Protein–RNA interactions for Protein: Q86X40

LRRC28, Leucine-rich repeat-containing protein 28, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC28Q86X40 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
LRRC28Q86X40 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
LRRC28Q86X40 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
LRRC28Q86X40 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
LRRC28Q86X40 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
LRRC28Q86X40 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
LRRC28Q86X40 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
LRRC28Q86X40 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
LRRC28Q86X40 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
LRRC28Q86X40 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
LRRC28Q86X40 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
LRRC28Q86X40 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
LRRC28Q86X40 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
LRRC28Q86X40 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
LRRC28Q86X40 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
LRRC28Q86X40 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
LRRC28Q86X40 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LRRC28Q86X40 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LRRC28Q86X40 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LRRC28Q86X40 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LRRC28Q86X40 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LRRC28Q86X40 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LRRC28Q86X40 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
LRRC28Q86X40 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
LRRC28Q86X40 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
LRRC28Q86X40 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
LRRC28Q86X40 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LRRC28Q86X40 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
LRRC28Q86X40 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LRRC28Q86X40 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LRRC28Q86X40 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
LRRC28Q86X40 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
LRRC28Q86X40 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
LRRC28Q86X40 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
LRRC28Q86X40 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LRRC28Q86X40 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LRRC28Q86X40 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LRRC28Q86X40 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LRRC28Q86X40 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LRRC28Q86X40 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
LRRC28Q86X40 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
LRRC28Q86X40 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
LRRC28Q86X40 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
LRRC28Q86X40 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LRRC28Q86X40 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
LRRC28Q86X40 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LRRC28Q86X40 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LRRC28Q86X40 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LRRC28Q86X40 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LRRC28Q86X40 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LRRC28Q86X40 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LRRC28Q86X40 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LRRC28Q86X40 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LRRC28Q86X40 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LRRC28Q86X40 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LRRC28Q86X40 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LRRC28Q86X40 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LRRC28Q86X40 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LRRC28Q86X40 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LRRC28Q86X40 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
LRRC28Q86X40 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LRRC28Q86X40 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LRRC28Q86X40 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LRRC28Q86X40 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
LRRC28Q86X40 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
LRRC28Q86X40 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
LRRC28Q86X40 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
LRRC28Q86X40 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
LRRC28Q86X40 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
LRRC28Q86X40 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
LRRC28Q86X40 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LRRC28Q86X40 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LRRC28Q86X40 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LRRC28Q86X40 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LRRC28Q86X40 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
LRRC28Q86X40 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LRRC28Q86X40 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
LRRC28Q86X40 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LRRC28Q86X40 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
LRRC28Q86X40 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
LRRC28Q86X40 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
LRRC28Q86X40 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
LRRC28Q86X40 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
LRRC28Q86X40 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
LRRC28Q86X40 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
LRRC28Q86X40 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
LRRC28Q86X40 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
LRRC28Q86X40 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
LRRC28Q86X40 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
LRRC28Q86X40 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
LRRC28Q86X40 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
LRRC28Q86X40 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
LRRC28Q86X40 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
LRRC28Q86X40 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
LRRC28Q86X40 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
LRRC28Q86X40 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
LRRC28Q86X40 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
LRRC28Q86X40 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
LRRC28Q86X40 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
LRRC28Q86X40 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.2 ms