Protein–RNA interactions for Protein: Q8N158

GPC2, Glypican-2, humanhuman

Predictions only

Length 579 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPC2Q8N158 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.87■■■□□ 2.69
GPC2Q8N158 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC31.87■■■□□ 2.69
GPC2Q8N158 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC31.87■■■□□ 2.69
GPC2Q8N158 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC31.86■■■□□ 2.69
GPC2Q8N158 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.86■■■□□ 2.69
GPC2Q8N158 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC31.85■■■□□ 2.69
GPC2Q8N158 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
GPC2Q8N158 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC31.85■■■□□ 2.69
GPC2Q8N158 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.85■■■□□ 2.69
GPC2Q8N158 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
GPC2Q8N158 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.83■■■□□ 2.69
GPC2Q8N158 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.81■■■□□ 2.68
GPC2Q8N158 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.8■■■□□ 2.68
GPC2Q8N158 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC31.8■■■□□ 2.68
GPC2Q8N158 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC31.79■■■□□ 2.68
GPC2Q8N158 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.78■■■□□ 2.68
GPC2Q8N158 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
GPC2Q8N158 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
GPC2Q8N158 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.77■■■□□ 2.68
GPC2Q8N158 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
GPC2Q8N158 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.77■■■□□ 2.68
GPC2Q8N158 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.68
GPC2Q8N158 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.67
GPC2Q8N158 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.67
GPC2Q8N158 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC31.76■■■□□ 2.67
GPC2Q8N158 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
GPC2Q8N158 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC31.75■■■□□ 2.67
GPC2Q8N158 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC31.75■■■□□ 2.67
GPC2Q8N158 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.74■■■□□ 2.67
GPC2Q8N158 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC31.74■■■□□ 2.67
GPC2Q8N158 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
GPC2Q8N158 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC31.73■■■□□ 2.67
GPC2Q8N158 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
GPC2Q8N158 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
GPC2Q8N158 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
GPC2Q8N158 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC31.72■■■□□ 2.67
GPC2Q8N158 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC31.72■■■□□ 2.67
GPC2Q8N158 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.72■■■□□ 2.67
GPC2Q8N158 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
GPC2Q8N158 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
GPC2Q8N158 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
GPC2Q8N158 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC31.71■■■□□ 2.67
GPC2Q8N158 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
GPC2Q8N158 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
GPC2Q8N158 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
GPC2Q8N158 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC31.7■■■□□ 2.67
GPC2Q8N158 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.67
GPC2Q8N158 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.66
GPC2Q8N158 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
GPC2Q8N158 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC31.67■■■□□ 2.66
GPC2Q8N158 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.67■■■□□ 2.66
GPC2Q8N158 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC31.67■■■□□ 2.66
GPC2Q8N158 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
GPC2Q8N158 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
GPC2Q8N158 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
GPC2Q8N158 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC31.65■■■□□ 2.66
GPC2Q8N158 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
GPC2Q8N158 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
GPC2Q8N158 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
GPC2Q8N158 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
GPC2Q8N158 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
GPC2Q8N158 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
GPC2Q8N158 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC31.63■■■□□ 2.65
GPC2Q8N158 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC31.63■■■□□ 2.65
GPC2Q8N158 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.62■■■□□ 2.65
GPC2Q8N158 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC31.62■■■□□ 2.65
GPC2Q8N158 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
GPC2Q8N158 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC31.61■■■□□ 2.65
GPC2Q8N158 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC31.6■■■□□ 2.65
GPC2Q8N158 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.59■■■□□ 2.65
GPC2Q8N158 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC31.59■■■□□ 2.65
GPC2Q8N158 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC31.58■■■□□ 2.65
GPC2Q8N158 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
GPC2Q8N158 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC31.57■■■□□ 2.64
GPC2Q8N158 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC31.56■■■□□ 2.64
GPC2Q8N158 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC31.56■■■□□ 2.64
GPC2Q8N158 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC31.56■■■□□ 2.64
GPC2Q8N158 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
GPC2Q8N158 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
GPC2Q8N158 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
GPC2Q8N158 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC31.53■■■□□ 2.64
GPC2Q8N158 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
GPC2Q8N158 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.63
GPC2Q8N158 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC31.51■■■□□ 2.63
GPC2Q8N158 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.63
GPC2Q8N158 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
GPC2Q8N158 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC31.5■■■□□ 2.63
GPC2Q8N158 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
GPC2Q8N158 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC31.49■■■□□ 2.63
GPC2Q8N158 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC31.49■■■□□ 2.63
GPC2Q8N158 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC31.49■■■□□ 2.63
GPC2Q8N158 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
GPC2Q8N158 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.48■■■□□ 2.63
GPC2Q8N158 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC31.48■■■□□ 2.63
GPC2Q8N158 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC31.48■■■□□ 2.63
GPC2Q8N158 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
GPC2Q8N158 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
GPC2Q8N158 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
GPC2Q8N158 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC31.46■■■□□ 2.63
GPC2Q8N158 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.2 ms