Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z443

PKD1L3, Polycystic kidney disease protein 1-like 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,732 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKD1L3Q7Z443 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
PKD1L3Q7Z443 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
PKD1L3Q7Z443 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
PKD1L3Q7Z443 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
PKD1L3Q7Z443 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
PKD1L3Q7Z443 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
PKD1L3Q7Z443 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
PKD1L3Q7Z443 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
PKD1L3Q7Z443 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
PKD1L3Q7Z443 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC34.45■■■■□ 3.11
PKD1L3Q7Z443 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
PKD1L3Q7Z443 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
PKD1L3Q7Z443 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC34.44■■■■□ 3.1
PKD1L3Q7Z443 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
PKD1L3Q7Z443 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
PKD1L3Q7Z443 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
PKD1L3Q7Z443 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
PKD1L3Q7Z443 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
PKD1L3Q7Z443 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
PKD1L3Q7Z443 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
PKD1L3Q7Z443 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC34.44■■■■□ 3.1
PKD1L3Q7Z443 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC34.43■■■■□ 3.1
PKD1L3Q7Z443 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC34.43■■■■□ 3.1
PKD1L3Q7Z443 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC34.42■■■■□ 3.1
PKD1L3Q7Z443 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.42■■■■□ 3.1
PKD1L3Q7Z443 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
PKD1L3Q7Z443 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
PKD1L3Q7Z443 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
PKD1L3Q7Z443 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
PKD1L3Q7Z443 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
PKD1L3Q7Z443 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC34.4■■■■□ 3.1
PKD1L3Q7Z443 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC34.39■■■■□ 3.1
PKD1L3Q7Z443 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC34.39■■■■□ 3.1
PKD1L3Q7Z443 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
PKD1L3Q7Z443 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
PKD1L3Q7Z443 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
PKD1L3Q7Z443 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
PKD1L3Q7Z443 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
PKD1L3Q7Z443 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
PKD1L3Q7Z443 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC34.35■■■■□ 3.09
PKD1L3Q7Z443 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC34.35■■■■□ 3.09
PKD1L3Q7Z443 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.35■■■■□ 3.09
PKD1L3Q7Z443 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
PKD1L3Q7Z443 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC34.33■■■■□ 3.09
PKD1L3Q7Z443 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC34.31■■■■□ 3.08
PKD1L3Q7Z443 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC34.31■■■■□ 3.08
PKD1L3Q7Z443 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
PKD1L3Q7Z443 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
PKD1L3Q7Z443 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
PKD1L3Q7Z443 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
PKD1L3Q7Z443 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
PKD1L3Q7Z443 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC34.29■■■■□ 3.08
PKD1L3Q7Z443 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
PKD1L3Q7Z443 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
PKD1L3Q7Z443 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC34.27■■■■□ 3.08
PKD1L3Q7Z443 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.08
PKD1L3Q7Z443 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC34.26■■■■□ 3.07
PKD1L3Q7Z443 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.07
PKD1L3Q7Z443 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC34.26■■■■□ 3.07
PKD1L3Q7Z443 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
PKD1L3Q7Z443 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC34.25■■■■□ 3.07
PKD1L3Q7Z443 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.25■■■■□ 3.07
PKD1L3Q7Z443 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC34.25■■■■□ 3.07
PKD1L3Q7Z443 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC34.24■■■■□ 3.07
PKD1L3Q7Z443 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC34.23■■■■□ 3.07
PKD1L3Q7Z443 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC34.21■■■■□ 3.07
PKD1L3Q7Z443 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.2■■■■□ 3.07
PKD1L3Q7Z443 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
PKD1L3Q7Z443 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
PKD1L3Q7Z443 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
PKD1L3Q7Z443 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC34.19■■■■□ 3.06
PKD1L3Q7Z443 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC34.18■■■■□ 3.06
PKD1L3Q7Z443 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC34.18■■■■□ 3.06
PKD1L3Q7Z443 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
PKD1L3Q7Z443 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
PKD1L3Q7Z443 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
PKD1L3Q7Z443 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC34.15■■■■□ 3.06
PKD1L3Q7Z443 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC34.15■■■■□ 3.06
PKD1L3Q7Z443 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
PKD1L3Q7Z443 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC34.14■■■■□ 3.06
PKD1L3Q7Z443 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
PKD1L3Q7Z443 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC34.11■■■■□ 3.05
PKD1L3Q7Z443 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC34.1■■■■□ 3.05
PKD1L3Q7Z443 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.1■■■■□ 3.05
PKD1L3Q7Z443 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.09■■■■□ 3.05
PKD1L3Q7Z443 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
PKD1L3Q7Z443 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
PKD1L3Q7Z443 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
PKD1L3Q7Z443 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC34.08■■■■□ 3.05
PKD1L3Q7Z443 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
PKD1L3Q7Z443 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
PKD1L3Q7Z443 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
PKD1L3Q7Z443 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
PKD1L3Q7Z443 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.05■■■■□ 3.04
PKD1L3Q7Z443 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
PKD1L3Q7Z443 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
PKD1L3Q7Z443 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC34.04■■■■□ 3.04
PKD1L3Q7Z443 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC34.04■■■■□ 3.04
PKD1L3Q7Z443 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
PKD1L3Q7Z443 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms