q8N8D7 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NKAIN3Q8N8D7 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NKAIN3Q8N8D7 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NKAIN3Q8N8D7 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NKAIN3Q8N8D7 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NKAIN3Q8N8D7 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NKAIN3Q8N8D7 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NKAIN3Q8N8D7 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
NKAIN3Q8N8D7 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NKAIN3Q8N8D7 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NKAIN3Q8N8D7 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NKAIN3Q8N8D7 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NKAIN3Q8N8D7 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NKAIN3Q8N8D7 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NKAIN3Q8N8D7 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NKAIN3Q8N8D7 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NKAIN3Q8N8D7 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NKAIN3Q8N8D7 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NKAIN3Q8N8D7 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NKAIN3Q8N8D7 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NKAIN3Q8N8D7 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NKAIN3Q8N8D7 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NKAIN3Q8N8D7 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NKAIN3Q8N8D7 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
NKAIN3Q8N8D7 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
NKAIN3Q8N8D7 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
NKAIN3Q8N8D7 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
NKAIN3Q8N8D7 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC22.27■■□□□ 1.16
NKAIN3Q8N8D7 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
NKAIN3Q8N8D7 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NKAIN3Q8N8D7 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NKAIN3Q8N8D7 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NKAIN3Q8N8D7 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NKAIN3Q8N8D7 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NKAIN3Q8N8D7 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NKAIN3Q8N8D7 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NKAIN3Q8N8D7 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NKAIN3Q8N8D7 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NKAIN3Q8N8D7 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NKAIN3Q8N8D7 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NKAIN3Q8N8D7 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NKAIN3Q8N8D7 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NKAIN3Q8N8D7 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NKAIN3Q8N8D7 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NKAIN3Q8N8D7 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NKAIN3Q8N8D7 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NKAIN3Q8N8D7 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NKAIN3Q8N8D7 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NKAIN3Q8N8D7 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NKAIN3Q8N8D7 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NKAIN3Q8N8D7 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NKAIN3Q8N8D7 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NKAIN3Q8N8D7 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NKAIN3Q8N8D7 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NKAIN3Q8N8D7 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NKAIN3Q8N8D7 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NKAIN3Q8N8D7 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NKAIN3Q8N8D7 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NKAIN3Q8N8D7 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NKAIN3Q8N8D7 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NKAIN3Q8N8D7 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NKAIN3Q8N8D7 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NKAIN3Q8N8D7 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NKAIN3Q8N8D7 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NKAIN3Q8N8D7 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NKAIN3Q8N8D7 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NKAIN3Q8N8D7 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NKAIN3Q8N8D7 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NKAIN3Q8N8D7 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NKAIN3Q8N8D7 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NKAIN3Q8N8D7 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
NKAIN3Q8N8D7 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NKAIN3Q8N8D7 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NKAIN3Q8N8D7 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NKAIN3Q8N8D7 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NKAIN3Q8N8D7 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
NKAIN3Q8N8D7 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
NKAIN3Q8N8D7 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NKAIN3Q8N8D7 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NKAIN3Q8N8D7 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NKAIN3Q8N8D7 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NKAIN3Q8N8D7 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NKAIN3Q8N8D7 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NKAIN3Q8N8D7 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NKAIN3Q8N8D7 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NKAIN3Q8N8D7 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NKAIN3Q8N8D7 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NKAIN3Q8N8D7 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
NKAIN3Q8N8D7 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 84.4 ms