Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z5D8

NANOGNB, NANOG neighbor homeobox, humanhuman

Predictions only

Length 188 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NANOGNBQ7Z5D8 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NANOGNBQ7Z5D8 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NANOGNBQ7Z5D8 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
NANOGNBQ7Z5D8 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NANOGNBQ7Z5D8 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NANOGNBQ7Z5D8 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
NANOGNBQ7Z5D8 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC23.59■■□□□ 1.37
NANOGNBQ7Z5D8 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NANOGNBQ7Z5D8 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
NANOGNBQ7Z5D8 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
NANOGNBQ7Z5D8 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
NANOGNBQ7Z5D8 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
NANOGNBQ7Z5D8 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
NANOGNBQ7Z5D8 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NANOGNBQ7Z5D8 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
NANOGNBQ7Z5D8 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
NANOGNBQ7Z5D8 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NANOGNBQ7Z5D8 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
NANOGNBQ7Z5D8 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
NANOGNBQ7Z5D8 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NANOGNBQ7Z5D8 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NANOGNBQ7Z5D8 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NANOGNBQ7Z5D8 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
NANOGNBQ7Z5D8 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
NANOGNBQ7Z5D8 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NANOGNBQ7Z5D8 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NANOGNBQ7Z5D8 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NANOGNBQ7Z5D8 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
NANOGNBQ7Z5D8 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
NANOGNBQ7Z5D8 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
NANOGNBQ7Z5D8 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
NANOGNBQ7Z5D8 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
NANOGNBQ7Z5D8 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NANOGNBQ7Z5D8 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NANOGNBQ7Z5D8 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
NANOGNBQ7Z5D8 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
NANOGNBQ7Z5D8 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
NANOGNBQ7Z5D8 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
NANOGNBQ7Z5D8 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
NANOGNBQ7Z5D8 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NANOGNBQ7Z5D8 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NANOGNBQ7Z5D8 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
NANOGNBQ7Z5D8 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NANOGNBQ7Z5D8 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NANOGNBQ7Z5D8 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NANOGNBQ7Z5D8 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NANOGNBQ7Z5D8 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NANOGNBQ7Z5D8 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NANOGNBQ7Z5D8 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NANOGNBQ7Z5D8 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NANOGNBQ7Z5D8 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NANOGNBQ7Z5D8 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NANOGNBQ7Z5D8 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NANOGNBQ7Z5D8 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
NANOGNBQ7Z5D8 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
NANOGNBQ7Z5D8 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
NANOGNBQ7Z5D8 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
NANOGNBQ7Z5D8 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
NANOGNBQ7Z5D8 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NANOGNBQ7Z5D8 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NANOGNBQ7Z5D8 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NANOGNBQ7Z5D8 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NANOGNBQ7Z5D8 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NANOGNBQ7Z5D8 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NANOGNBQ7Z5D8 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NANOGNBQ7Z5D8 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NANOGNBQ7Z5D8 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NANOGNBQ7Z5D8 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NANOGNBQ7Z5D8 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NANOGNBQ7Z5D8 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NANOGNBQ7Z5D8 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NANOGNBQ7Z5D8 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NANOGNBQ7Z5D8 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
NANOGNBQ7Z5D8 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NANOGNBQ7Z5D8 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NANOGNBQ7Z5D8 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NANOGNBQ7Z5D8 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NANOGNBQ7Z5D8 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NANOGNBQ7Z5D8 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NANOGNBQ7Z5D8 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NANOGNBQ7Z5D8 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
NANOGNBQ7Z5D8 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
NANOGNBQ7Z5D8 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
NANOGNBQ7Z5D8 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NANOGNBQ7Z5D8 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
NANOGNBQ7Z5D8 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NANOGNBQ7Z5D8 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NANOGNBQ7Z5D8 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NANOGNBQ7Z5D8 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NANOGNBQ7Z5D8 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NANOGNBQ7Z5D8 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NANOGNBQ7Z5D8 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
NANOGNBQ7Z5D8 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NANOGNBQ7Z5D8 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NANOGNBQ7Z5D8 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NANOGNBQ7Z5D8 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NANOGNBQ7Z5D8 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
NANOGNBQ7Z5D8 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
NANOGNBQ7Z5D8 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
NANOGNBQ7Z5D8 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.3 ms