Protein–RNA interactions for Protein: Q86U02

LINC00596, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00596, humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00596Q86U02 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
LINC00596Q86U02 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
LINC00596Q86U02 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
LINC00596Q86U02 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
LINC00596Q86U02 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
LINC00596Q86U02 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
LINC00596Q86U02 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
LINC00596Q86U02 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
LINC00596Q86U02 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
LINC00596Q86U02 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
LINC00596Q86U02 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
LINC00596Q86U02 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
LINC00596Q86U02 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
LINC00596Q86U02 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
LINC00596Q86U02 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
LINC00596Q86U02 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
LINC00596Q86U02 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
LINC00596Q86U02 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
LINC00596Q86U02 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
LINC00596Q86U02 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
LINC00596Q86U02 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
LINC00596Q86U02 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
LINC00596Q86U02 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
LINC00596Q86U02 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
LINC00596Q86U02 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
LINC00596Q86U02 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
LINC00596Q86U02 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
LINC00596Q86U02 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
LINC00596Q86U02 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
LINC00596Q86U02 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
LINC00596Q86U02 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
LINC00596Q86U02 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
LINC00596Q86U02 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
LINC00596Q86U02 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
LINC00596Q86U02 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
LINC00596Q86U02 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
LINC00596Q86U02 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
LINC00596Q86U02 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
LINC00596Q86U02 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
LINC00596Q86U02 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
LINC00596Q86U02 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
LINC00596Q86U02 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
LINC00596Q86U02 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
LINC00596Q86U02 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
LINC00596Q86U02 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
LINC00596Q86U02 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
LINC00596Q86U02 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
LINC00596Q86U02 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
LINC00596Q86U02 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
LINC00596Q86U02 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
LINC00596Q86U02 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
LINC00596Q86U02 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
LINC00596Q86U02 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
LINC00596Q86U02 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
LINC00596Q86U02 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
LINC00596Q86U02 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
LINC00596Q86U02 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
LINC00596Q86U02 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
LINC00596Q86U02 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
LINC00596Q86U02 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
LINC00596Q86U02 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
LINC00596Q86U02 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
LINC00596Q86U02 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
LINC00596Q86U02 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
LINC00596Q86U02 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
LINC00596Q86U02 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
LINC00596Q86U02 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
LINC00596Q86U02 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
LINC00596Q86U02 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
LINC00596Q86U02 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
LINC00596Q86U02 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
LINC00596Q86U02 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
LINC00596Q86U02 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
LINC00596Q86U02 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
LINC00596Q86U02 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
LINC00596Q86U02 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
LINC00596Q86U02 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
LINC00596Q86U02 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
LINC00596Q86U02 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
LINC00596Q86U02 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
LINC00596Q86U02 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
LINC00596Q86U02 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
LINC00596Q86U02 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
LINC00596Q86U02 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
LINC00596Q86U02 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
LINC00596Q86U02 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
LINC00596Q86U02 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
LINC00596Q86U02 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
LINC00596Q86U02 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
LINC00596Q86U02 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
LINC00596Q86U02 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
LINC00596Q86U02 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
LINC00596Q86U02 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
LINC00596Q86U02 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
LINC00596Q86U02 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
LINC00596Q86U02 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
LINC00596Q86U02 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
LINC00596Q86U02 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
LINC00596Q86U02 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
LINC00596Q86U02 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms