Protein–RNA interactions for Protein: Q8IXW0

LMNTD2, Lamin tail domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 634 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMNTD2Q8IXW0 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
LMNTD2Q8IXW0 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
LMNTD2Q8IXW0 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
LMNTD2Q8IXW0 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
LMNTD2Q8IXW0 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
LMNTD2Q8IXW0 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
LMNTD2Q8IXW0 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
LMNTD2Q8IXW0 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
LMNTD2Q8IXW0 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
LMNTD2Q8IXW0 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
LMNTD2Q8IXW0 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
LMNTD2Q8IXW0 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
LMNTD2Q8IXW0 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
LMNTD2Q8IXW0 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
LMNTD2Q8IXW0 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
LMNTD2Q8IXW0 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
LMNTD2Q8IXW0 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
LMNTD2Q8IXW0 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
LMNTD2Q8IXW0 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
LMNTD2Q8IXW0 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
LMNTD2Q8IXW0 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
LMNTD2Q8IXW0 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
LMNTD2Q8IXW0 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
LMNTD2Q8IXW0 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
LMNTD2Q8IXW0 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
LMNTD2Q8IXW0 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
LMNTD2Q8IXW0 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
LMNTD2Q8IXW0 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
LMNTD2Q8IXW0 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
LMNTD2Q8IXW0 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
LMNTD2Q8IXW0 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
LMNTD2Q8IXW0 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
LMNTD2Q8IXW0 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
LMNTD2Q8IXW0 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
LMNTD2Q8IXW0 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
LMNTD2Q8IXW0 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
LMNTD2Q8IXW0 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
LMNTD2Q8IXW0 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
LMNTD2Q8IXW0 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
LMNTD2Q8IXW0 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
LMNTD2Q8IXW0 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
LMNTD2Q8IXW0 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
LMNTD2Q8IXW0 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
LMNTD2Q8IXW0 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
LMNTD2Q8IXW0 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
LMNTD2Q8IXW0 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
LMNTD2Q8IXW0 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
LMNTD2Q8IXW0 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
LMNTD2Q8IXW0 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
LMNTD2Q8IXW0 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
LMNTD2Q8IXW0 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
LMNTD2Q8IXW0 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
LMNTD2Q8IXW0 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
LMNTD2Q8IXW0 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
LMNTD2Q8IXW0 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
LMNTD2Q8IXW0 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
LMNTD2Q8IXW0 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
LMNTD2Q8IXW0 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
LMNTD2Q8IXW0 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
LMNTD2Q8IXW0 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
LMNTD2Q8IXW0 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
LMNTD2Q8IXW0 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
LMNTD2Q8IXW0 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
LMNTD2Q8IXW0 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
LMNTD2Q8IXW0 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
LMNTD2Q8IXW0 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
LMNTD2Q8IXW0 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
LMNTD2Q8IXW0 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
LMNTD2Q8IXW0 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
LMNTD2Q8IXW0 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
LMNTD2Q8IXW0 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
LMNTD2Q8IXW0 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
LMNTD2Q8IXW0 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
LMNTD2Q8IXW0 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
LMNTD2Q8IXW0 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
LMNTD2Q8IXW0 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
LMNTD2Q8IXW0 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC25.87■■□□□ 1.73
LMNTD2Q8IXW0 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
LMNTD2Q8IXW0 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
LMNTD2Q8IXW0 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
LMNTD2Q8IXW0 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
LMNTD2Q8IXW0 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
LMNTD2Q8IXW0 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
LMNTD2Q8IXW0 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
LMNTD2Q8IXW0 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
LMNTD2Q8IXW0 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
LMNTD2Q8IXW0 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
LMNTD2Q8IXW0 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
LMNTD2Q8IXW0 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
LMNTD2Q8IXW0 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
LMNTD2Q8IXW0 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
LMNTD2Q8IXW0 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
LMNTD2Q8IXW0 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
LMNTD2Q8IXW0 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
LMNTD2Q8IXW0 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
LMNTD2Q8IXW0 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
LMNTD2Q8IXW0 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
LMNTD2Q8IXW0 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
LMNTD2Q8IXW0 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
LMNTD2Q8IXW0 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms