Protein–RNA interactions for Protein: Q5XPI4

RNF123, E3 ubiquitin-protein ligase RNF123, humanhuman

Predictions only

Length 1,314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF123Q5XPI4 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.27■■■■□ 3.08
RNF123Q5XPI4 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC34.25■■■■□ 3.07
RNF123Q5XPI4 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC34.25■■■■□ 3.07
RNF123Q5XPI4 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC34.24■■■■□ 3.07
RNF123Q5XPI4 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
RNF123Q5XPI4 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
RNF123Q5XPI4 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
RNF123Q5XPI4 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
RNF123Q5XPI4 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
RNF123Q5XPI4 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
RNF123Q5XPI4 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC34.23■■■■□ 3.07
RNF123Q5XPI4 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
RNF123Q5XPI4 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
RNF123Q5XPI4 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
RNF123Q5XPI4 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
RNF123Q5XPI4 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC34.2■■■■□ 3.07
RNF123Q5XPI4 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
RNF123Q5XPI4 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
RNF123Q5XPI4 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC34.19■■■■□ 3.06
RNF123Q5XPI4 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
RNF123Q5XPI4 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
RNF123Q5XPI4 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
RNF123Q5XPI4 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
RNF123Q5XPI4 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
RNF123Q5XPI4 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.16■■■■□ 3.06
RNF123Q5XPI4 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
RNF123Q5XPI4 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
RNF123Q5XPI4 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
RNF123Q5XPI4 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
RNF123Q5XPI4 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
RNF123Q5XPI4 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC34.14■■■■□ 3.06
RNF123Q5XPI4 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC34.13■■■■□ 3.05
RNF123Q5XPI4 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
RNF123Q5XPI4 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
RNF123Q5XPI4 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
RNF123Q5XPI4 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC34.12■■■■□ 3.05
RNF123Q5XPI4 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC34.12■■■■□ 3.05
RNF123Q5XPI4 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC34.11■■■■□ 3.05
RNF123Q5XPI4 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
RNF123Q5XPI4 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
RNF123Q5XPI4 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
RNF123Q5XPI4 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
RNF123Q5XPI4 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.1■■■■□ 3.05
RNF123Q5XPI4 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.1■■■■□ 3.05
RNF123Q5XPI4 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
RNF123Q5XPI4 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.09■■■■□ 3.05
RNF123Q5XPI4 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.05
RNF123Q5XPI4 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC34.07■■■■□ 3.05
RNF123Q5XPI4 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
RNF123Q5XPI4 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
RNF123Q5XPI4 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
RNF123Q5XPI4 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
RNF123Q5XPI4 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC34.06■■■■□ 3.04
RNF123Q5XPI4 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
RNF123Q5XPI4 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC34.05■■■■□ 3.04
RNF123Q5XPI4 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC34.05■■■■□ 3.04
RNF123Q5XPI4 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.05■■■■□ 3.04
RNF123Q5XPI4 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
RNF123Q5XPI4 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC34.01■■■■□ 3.04
RNF123Q5XPI4 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC34.01■■■■□ 3.03
RNF123Q5XPI4 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC34■■■■□ 3.03
RNF123Q5XPI4 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
RNF123Q5XPI4 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC34■■■■□ 3.03
RNF123Q5XPI4 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
RNF123Q5XPI4 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
RNF123Q5XPI4 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
RNF123Q5XPI4 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
RNF123Q5XPI4 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
RNF123Q5XPI4 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.97■■■■□ 3.03
RNF123Q5XPI4 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
RNF123Q5XPI4 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
RNF123Q5XPI4 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
RNF123Q5XPI4 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
RNF123Q5XPI4 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
RNF123Q5XPI4 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC33.95■■■■□ 3.03
RNF123Q5XPI4 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC33.94■■■■□ 3.02
RNF123Q5XPI4 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC33.94■■■■□ 3.02
RNF123Q5XPI4 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
RNF123Q5XPI4 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
RNF123Q5XPI4 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
RNF123Q5XPI4 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC33.93■■■■□ 3.02
RNF123Q5XPI4 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.92■■■■□ 3.02
RNF123Q5XPI4 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
RNF123Q5XPI4 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC33.92■■■■□ 3.02
RNF123Q5XPI4 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC33.92■■■■□ 3.02
RNF123Q5XPI4 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.92■■■■□ 3.02
RNF123Q5XPI4 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC33.92■■■■□ 3.02
RNF123Q5XPI4 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC33.91■■■■□ 3.02
RNF123Q5XPI4 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC33.91■■■■□ 3.02
RNF123Q5XPI4 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
RNF123Q5XPI4 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
RNF123Q5XPI4 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC33.91■■■■□ 3.02
RNF123Q5XPI4 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC33.89■■■■□ 3.02
RNF123Q5XPI4 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC33.88■■■■□ 3.01
RNF123Q5XPI4 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
RNF123Q5XPI4 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.87■■■■□ 3.01
RNF123Q5XPI4 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
RNF123Q5XPI4 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
RNF123Q5XPI4 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
RNF123Q5XPI4 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms