Protein–RNA interactions for Protein: Q8IVW6

ARID3B, AT-rich interactive domain-containing protein 3B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 561 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARID3BQ8IVW6 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
ARID3BQ8IVW6 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
ARID3BQ8IVW6 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
ARID3BQ8IVW6 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
ARID3BQ8IVW6 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
ARID3BQ8IVW6 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
ARID3BQ8IVW6 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
ARID3BQ8IVW6 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
ARID3BQ8IVW6 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
ARID3BQ8IVW6 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
ARID3BQ8IVW6 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
ARID3BQ8IVW6 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
ARID3BQ8IVW6 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
ARID3BQ8IVW6 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
ARID3BQ8IVW6 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
ARID3BQ8IVW6 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
ARID3BQ8IVW6 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
ARID3BQ8IVW6 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
ARID3BQ8IVW6 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
ARID3BQ8IVW6 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
ARID3BQ8IVW6 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
ARID3BQ8IVW6 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
ARID3BQ8IVW6 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
ARID3BQ8IVW6 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
ARID3BQ8IVW6 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
ARID3BQ8IVW6 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
ARID3BQ8IVW6 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
ARID3BQ8IVW6 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
ARID3BQ8IVW6 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
ARID3BQ8IVW6 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
ARID3BQ8IVW6 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
ARID3BQ8IVW6 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
ARID3BQ8IVW6 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
ARID3BQ8IVW6 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
ARID3BQ8IVW6 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
ARID3BQ8IVW6 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
ARID3BQ8IVW6 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
ARID3BQ8IVW6 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
ARID3BQ8IVW6 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
ARID3BQ8IVW6 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
ARID3BQ8IVW6 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
ARID3BQ8IVW6 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
ARID3BQ8IVW6 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
ARID3BQ8IVW6 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
ARID3BQ8IVW6 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
ARID3BQ8IVW6 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
ARID3BQ8IVW6 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
ARID3BQ8IVW6 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
ARID3BQ8IVW6 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
ARID3BQ8IVW6 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
ARID3BQ8IVW6 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
ARID3BQ8IVW6 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
ARID3BQ8IVW6 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
ARID3BQ8IVW6 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
ARID3BQ8IVW6 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
ARID3BQ8IVW6 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
ARID3BQ8IVW6 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
ARID3BQ8IVW6 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
ARID3BQ8IVW6 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.95
ARID3BQ8IVW6 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
ARID3BQ8IVW6 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
ARID3BQ8IVW6 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
ARID3BQ8IVW6 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
ARID3BQ8IVW6 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
ARID3BQ8IVW6 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
ARID3BQ8IVW6 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
ARID3BQ8IVW6 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
ARID3BQ8IVW6 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
ARID3BQ8IVW6 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
ARID3BQ8IVW6 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
ARID3BQ8IVW6 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
ARID3BQ8IVW6 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
ARID3BQ8IVW6 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
ARID3BQ8IVW6 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
ARID3BQ8IVW6 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
ARID3BQ8IVW6 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
ARID3BQ8IVW6 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
ARID3BQ8IVW6 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
ARID3BQ8IVW6 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
ARID3BQ8IVW6 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
ARID3BQ8IVW6 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
ARID3BQ8IVW6 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
ARID3BQ8IVW6 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
ARID3BQ8IVW6 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
ARID3BQ8IVW6 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
ARID3BQ8IVW6 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
ARID3BQ8IVW6 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
ARID3BQ8IVW6 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
ARID3BQ8IVW6 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
ARID3BQ8IVW6 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
ARID3BQ8IVW6 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
ARID3BQ8IVW6 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
ARID3BQ8IVW6 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
ARID3BQ8IVW6 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
ARID3BQ8IVW6 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
ARID3BQ8IVW6 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
ARID3BQ8IVW6 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
ARID3BQ8IVW6 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
ARID3BQ8IVW6 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
ARID3BQ8IVW6 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.9 ms