Protein–RNA interactions for Protein: Q68CZ2

TNS3, Tensin-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,445 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNS3Q68CZ2 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.94■■■■□ 3.34
TNS3Q68CZ2 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC35.93■■■■□ 3.34
TNS3Q68CZ2 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC35.93■■■■□ 3.34
TNS3Q68CZ2 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC35.92■■■■□ 3.34
TNS3Q68CZ2 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC35.92■■■■□ 3.34
TNS3Q68CZ2 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC35.92■■■■□ 3.34
TNS3Q68CZ2 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC35.9■■■■□ 3.34
TNS3Q68CZ2 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.9■■■■□ 3.34
TNS3Q68CZ2 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC35.89■■■■□ 3.34
TNS3Q68CZ2 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.89■■■■□ 3.34
TNS3Q68CZ2 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC35.88■■■■□ 3.33
TNS3Q68CZ2 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC35.87■■■■□ 3.33
TNS3Q68CZ2 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC35.87■■■■□ 3.33
TNS3Q68CZ2 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC35.87■■■■□ 3.33
TNS3Q68CZ2 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.86■■■■□ 3.33
TNS3Q68CZ2 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC35.86■■■■□ 3.33
TNS3Q68CZ2 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC35.86■■■■□ 3.33
TNS3Q68CZ2 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC35.85■■■■□ 3.33
TNS3Q68CZ2 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC35.85■■■■□ 3.33
TNS3Q68CZ2 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC35.84■■■■□ 3.33
TNS3Q68CZ2 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.84■■■■□ 3.33
TNS3Q68CZ2 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC35.84■■■■□ 3.33
TNS3Q68CZ2 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.83■■■■□ 3.33
TNS3Q68CZ2 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC35.83■■■■□ 3.33
TNS3Q68CZ2 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.83■■■■□ 3.33
TNS3Q68CZ2 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC35.83■■■■□ 3.33
TNS3Q68CZ2 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.82■■■■□ 3.33
TNS3Q68CZ2 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.82■■■■□ 3.32
TNS3Q68CZ2 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.82■■■■□ 3.32
TNS3Q68CZ2 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC35.81■■■■□ 3.32
TNS3Q68CZ2 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.78■■■■□ 3.32
TNS3Q68CZ2 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.78■■■■□ 3.32
TNS3Q68CZ2 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.78■■■■□ 3.32
TNS3Q68CZ2 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC35.76■■■■□ 3.32
TNS3Q68CZ2 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.76■■■■□ 3.31
TNS3Q68CZ2 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC35.75■■■■□ 3.31
TNS3Q68CZ2 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC35.75■■■■□ 3.31
TNS3Q68CZ2 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.75■■■■□ 3.31
TNS3Q68CZ2 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC35.73■■■■□ 3.31
TNS3Q68CZ2 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.73■■■■□ 3.31
TNS3Q68CZ2 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35.72■■■■□ 3.31
TNS3Q68CZ2 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC35.72■■■■□ 3.31
TNS3Q68CZ2 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC35.72■■■■□ 3.31
TNS3Q68CZ2 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC35.71■■■■□ 3.31
TNS3Q68CZ2 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.71■■■■□ 3.31
TNS3Q68CZ2 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC35.71■■■■□ 3.31
TNS3Q68CZ2 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC35.71■■■■□ 3.31
TNS3Q68CZ2 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.71■■■■□ 3.31
TNS3Q68CZ2 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.7■■■■□ 3.31
TNS3Q68CZ2 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.7■■■■□ 3.31
TNS3Q68CZ2 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.69■■■■□ 3.3
TNS3Q68CZ2 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC35.69■■■■□ 3.3
TNS3Q68CZ2 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC35.68■■■■□ 3.3
TNS3Q68CZ2 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.68■■■■□ 3.3
TNS3Q68CZ2 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.68■■■■□ 3.3
TNS3Q68CZ2 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC35.68■■■■□ 3.3
TNS3Q68CZ2 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.67■■■■□ 3.3
TNS3Q68CZ2 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.67■■■■□ 3.3
TNS3Q68CZ2 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC35.66■■■■□ 3.3
TNS3Q68CZ2 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC35.66■■■■□ 3.3
TNS3Q68CZ2 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.65■■■■□ 3.3
TNS3Q68CZ2 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC35.65■■■■□ 3.3
TNS3Q68CZ2 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.64■■■■□ 3.3
TNS3Q68CZ2 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.64■■■■□ 3.3
TNS3Q68CZ2 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC35.64■■■■□ 3.3
TNS3Q68CZ2 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC35.63■■■■□ 3.29
TNS3Q68CZ2 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.62■■■■□ 3.29
TNS3Q68CZ2 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC35.62■■■■□ 3.29
TNS3Q68CZ2 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC35.61■■■■□ 3.29
TNS3Q68CZ2 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.61■■■■□ 3.29
TNS3Q68CZ2 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC35.61■■■■□ 3.29
TNS3Q68CZ2 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC35.61■■■■□ 3.29
TNS3Q68CZ2 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC35.6■■■■□ 3.29
TNS3Q68CZ2 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.6■■■■□ 3.29
TNS3Q68CZ2 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC35.59■■■■□ 3.29
TNS3Q68CZ2 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC35.57■■■■□ 3.29
TNS3Q68CZ2 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC35.57■■■■□ 3.28
TNS3Q68CZ2 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.57■■■■□ 3.28
TNS3Q68CZ2 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC35.57■■■■□ 3.28
TNS3Q68CZ2 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.57■■■■□ 3.28
TNS3Q68CZ2 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.57■■■■□ 3.28
TNS3Q68CZ2 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC35.56■■■■□ 3.28
TNS3Q68CZ2 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.56■■■■□ 3.28
TNS3Q68CZ2 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC35.56■■■■□ 3.28
TNS3Q68CZ2 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC35.55■■■■□ 3.28
TNS3Q68CZ2 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC35.55■■■■□ 3.28
TNS3Q68CZ2 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.55■■■■□ 3.28
TNS3Q68CZ2 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC35.55■■■■□ 3.28
TNS3Q68CZ2 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC35.54■■■■□ 3.28
TNS3Q68CZ2 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC35.54■■■■□ 3.28
TNS3Q68CZ2 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC35.53■■■■□ 3.28
TNS3Q68CZ2 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.53■■■■□ 3.28
TNS3Q68CZ2 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC35.52■■■■□ 3.28
TNS3Q68CZ2 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.52■■■■□ 3.28
TNS3Q68CZ2 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.51■■■■□ 3.28
TNS3Q68CZ2 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.51■■■■□ 3.27
TNS3Q68CZ2 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.5■■■■□ 3.27
TNS3Q68CZ2 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.49■■■■□ 3.27
TNS3Q68CZ2 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.49■■■■□ 3.27
TNS3Q68CZ2 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC35.49■■■■□ 3.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.4 ms