Protein–RNA interactions for Protein: Q5VZ89

DENND4C, DENN domain-containing protein 4C, humanhuman

Predictions only

Length 1,909 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DENND4CQ5VZ89 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
DENND4CQ5VZ89 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
DENND4CQ5VZ89 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
DENND4CQ5VZ89 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
DENND4CQ5VZ89 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
DENND4CQ5VZ89 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
DENND4CQ5VZ89 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
DENND4CQ5VZ89 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
DENND4CQ5VZ89 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
DENND4CQ5VZ89 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
DENND4CQ5VZ89 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
DENND4CQ5VZ89 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
DENND4CQ5VZ89 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.95
DENND4CQ5VZ89 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.94
DENND4CQ5VZ89 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.94
DENND4CQ5VZ89 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
DENND4CQ5VZ89 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
DENND4CQ5VZ89 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
DENND4CQ5VZ89 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
DENND4CQ5VZ89 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
DENND4CQ5VZ89 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
DENND4CQ5VZ89 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
DENND4CQ5VZ89 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
DENND4CQ5VZ89 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
DENND4CQ5VZ89 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
DENND4CQ5VZ89 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
DENND4CQ5VZ89 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
DENND4CQ5VZ89 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
DENND4CQ5VZ89 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.94
DENND4CQ5VZ89 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
DENND4CQ5VZ89 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
DENND4CQ5VZ89 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
DENND4CQ5VZ89 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
DENND4CQ5VZ89 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
DENND4CQ5VZ89 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
DENND4CQ5VZ89 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
DENND4CQ5VZ89 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
DENND4CQ5VZ89 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
DENND4CQ5VZ89 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC27.09■■□□□ 1.93
DENND4CQ5VZ89 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
DENND4CQ5VZ89 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
DENND4CQ5VZ89 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
DENND4CQ5VZ89 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
DENND4CQ5VZ89 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
DENND4CQ5VZ89 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
DENND4CQ5VZ89 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
DENND4CQ5VZ89 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
DENND4CQ5VZ89 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
DENND4CQ5VZ89 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
DENND4CQ5VZ89 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC27.05■■□□□ 1.92
DENND4CQ5VZ89 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
DENND4CQ5VZ89 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
DENND4CQ5VZ89 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
DENND4CQ5VZ89 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
DENND4CQ5VZ89 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
DENND4CQ5VZ89 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
DENND4CQ5VZ89 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
DENND4CQ5VZ89 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
DENND4CQ5VZ89 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
DENND4CQ5VZ89 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
DENND4CQ5VZ89 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
DENND4CQ5VZ89 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
DENND4CQ5VZ89 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
DENND4CQ5VZ89 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
DENND4CQ5VZ89 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
DENND4CQ5VZ89 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
DENND4CQ5VZ89 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
DENND4CQ5VZ89 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
DENND4CQ5VZ89 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC26.97■■□□□ 1.91
DENND4CQ5VZ89 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
DENND4CQ5VZ89 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
DENND4CQ5VZ89 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
DENND4CQ5VZ89 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.91
DENND4CQ5VZ89 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
DENND4CQ5VZ89 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
DENND4CQ5VZ89 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
DENND4CQ5VZ89 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
DENND4CQ5VZ89 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
DENND4CQ5VZ89 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
DENND4CQ5VZ89 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
DENND4CQ5VZ89 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
DENND4CQ5VZ89 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
DENND4CQ5VZ89 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
DENND4CQ5VZ89 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
DENND4CQ5VZ89 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
DENND4CQ5VZ89 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
DENND4CQ5VZ89 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
DENND4CQ5VZ89 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
DENND4CQ5VZ89 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
DENND4CQ5VZ89 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
DENND4CQ5VZ89 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
DENND4CQ5VZ89 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
DENND4CQ5VZ89 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
DENND4CQ5VZ89 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
DENND4CQ5VZ89 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
DENND4CQ5VZ89 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC26.88■■□□□ 1.89
DENND4CQ5VZ89 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
DENND4CQ5VZ89 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
DENND4CQ5VZ89 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
DENND4CQ5VZ89 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms