Protein–RNA interactions for Protein: Q8IZ96

CMTM1, CKLF-like MARVEL transmembrane domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 169 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CMTM1Q8IZ96 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CMTM1Q8IZ96 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CMTM1Q8IZ96 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CMTM1Q8IZ96 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CMTM1Q8IZ96 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CMTM1Q8IZ96 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CMTM1Q8IZ96 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CMTM1Q8IZ96 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CMTM1Q8IZ96 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CMTM1Q8IZ96 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CMTM1Q8IZ96 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CMTM1Q8IZ96 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CMTM1Q8IZ96 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CMTM1Q8IZ96 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CMTM1Q8IZ96 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CMTM1Q8IZ96 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CMTM1Q8IZ96 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CMTM1Q8IZ96 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CMTM1Q8IZ96 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CMTM1Q8IZ96 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CMTM1Q8IZ96 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CMTM1Q8IZ96 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CMTM1Q8IZ96 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CMTM1Q8IZ96 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CMTM1Q8IZ96 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
CMTM1Q8IZ96 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CMTM1Q8IZ96 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CMTM1Q8IZ96 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CMTM1Q8IZ96 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CMTM1Q8IZ96 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CMTM1Q8IZ96 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CMTM1Q8IZ96 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CMTM1Q8IZ96 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CMTM1Q8IZ96 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CMTM1Q8IZ96 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CMTM1Q8IZ96 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CMTM1Q8IZ96 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CMTM1Q8IZ96 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CMTM1Q8IZ96 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CMTM1Q8IZ96 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC21.32■■□□□ 1
CMTM1Q8IZ96 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CMTM1Q8IZ96 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CMTM1Q8IZ96 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CMTM1Q8IZ96 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CMTM1Q8IZ96 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CMTM1Q8IZ96 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CMTM1Q8IZ96 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CMTM1Q8IZ96 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CMTM1Q8IZ96 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CMTM1Q8IZ96 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CMTM1Q8IZ96 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CMTM1Q8IZ96 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CMTM1Q8IZ96 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
CMTM1Q8IZ96 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CMTM1Q8IZ96 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CMTM1Q8IZ96 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CMTM1Q8IZ96 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CMTM1Q8IZ96 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CMTM1Q8IZ96 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CMTM1Q8IZ96 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CMTM1Q8IZ96 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CMTM1Q8IZ96 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CMTM1Q8IZ96 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CMTM1Q8IZ96 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CMTM1Q8IZ96 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CMTM1Q8IZ96 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CMTM1Q8IZ96 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
CMTM1Q8IZ96 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CMTM1Q8IZ96 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CMTM1Q8IZ96 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
CMTM1Q8IZ96 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC21.27■■□□□ 1
CMTM1Q8IZ96 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
CMTM1Q8IZ96 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
CMTM1Q8IZ96 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CMTM1Q8IZ96 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CMTM1Q8IZ96 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CMTM1Q8IZ96 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CMTM1Q8IZ96 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CMTM1Q8IZ96 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CMTM1Q8IZ96 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CMTM1Q8IZ96 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CMTM1Q8IZ96 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CMTM1Q8IZ96 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CMTM1Q8IZ96 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CMTM1Q8IZ96 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CMTM1Q8IZ96 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CMTM1Q8IZ96 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CMTM1Q8IZ96 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CMTM1Q8IZ96 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CMTM1Q8IZ96 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CMTM1Q8IZ96 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CMTM1Q8IZ96 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CMTM1Q8IZ96 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CMTM1Q8IZ96 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CMTM1Q8IZ96 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CMTM1Q8IZ96 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CMTM1Q8IZ96 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CMTM1Q8IZ96 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CMTM1Q8IZ96 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CMTM1Q8IZ96 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.9 ms