Protein–RNA interactions for Protein: Q86W47

KCNMB4, Calcium-activated potassium channel subunit beta-4, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNMB4Q86W47 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
KCNMB4Q86W47 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
KCNMB4Q86W47 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
KCNMB4Q86W47 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
KCNMB4Q86W47 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
KCNMB4Q86W47 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
KCNMB4Q86W47 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
KCNMB4Q86W47 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
KCNMB4Q86W47 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
KCNMB4Q86W47 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
KCNMB4Q86W47 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
KCNMB4Q86W47 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
KCNMB4Q86W47 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
KCNMB4Q86W47 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
KCNMB4Q86W47 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
KCNMB4Q86W47 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
KCNMB4Q86W47 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
KCNMB4Q86W47 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
KCNMB4Q86W47 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
KCNMB4Q86W47 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
KCNMB4Q86W47 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.75
KCNMB4Q86W47 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
KCNMB4Q86W47 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
KCNMB4Q86W47 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
KCNMB4Q86W47 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
KCNMB4Q86W47 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
KCNMB4Q86W47 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC25.95■■□□□ 1.74
KCNMB4Q86W47 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
KCNMB4Q86W47 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
KCNMB4Q86W47 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
KCNMB4Q86W47 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
KCNMB4Q86W47 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
KCNMB4Q86W47 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
KCNMB4Q86W47 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
KCNMB4Q86W47 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
KCNMB4Q86W47 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
KCNMB4Q86W47 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
KCNMB4Q86W47 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
KCNMB4Q86W47 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
KCNMB4Q86W47 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
KCNMB4Q86W47 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
KCNMB4Q86W47 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
KCNMB4Q86W47 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
KCNMB4Q86W47 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
KCNMB4Q86W47 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
KCNMB4Q86W47 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
KCNMB4Q86W47 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
KCNMB4Q86W47 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
KCNMB4Q86W47 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
KCNMB4Q86W47 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
KCNMB4Q86W47 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
KCNMB4Q86W47 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
KCNMB4Q86W47 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
KCNMB4Q86W47 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
KCNMB4Q86W47 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
KCNMB4Q86W47 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
KCNMB4Q86W47 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
KCNMB4Q86W47 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
KCNMB4Q86W47 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
KCNMB4Q86W47 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
KCNMB4Q86W47 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
KCNMB4Q86W47 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
KCNMB4Q86W47 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
KCNMB4Q86W47 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
KCNMB4Q86W47 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
KCNMB4Q86W47 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
KCNMB4Q86W47 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
KCNMB4Q86W47 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
KCNMB4Q86W47 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
KCNMB4Q86W47 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
KCNMB4Q86W47 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
KCNMB4Q86W47 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
KCNMB4Q86W47 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
KCNMB4Q86W47 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
KCNMB4Q86W47 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
KCNMB4Q86W47 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
KCNMB4Q86W47 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
KCNMB4Q86W47 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
KCNMB4Q86W47 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
KCNMB4Q86W47 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
KCNMB4Q86W47 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
KCNMB4Q86W47 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
KCNMB4Q86W47 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
KCNMB4Q86W47 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
KCNMB4Q86W47 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
KCNMB4Q86W47 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
KCNMB4Q86W47 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
KCNMB4Q86W47 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
KCNMB4Q86W47 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
KCNMB4Q86W47 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
KCNMB4Q86W47 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
KCNMB4Q86W47 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
KCNMB4Q86W47 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
KCNMB4Q86W47 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
KCNMB4Q86W47 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
KCNMB4Q86W47 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
KCNMB4Q86W47 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
KCNMB4Q86W47 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
KCNMB4Q86W47 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
KCNMB4Q86W47 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 129.3 ms