Protein–RNA interactions for Protein: Q8IUI4

SNX29P2, Putative protein SNX29P2, humanhuman

Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX29P2Q8IUI4 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SNX29P2Q8IUI4 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SNX29P2Q8IUI4 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SNX29P2Q8IUI4 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SNX29P2Q8IUI4 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SNX29P2Q8IUI4 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SNX29P2Q8IUI4 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SNX29P2Q8IUI4 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SNX29P2Q8IUI4 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SNX29P2Q8IUI4 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SNX29P2Q8IUI4 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
SNX29P2Q8IUI4 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
SNX29P2Q8IUI4 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SNX29P2Q8IUI4 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SNX29P2Q8IUI4 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SNX29P2Q8IUI4 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SNX29P2Q8IUI4 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SNX29P2Q8IUI4 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SNX29P2Q8IUI4 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SNX29P2Q8IUI4 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SNX29P2Q8IUI4 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
SNX29P2Q8IUI4 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
SNX29P2Q8IUI4 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
SNX29P2Q8IUI4 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SNX29P2Q8IUI4 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SNX29P2Q8IUI4 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SNX29P2Q8IUI4 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SNX29P2Q8IUI4 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SNX29P2Q8IUI4 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SNX29P2Q8IUI4 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SNX29P2Q8IUI4 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SNX29P2Q8IUI4 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SNX29P2Q8IUI4 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SNX29P2Q8IUI4 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SNX29P2Q8IUI4 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SNX29P2Q8IUI4 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SNX29P2Q8IUI4 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SNX29P2Q8IUI4 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SNX29P2Q8IUI4 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SNX29P2Q8IUI4 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SNX29P2Q8IUI4 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SNX29P2Q8IUI4 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SNX29P2Q8IUI4 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SNX29P2Q8IUI4 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SNX29P2Q8IUI4 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SNX29P2Q8IUI4 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SNX29P2Q8IUI4 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SNX29P2Q8IUI4 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SNX29P2Q8IUI4 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SNX29P2Q8IUI4 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SNX29P2Q8IUI4 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SNX29P2Q8IUI4 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SNX29P2Q8IUI4 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SNX29P2Q8IUI4 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SNX29P2Q8IUI4 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SNX29P2Q8IUI4 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SNX29P2Q8IUI4 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SNX29P2Q8IUI4 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SNX29P2Q8IUI4 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SNX29P2Q8IUI4 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SNX29P2Q8IUI4 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SNX29P2Q8IUI4 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SNX29P2Q8IUI4 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SNX29P2Q8IUI4 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SNX29P2Q8IUI4 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SNX29P2Q8IUI4 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SNX29P2Q8IUI4 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SNX29P2Q8IUI4 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SNX29P2Q8IUI4 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SNX29P2Q8IUI4 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SNX29P2Q8IUI4 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SNX29P2Q8IUI4 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SNX29P2Q8IUI4 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SNX29P2Q8IUI4 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SNX29P2Q8IUI4 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
SNX29P2Q8IUI4 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
SNX29P2Q8IUI4 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SNX29P2Q8IUI4 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SNX29P2Q8IUI4 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SNX29P2Q8IUI4 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SNX29P2Q8IUI4 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SNX29P2Q8IUI4 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SNX29P2Q8IUI4 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SNX29P2Q8IUI4 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SNX29P2Q8IUI4 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SNX29P2Q8IUI4 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
SNX29P2Q8IUI4 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
SNX29P2Q8IUI4 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SNX29P2Q8IUI4 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
SNX29P2Q8IUI4 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SNX29P2Q8IUI4 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.23
SNX29P2Q8IUI4 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
SNX29P2Q8IUI4 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SNX29P2Q8IUI4 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SNX29P2Q8IUI4 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SNX29P2Q8IUI4 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SNX29P2Q8IUI4 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SNX29P2Q8IUI4 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SNX29P2Q8IUI4 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SNX29P2Q8IUI4 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 125.3 ms