Protein–RNA interactions for Protein: Q717R9

CYS1, Cystin-1, humanhuman

Predictions only

Length 158 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYS1Q717R9 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CYS1Q717R9 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CYS1Q717R9 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CYS1Q717R9 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CYS1Q717R9 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CYS1Q717R9 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CYS1Q717R9 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
CYS1Q717R9 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
CYS1Q717R9 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CYS1Q717R9 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CYS1Q717R9 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CYS1Q717R9 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CYS1Q717R9 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CYS1Q717R9 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CYS1Q717R9 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CYS1Q717R9 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CYS1Q717R9 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CYS1Q717R9 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CYS1Q717R9 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CYS1Q717R9 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CYS1Q717R9 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CYS1Q717R9 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CYS1Q717R9 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CYS1Q717R9 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CYS1Q717R9 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CYS1Q717R9 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CYS1Q717R9 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CYS1Q717R9 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CYS1Q717R9 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CYS1Q717R9 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CYS1Q717R9 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CYS1Q717R9 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC25.95■■□□□ 1.74
CYS1Q717R9 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
CYS1Q717R9 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CYS1Q717R9 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
CYS1Q717R9 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CYS1Q717R9 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CYS1Q717R9 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CYS1Q717R9 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CYS1Q717R9 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CYS1Q717R9 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CYS1Q717R9 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
CYS1Q717R9 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CYS1Q717R9 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CYS1Q717R9 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CYS1Q717R9 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CYS1Q717R9 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CYS1Q717R9 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CYS1Q717R9 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CYS1Q717R9 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CYS1Q717R9 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CYS1Q717R9 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CYS1Q717R9 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CYS1Q717R9 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CYS1Q717R9 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CYS1Q717R9 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CYS1Q717R9 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CYS1Q717R9 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
CYS1Q717R9 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
CYS1Q717R9 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
CYS1Q717R9 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
CYS1Q717R9 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
CYS1Q717R9 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CYS1Q717R9 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CYS1Q717R9 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CYS1Q717R9 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CYS1Q717R9 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CYS1Q717R9 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CYS1Q717R9 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CYS1Q717R9 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
CYS1Q717R9 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CYS1Q717R9 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CYS1Q717R9 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CYS1Q717R9 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CYS1Q717R9 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CYS1Q717R9 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CYS1Q717R9 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CYS1Q717R9 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CYS1Q717R9 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CYS1Q717R9 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CYS1Q717R9 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CYS1Q717R9 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CYS1Q717R9 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CYS1Q717R9 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CYS1Q717R9 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CYS1Q717R9 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CYS1Q717R9 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CYS1Q717R9 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CYS1Q717R9 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CYS1Q717R9 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CYS1Q717R9 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CYS1Q717R9 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CYS1Q717R9 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CYS1Q717R9 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CYS1Q717R9 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CYS1Q717R9 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CYS1Q717R9 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CYS1Q717R9 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CYS1Q717R9 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CYS1Q717R9 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.2 ms