Protein–RNA interactions for Protein: Q6P2D0

ZFP1, Zinc finger protein 1 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 407 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZFP1Q6P2D0 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ZFP1Q6P2D0 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ZFP1Q6P2D0 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ZFP1Q6P2D0 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ZFP1Q6P2D0 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ZFP1Q6P2D0 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ZFP1Q6P2D0 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
ZFP1Q6P2D0 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ZFP1Q6P2D0 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ZFP1Q6P2D0 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ZFP1Q6P2D0 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ZFP1Q6P2D0 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ZFP1Q6P2D0 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ZFP1Q6P2D0 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ZFP1Q6P2D0 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ZFP1Q6P2D0 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ZFP1Q6P2D0 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ZFP1Q6P2D0 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ZFP1Q6P2D0 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ZFP1Q6P2D0 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ZFP1Q6P2D0 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ZFP1Q6P2D0 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ZFP1Q6P2D0 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ZFP1Q6P2D0 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ZFP1Q6P2D0 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ZFP1Q6P2D0 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ZFP1Q6P2D0 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ZFP1Q6P2D0 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ZFP1Q6P2D0 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ZFP1Q6P2D0 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ZFP1Q6P2D0 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ZFP1Q6P2D0 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ZFP1Q6P2D0 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ZFP1Q6P2D0 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
ZFP1Q6P2D0 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ZFP1Q6P2D0 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ZFP1Q6P2D0 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.51
ZFP1Q6P2D0 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
ZFP1Q6P2D0 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
ZFP1Q6P2D0 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
ZFP1Q6P2D0 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ZFP1Q6P2D0 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
ZFP1Q6P2D0 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ZFP1Q6P2D0 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ZFP1Q6P2D0 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ZFP1Q6P2D0 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ZFP1Q6P2D0 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ZFP1Q6P2D0 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ZFP1Q6P2D0 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ZFP1Q6P2D0 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ZFP1Q6P2D0 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ZFP1Q6P2D0 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ZFP1Q6P2D0 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ZFP1Q6P2D0 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ZFP1Q6P2D0 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ZFP1Q6P2D0 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ZFP1Q6P2D0 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ZFP1Q6P2D0 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ZFP1Q6P2D0 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ZFP1Q6P2D0 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ZFP1Q6P2D0 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ZFP1Q6P2D0 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
ZFP1Q6P2D0 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
ZFP1Q6P2D0 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
ZFP1Q6P2D0 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ZFP1Q6P2D0 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ZFP1Q6P2D0 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ZFP1Q6P2D0 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ZFP1Q6P2D0 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ZFP1Q6P2D0 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ZFP1Q6P2D0 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ZFP1Q6P2D0 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ZFP1Q6P2D0 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ZFP1Q6P2D0 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ZFP1Q6P2D0 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ZFP1Q6P2D0 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ZFP1Q6P2D0 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ZFP1Q6P2D0 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ZFP1Q6P2D0 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ZFP1Q6P2D0 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ZFP1Q6P2D0 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ZFP1Q6P2D0 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ZFP1Q6P2D0 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ZFP1Q6P2D0 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ZFP1Q6P2D0 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ZFP1Q6P2D0 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ZFP1Q6P2D0 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ZFP1Q6P2D0 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ZFP1Q6P2D0 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ZFP1Q6P2D0 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
ZFP1Q6P2D0 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ZFP1Q6P2D0 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ZFP1Q6P2D0 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ZFP1Q6P2D0 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ZFP1Q6P2D0 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ZFP1Q6P2D0 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ZFP1Q6P2D0 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ZFP1Q6P2D0 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ZFP1Q6P2D0 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ZFP1Q6P2D0 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.6 ms