Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z5M5

TMC3, Transmembrane channel-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,100 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMC3Q7Z5M5 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
TMC3Q7Z5M5 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
TMC3Q7Z5M5 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
TMC3Q7Z5M5 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
TMC3Q7Z5M5 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
TMC3Q7Z5M5 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
TMC3Q7Z5M5 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
TMC3Q7Z5M5 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
TMC3Q7Z5M5 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
TMC3Q7Z5M5 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
TMC3Q7Z5M5 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
TMC3Q7Z5M5 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
TMC3Q7Z5M5 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
TMC3Q7Z5M5 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
TMC3Q7Z5M5 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
TMC3Q7Z5M5 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
TMC3Q7Z5M5 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
TMC3Q7Z5M5 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
TMC3Q7Z5M5 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
TMC3Q7Z5M5 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
TMC3Q7Z5M5 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
TMC3Q7Z5M5 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
TMC3Q7Z5M5 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
TMC3Q7Z5M5 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
TMC3Q7Z5M5 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
TMC3Q7Z5M5 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
TMC3Q7Z5M5 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
TMC3Q7Z5M5 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
TMC3Q7Z5M5 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
TMC3Q7Z5M5 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
TMC3Q7Z5M5 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
TMC3Q7Z5M5 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
TMC3Q7Z5M5 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
TMC3Q7Z5M5 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
TMC3Q7Z5M5 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
TMC3Q7Z5M5 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
TMC3Q7Z5M5 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
TMC3Q7Z5M5 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
TMC3Q7Z5M5 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
TMC3Q7Z5M5 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
TMC3Q7Z5M5 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
TMC3Q7Z5M5 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
TMC3Q7Z5M5 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
TMC3Q7Z5M5 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
TMC3Q7Z5M5 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
TMC3Q7Z5M5 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
TMC3Q7Z5M5 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
TMC3Q7Z5M5 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
TMC3Q7Z5M5 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
TMC3Q7Z5M5 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
TMC3Q7Z5M5 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
TMC3Q7Z5M5 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
TMC3Q7Z5M5 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
TMC3Q7Z5M5 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
TMC3Q7Z5M5 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
TMC3Q7Z5M5 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
TMC3Q7Z5M5 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
TMC3Q7Z5M5 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
TMC3Q7Z5M5 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
TMC3Q7Z5M5 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
TMC3Q7Z5M5 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
TMC3Q7Z5M5 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
TMC3Q7Z5M5 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
TMC3Q7Z5M5 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
TMC3Q7Z5M5 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
TMC3Q7Z5M5 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
TMC3Q7Z5M5 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
TMC3Q7Z5M5 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
TMC3Q7Z5M5 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
TMC3Q7Z5M5 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
TMC3Q7Z5M5 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
TMC3Q7Z5M5 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC26.69■■□□□ 1.86
TMC3Q7Z5M5 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
TMC3Q7Z5M5 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
TMC3Q7Z5M5 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC26.68■■□□□ 1.86
TMC3Q7Z5M5 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
TMC3Q7Z5M5 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
TMC3Q7Z5M5 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
TMC3Q7Z5M5 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
TMC3Q7Z5M5 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
TMC3Q7Z5M5 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
TMC3Q7Z5M5 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
TMC3Q7Z5M5 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
TMC3Q7Z5M5 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
TMC3Q7Z5M5 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
TMC3Q7Z5M5 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
TMC3Q7Z5M5 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
TMC3Q7Z5M5 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
TMC3Q7Z5M5 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC26.62■■□□□ 1.85
TMC3Q7Z5M5 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
TMC3Q7Z5M5 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
TMC3Q7Z5M5 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
TMC3Q7Z5M5 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
TMC3Q7Z5M5 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
TMC3Q7Z5M5 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC26.61■■□□□ 1.85
TMC3Q7Z5M5 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
TMC3Q7Z5M5 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
TMC3Q7Z5M5 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
TMC3Q7Z5M5 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
TMC3Q7Z5M5 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 137.4 ms