Protein–RNA interactions for Protein: Q5W0B7

TMEM236, Transmembrane protein 236, humanhuman

Predictions only

Length 351 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM236Q5W0B7 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TMEM236Q5W0B7 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TMEM236Q5W0B7 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
TMEM236Q5W0B7 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
TMEM236Q5W0B7 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TMEM236Q5W0B7 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TMEM236Q5W0B7 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TMEM236Q5W0B7 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TMEM236Q5W0B7 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
TMEM236Q5W0B7 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TMEM236Q5W0B7 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TMEM236Q5W0B7 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TMEM236Q5W0B7 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TMEM236Q5W0B7 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TMEM236Q5W0B7 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TMEM236Q5W0B7 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TMEM236Q5W0B7 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TMEM236Q5W0B7 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TMEM236Q5W0B7 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
TMEM236Q5W0B7 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TMEM236Q5W0B7 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TMEM236Q5W0B7 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TMEM236Q5W0B7 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
TMEM236Q5W0B7 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
TMEM236Q5W0B7 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
TMEM236Q5W0B7 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TMEM236Q5W0B7 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TMEM236Q5W0B7 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TMEM236Q5W0B7 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TMEM236Q5W0B7 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TMEM236Q5W0B7 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TMEM236Q5W0B7 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TMEM236Q5W0B7 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TMEM236Q5W0B7 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TMEM236Q5W0B7 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TMEM236Q5W0B7 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TMEM236Q5W0B7 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TMEM236Q5W0B7 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TMEM236Q5W0B7 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TMEM236Q5W0B7 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TMEM236Q5W0B7 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TMEM236Q5W0B7 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TMEM236Q5W0B7 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TMEM236Q5W0B7 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TMEM236Q5W0B7 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TMEM236Q5W0B7 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TMEM236Q5W0B7 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TMEM236Q5W0B7 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
TMEM236Q5W0B7 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TMEM236Q5W0B7 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TMEM236Q5W0B7 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TMEM236Q5W0B7 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TMEM236Q5W0B7 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TMEM236Q5W0B7 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TMEM236Q5W0B7 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TMEM236Q5W0B7 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TMEM236Q5W0B7 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TMEM236Q5W0B7 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TMEM236Q5W0B7 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TMEM236Q5W0B7 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TMEM236Q5W0B7 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TMEM236Q5W0B7 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TMEM236Q5W0B7 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TMEM236Q5W0B7 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TMEM236Q5W0B7 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TMEM236Q5W0B7 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TMEM236Q5W0B7 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TMEM236Q5W0B7 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TMEM236Q5W0B7 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TMEM236Q5W0B7 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TMEM236Q5W0B7 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TMEM236Q5W0B7 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TMEM236Q5W0B7 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TMEM236Q5W0B7 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TMEM236Q5W0B7 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TMEM236Q5W0B7 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TMEM236Q5W0B7 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TMEM236Q5W0B7 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TMEM236Q5W0B7 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TMEM236Q5W0B7 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TMEM236Q5W0B7 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TMEM236Q5W0B7 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TMEM236Q5W0B7 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TMEM236Q5W0B7 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TMEM236Q5W0B7 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TMEM236Q5W0B7 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
TMEM236Q5W0B7 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TMEM236Q5W0B7 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TMEM236Q5W0B7 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TMEM236Q5W0B7 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TMEM236Q5W0B7 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TMEM236Q5W0B7 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TMEM236Q5W0B7 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TMEM236Q5W0B7 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TMEM236Q5W0B7 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TMEM236Q5W0B7 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TMEM236Q5W0B7 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TMEM236Q5W0B7 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TMEM236Q5W0B7 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TMEM236Q5W0B7 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.2 ms