Protein–RNA interactions for Protein: Q8N1N4

KRT78, Keratin, type II cytoskeletal 78, humanhuman

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Length 520 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT78Q8N1N4 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
KRT78Q8N1N4 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
KRT78Q8N1N4 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
KRT78Q8N1N4 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
KRT78Q8N1N4 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
KRT78Q8N1N4 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
KRT78Q8N1N4 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
KRT78Q8N1N4 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
KRT78Q8N1N4 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
KRT78Q8N1N4 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
KRT78Q8N1N4 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
KRT78Q8N1N4 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
KRT78Q8N1N4 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
KRT78Q8N1N4 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
KRT78Q8N1N4 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
KRT78Q8N1N4 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
KRT78Q8N1N4 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
KRT78Q8N1N4 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
KRT78Q8N1N4 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
KRT78Q8N1N4 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
KRT78Q8N1N4 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
KRT78Q8N1N4 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
KRT78Q8N1N4 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
KRT78Q8N1N4 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
KRT78Q8N1N4 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
KRT78Q8N1N4 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
KRT78Q8N1N4 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
KRT78Q8N1N4 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
KRT78Q8N1N4 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
KRT78Q8N1N4 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
KRT78Q8N1N4 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
KRT78Q8N1N4 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
KRT78Q8N1N4 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
KRT78Q8N1N4 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
KRT78Q8N1N4 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
KRT78Q8N1N4 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
KRT78Q8N1N4 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
KRT78Q8N1N4 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC24.89■■□□□ 1.57
KRT78Q8N1N4 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
KRT78Q8N1N4 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
KRT78Q8N1N4 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
KRT78Q8N1N4 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
KRT78Q8N1N4 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
KRT78Q8N1N4 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
KRT78Q8N1N4 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
KRT78Q8N1N4 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
KRT78Q8N1N4 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
KRT78Q8N1N4 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
KRT78Q8N1N4 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
KRT78Q8N1N4 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
KRT78Q8N1N4 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
KRT78Q8N1N4 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
KRT78Q8N1N4 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
KRT78Q8N1N4 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
KRT78Q8N1N4 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
KRT78Q8N1N4 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
KRT78Q8N1N4 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
KRT78Q8N1N4 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
KRT78Q8N1N4 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
KRT78Q8N1N4 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
KRT78Q8N1N4 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
KRT78Q8N1N4 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
KRT78Q8N1N4 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
KRT78Q8N1N4 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
KRT78Q8N1N4 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
KRT78Q8N1N4 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
KRT78Q8N1N4 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
KRT78Q8N1N4 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
KRT78Q8N1N4 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
KRT78Q8N1N4 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
KRT78Q8N1N4 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
KRT78Q8N1N4 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC24.77■■□□□ 1.56
KRT78Q8N1N4 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
KRT78Q8N1N4 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
KRT78Q8N1N4 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
KRT78Q8N1N4 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
KRT78Q8N1N4 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
KRT78Q8N1N4 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
KRT78Q8N1N4 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
KRT78Q8N1N4 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
KRT78Q8N1N4 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
KRT78Q8N1N4 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC24.74■■□□□ 1.55
KRT78Q8N1N4 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
KRT78Q8N1N4 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
KRT78Q8N1N4 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
KRT78Q8N1N4 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
KRT78Q8N1N4 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
KRT78Q8N1N4 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
KRT78Q8N1N4 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
KRT78Q8N1N4 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
KRT78Q8N1N4 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
KRT78Q8N1N4 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
KRT78Q8N1N4 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
KRT78Q8N1N4 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
KRT78Q8N1N4 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
KRT78Q8N1N4 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.54
KRT78Q8N1N4 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
KRT78Q8N1N4 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
KRT78Q8N1N4 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
KRT78Q8N1N4 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
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