Protein–RNA interactions for Protein: Q6F5E8

CARMIL2, Capping protein, Arp2/3 and myosin-I linker protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CARMIL2Q6F5E8 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC42.24■■■■■ 4.35
CARMIL2Q6F5E8 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC42.24■■■■■ 4.35
CARMIL2Q6F5E8 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC42.23■■■■■ 4.35
CARMIL2Q6F5E8 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC42.23■■■■■ 4.35
CARMIL2Q6F5E8 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC42.23■■■■■ 4.35
CARMIL2Q6F5E8 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC42.23■■■■■ 4.35
CARMIL2Q6F5E8 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC42.23■■■■■ 4.35
CARMIL2Q6F5E8 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC42.22■■■■■ 4.35
CARMIL2Q6F5E8 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC42.22■■■■■ 4.35
CARMIL2Q6F5E8 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC42.2■■■■■ 4.35
CARMIL2Q6F5E8 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC42.19■■■■■ 4.34
CARMIL2Q6F5E8 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC42.18■■■■■ 4.34
CARMIL2Q6F5E8 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.17■■■■■ 4.34
CARMIL2Q6F5E8 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC42.17■■■■■ 4.34
CARMIL2Q6F5E8 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC42.17■■■■■ 4.34
CARMIL2Q6F5E8 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC42.17■■■■■ 4.34
CARMIL2Q6F5E8 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.17■■■■■ 4.34
CARMIL2Q6F5E8 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.16■■■■■ 4.34
CARMIL2Q6F5E8 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC42.16■■■■■ 4.34
CARMIL2Q6F5E8 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC42.15■■■■■ 4.34
CARMIL2Q6F5E8 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.13■■■■■ 4.33
CARMIL2Q6F5E8 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC42.13■■■■■ 4.33
CARMIL2Q6F5E8 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.13■■■■■ 4.33
CARMIL2Q6F5E8 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC42.12■■■■■ 4.33
CARMIL2Q6F5E8 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.11■■■■■ 4.33
CARMIL2Q6F5E8 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC42.11■■■■■ 4.33
CARMIL2Q6F5E8 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC42.11■■■■■ 4.33
CARMIL2Q6F5E8 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC42.11■■■■■ 4.33
CARMIL2Q6F5E8 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC42.1■■■■■ 4.33
CARMIL2Q6F5E8 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC42.07■■■■■ 4.33
CARMIL2Q6F5E8 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC42.07■■■■■ 4.33
CARMIL2Q6F5E8 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.05■■■■■ 4.32
CARMIL2Q6F5E8 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC42.05■■■■■ 4.32
CARMIL2Q6F5E8 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC42.04■■■■■ 4.32
CARMIL2Q6F5E8 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC42.03■■■■■ 4.32
CARMIL2Q6F5E8 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.03■■■■■ 4.32
CARMIL2Q6F5E8 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC42.03■■■■■ 4.32
CARMIL2Q6F5E8 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC42.02■■■■■ 4.32
CARMIL2Q6F5E8 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC42.01■■■■■ 4.32
CARMIL2Q6F5E8 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC42.01■■■■■ 4.32
CARMIL2Q6F5E8 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC42.01■■■■■ 4.32
CARMIL2Q6F5E8 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42■■■■■ 4.31
CARMIL2Q6F5E8 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC42■■■■■ 4.31
CARMIL2Q6F5E8 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42■■■■■ 4.31
CARMIL2Q6F5E8 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41.99■■■■■ 4.31
CARMIL2Q6F5E8 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC41.99■■■■■ 4.31
CARMIL2Q6F5E8 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.98■■■■■ 4.31
CARMIL2Q6F5E8 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.96■■■■■ 4.31
CARMIL2Q6F5E8 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC41.96■■■■■ 4.31
CARMIL2Q6F5E8 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.95■■■■■ 4.31
CARMIL2Q6F5E8 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC41.95■■■■■ 4.31
CARMIL2Q6F5E8 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC41.95■■■■■ 4.31
CARMIL2Q6F5E8 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC41.94■■■■■ 4.3
CARMIL2Q6F5E8 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.94■■■■■ 4.3
CARMIL2Q6F5E8 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC41.94■■■■■ 4.3
CARMIL2Q6F5E8 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.94■■■■■ 4.3
CARMIL2Q6F5E8 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC41.93■■■■■ 4.3
CARMIL2Q6F5E8 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC41.92■■■■■ 4.3
CARMIL2Q6F5E8 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC41.92■■■■■ 4.3
CARMIL2Q6F5E8 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.91■■■■■ 4.3
CARMIL2Q6F5E8 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41.91■■■■■ 4.3
CARMIL2Q6F5E8 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC41.9■■■■■ 4.3
CARMIL2Q6F5E8 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC41.89■■■■■ 4.3
CARMIL2Q6F5E8 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC41.88■■■■■ 4.29
CARMIL2Q6F5E8 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC41.88■■■■■ 4.29
CARMIL2Q6F5E8 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.87■■■■■ 4.29
CARMIL2Q6F5E8 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC41.87■■■■■ 4.29
CARMIL2Q6F5E8 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.87■■■■■ 4.29
CARMIL2Q6F5E8 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.87■■■■■ 4.29
CARMIL2Q6F5E8 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41.86■■■■■ 4.29
CARMIL2Q6F5E8 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC41.86■■■■■ 4.29
CARMIL2Q6F5E8 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC41.86■■■■■ 4.29
CARMIL2Q6F5E8 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC41.86■■■■■ 4.29
CARMIL2Q6F5E8 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC41.84■■■■■ 4.29
CARMIL2Q6F5E8 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC41.83■■■■■ 4.29
CARMIL2Q6F5E8 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC41.83■■■■■ 4.29
CARMIL2Q6F5E8 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.83■■■■■ 4.29
CARMIL2Q6F5E8 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.83■■■■■ 4.29
CARMIL2Q6F5E8 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.81■■■■■ 4.28
CARMIL2Q6F5E8 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC41.81■■■■■ 4.28
CARMIL2Q6F5E8 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC41.8■■■■■ 4.28
CARMIL2Q6F5E8 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.8■■■■■ 4.28
CARMIL2Q6F5E8 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC41.8■■■■■ 4.28
CARMIL2Q6F5E8 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.79■■■■■ 4.28
CARMIL2Q6F5E8 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC41.78■■■■■ 4.28
CARMIL2Q6F5E8 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.78■■■■■ 4.28
CARMIL2Q6F5E8 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC41.78■■■■■ 4.28
CARMIL2Q6F5E8 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.77■■■■■ 4.28
CARMIL2Q6F5E8 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.77■■■■■ 4.28
CARMIL2Q6F5E8 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC41.76■■■■■ 4.28
CARMIL2Q6F5E8 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC41.75■■■■■ 4.27
CARMIL2Q6F5E8 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC41.74■■■■■ 4.27
CARMIL2Q6F5E8 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC41.74■■■■■ 4.27
CARMIL2Q6F5E8 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC41.74■■■■■ 4.27
CARMIL2Q6F5E8 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.74■■■■■ 4.27
CARMIL2Q6F5E8 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC41.74■■■■■ 4.27
CARMIL2Q6F5E8 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC41.73■■■■■ 4.27
CARMIL2Q6F5E8 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.72■■■■■ 4.27
CARMIL2Q6F5E8 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC41.72■■■■■ 4.27
CARMIL2Q6F5E8 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC41.72■■■■■ 4.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.3 ms