Protein–RNA interactions for Protein: Q6UY18

LINGO4, Leucine-rich repeat and immunoglobulin-like domain-containing nogo receptor-interacting protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 593 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINGO4Q6UY18 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
LINGO4Q6UY18 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
LINGO4Q6UY18 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
LINGO4Q6UY18 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
LINGO4Q6UY18 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
LINGO4Q6UY18 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC26.52■■□□□ 1.84
LINGO4Q6UY18 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
LINGO4Q6UY18 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
LINGO4Q6UY18 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
LINGO4Q6UY18 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC26.49■■□□□ 1.83
LINGO4Q6UY18 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
LINGO4Q6UY18 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
LINGO4Q6UY18 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
LINGO4Q6UY18 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC26.47■■□□□ 1.83
LINGO4Q6UY18 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
LINGO4Q6UY18 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
LINGO4Q6UY18 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
LINGO4Q6UY18 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
LINGO4Q6UY18 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
LINGO4Q6UY18 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
LINGO4Q6UY18 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
LINGO4Q6UY18 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
LINGO4Q6UY18 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
LINGO4Q6UY18 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
LINGO4Q6UY18 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
LINGO4Q6UY18 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
LINGO4Q6UY18 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
LINGO4Q6UY18 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
LINGO4Q6UY18 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
LINGO4Q6UY18 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
LINGO4Q6UY18 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
LINGO4Q6UY18 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
LINGO4Q6UY18 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
LINGO4Q6UY18 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
LINGO4Q6UY18 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
LINGO4Q6UY18 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
LINGO4Q6UY18 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
LINGO4Q6UY18 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
LINGO4Q6UY18 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
LINGO4Q6UY18 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
LINGO4Q6UY18 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
LINGO4Q6UY18 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
LINGO4Q6UY18 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
LINGO4Q6UY18 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
LINGO4Q6UY18 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC26.39■■□□□ 1.82
LINGO4Q6UY18 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
LINGO4Q6UY18 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
LINGO4Q6UY18 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
LINGO4Q6UY18 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
LINGO4Q6UY18 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
LINGO4Q6UY18 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC26.37■■□□□ 1.81
LINGO4Q6UY18 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
LINGO4Q6UY18 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
LINGO4Q6UY18 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
LINGO4Q6UY18 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
LINGO4Q6UY18 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
LINGO4Q6UY18 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
LINGO4Q6UY18 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC26.34■■□□□ 1.81
LINGO4Q6UY18 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
LINGO4Q6UY18 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
LINGO4Q6UY18 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
LINGO4Q6UY18 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
LINGO4Q6UY18 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
LINGO4Q6UY18 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
LINGO4Q6UY18 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
LINGO4Q6UY18 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
LINGO4Q6UY18 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
LINGO4Q6UY18 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
LINGO4Q6UY18 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
LINGO4Q6UY18 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
LINGO4Q6UY18 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
LINGO4Q6UY18 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC26.31■■□□□ 1.8
LINGO4Q6UY18 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
LINGO4Q6UY18 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
LINGO4Q6UY18 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
LINGO4Q6UY18 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
LINGO4Q6UY18 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
LINGO4Q6UY18 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC26.29■■□□□ 1.8
LINGO4Q6UY18 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
LINGO4Q6UY18 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
LINGO4Q6UY18 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
LINGO4Q6UY18 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
LINGO4Q6UY18 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
LINGO4Q6UY18 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
LINGO4Q6UY18 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
LINGO4Q6UY18 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
LINGO4Q6UY18 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
LINGO4Q6UY18 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
LINGO4Q6UY18 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
LINGO4Q6UY18 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC26.27■■□□□ 1.8
LINGO4Q6UY18 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
LINGO4Q6UY18 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
LINGO4Q6UY18 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
LINGO4Q6UY18 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
LINGO4Q6UY18 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
LINGO4Q6UY18 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
LINGO4Q6UY18 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
LINGO4Q6UY18 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
LINGO4Q6UY18 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
LINGO4Q6UY18 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms