Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z5L7

PODN, Podocan, humanhuman

Predictions only

Length 613 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PODNQ7Z5L7 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
PODNQ7Z5L7 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
PODNQ7Z5L7 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
PODNQ7Z5L7 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
PODNQ7Z5L7 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC31.91■■■□□ 2.7
PODNQ7Z5L7 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC31.9■■■□□ 2.7
PODNQ7Z5L7 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.89■■■□□ 2.7
PODNQ7Z5L7 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.89■■■□□ 2.7
PODNQ7Z5L7 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC31.89■■■□□ 2.7
PODNQ7Z5L7 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.89■■■□□ 2.7
PODNQ7Z5L7 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC31.88■■■□□ 2.69
PODNQ7Z5L7 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC31.88■■■□□ 2.69
PODNQ7Z5L7 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.86■■■□□ 2.69
PODNQ7Z5L7 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC31.86■■■□□ 2.69
PODNQ7Z5L7 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
PODNQ7Z5L7 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.85■■■□□ 2.69
PODNQ7Z5L7 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
PODNQ7Z5L7 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
PODNQ7Z5L7 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
PODNQ7Z5L7 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC31.84■■■□□ 2.69
PODNQ7Z5L7 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.83■■■□□ 2.69
PODNQ7Z5L7 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC31.83■■■□□ 2.69
PODNQ7Z5L7 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC31.83■■■□□ 2.69
PODNQ7Z5L7 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.68
PODNQ7Z5L7 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC31.81■■■□□ 2.68
PODNQ7Z5L7 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.8■■■□□ 2.68
PODNQ7Z5L7 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.8■■■□□ 2.68
PODNQ7Z5L7 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC31.8■■■□□ 2.68
PODNQ7Z5L7 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC31.79■■■□□ 2.68
PODNQ7Z5L7 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC31.79■■■□□ 2.68
PODNQ7Z5L7 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC31.78■■■□□ 2.68
PODNQ7Z5L7 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
PODNQ7Z5L7 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.77■■■□□ 2.68
PODNQ7Z5L7 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
PODNQ7Z5L7 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC31.76■■■□□ 2.67
PODNQ7Z5L7 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
PODNQ7Z5L7 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
PODNQ7Z5L7 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
PODNQ7Z5L7 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
PODNQ7Z5L7 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
PODNQ7Z5L7 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
PODNQ7Z5L7 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
PODNQ7Z5L7 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC31.74■■■□□ 2.67
PODNQ7Z5L7 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
PODNQ7Z5L7 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
PODNQ7Z5L7 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC31.72■■■□□ 2.67
PODNQ7Z5L7 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC31.72■■■□□ 2.67
PODNQ7Z5L7 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.67
PODNQ7Z5L7 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.67
PODNQ7Z5L7 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.67
PODNQ7Z5L7 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
PODNQ7Z5L7 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC31.69■■■□□ 2.66
PODNQ7Z5L7 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.68■■■□□ 2.66
PODNQ7Z5L7 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.67■■■□□ 2.66
PODNQ7Z5L7 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC31.66■■■□□ 2.66
PODNQ7Z5L7 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
PODNQ7Z5L7 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC31.66■■■□□ 2.66
PODNQ7Z5L7 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
PODNQ7Z5L7 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC31.65■■■□□ 2.66
PODNQ7Z5L7 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
PODNQ7Z5L7 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC31.64■■■□□ 2.66
PODNQ7Z5L7 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.64■■■□□ 2.66
PODNQ7Z5L7 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
PODNQ7Z5L7 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
PODNQ7Z5L7 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
PODNQ7Z5L7 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
PODNQ7Z5L7 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC31.6■■■□□ 2.65
PODNQ7Z5L7 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
PODNQ7Z5L7 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
PODNQ7Z5L7 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC31.59■■■□□ 2.65
PODNQ7Z5L7 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
PODNQ7Z5L7 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC31.58■■■□□ 2.65
PODNQ7Z5L7 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC31.58■■■□□ 2.65
PODNQ7Z5L7 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
PODNQ7Z5L7 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
PODNQ7Z5L7 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC31.57■■■□□ 2.64
PODNQ7Z5L7 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC31.56■■■□□ 2.64
PODNQ7Z5L7 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.56■■■□□ 2.64
PODNQ7Z5L7 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
PODNQ7Z5L7 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
PODNQ7Z5L7 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
PODNQ7Z5L7 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
PODNQ7Z5L7 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.55■■■□□ 2.64
PODNQ7Z5L7 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC31.55■■■□□ 2.64
PODNQ7Z5L7 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
PODNQ7Z5L7 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC31.54■■■□□ 2.64
PODNQ7Z5L7 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
PODNQ7Z5L7 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
PODNQ7Z5L7 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
PODNQ7Z5L7 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
PODNQ7Z5L7 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC31.53■■■□□ 2.64
PODNQ7Z5L7 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC31.52■■■□□ 2.64
PODNQ7Z5L7 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.64
PODNQ7Z5L7 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC31.51■■■□□ 2.63
PODNQ7Z5L7 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC31.51■■■□□ 2.63
PODNQ7Z5L7 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC31.5■■■□□ 2.63
PODNQ7Z5L7 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC31.5■■■□□ 2.63
PODNQ7Z5L7 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC31.49■■■□□ 2.63
PODNQ7Z5L7 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
PODNQ7Z5L7 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.2 ms