Protein–RNA interactions for Protein: Q5VVQ6

YOD1, Ubiquitin thioesterase OTU1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 348 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
YOD1Q5VVQ6 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
YOD1Q5VVQ6 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
YOD1Q5VVQ6 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
YOD1Q5VVQ6 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
YOD1Q5VVQ6 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
YOD1Q5VVQ6 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
YOD1Q5VVQ6 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
YOD1Q5VVQ6 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
YOD1Q5VVQ6 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
YOD1Q5VVQ6 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
YOD1Q5VVQ6 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
YOD1Q5VVQ6 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
YOD1Q5VVQ6 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC24.64■■□□□ 1.53
YOD1Q5VVQ6 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
YOD1Q5VVQ6 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
YOD1Q5VVQ6 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
YOD1Q5VVQ6 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
YOD1Q5VVQ6 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
YOD1Q5VVQ6 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
YOD1Q5VVQ6 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
YOD1Q5VVQ6 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
YOD1Q5VVQ6 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
YOD1Q5VVQ6 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
YOD1Q5VVQ6 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
YOD1Q5VVQ6 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
YOD1Q5VVQ6 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
YOD1Q5VVQ6 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
YOD1Q5VVQ6 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
YOD1Q5VVQ6 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
YOD1Q5VVQ6 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
YOD1Q5VVQ6 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
YOD1Q5VVQ6 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
YOD1Q5VVQ6 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
YOD1Q5VVQ6 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
YOD1Q5VVQ6 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
YOD1Q5VVQ6 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
YOD1Q5VVQ6 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
YOD1Q5VVQ6 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
YOD1Q5VVQ6 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
YOD1Q5VVQ6 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
YOD1Q5VVQ6 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
YOD1Q5VVQ6 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC24.59■■□□□ 1.53
YOD1Q5VVQ6 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
YOD1Q5VVQ6 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
YOD1Q5VVQ6 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
YOD1Q5VVQ6 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
YOD1Q5VVQ6 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
YOD1Q5VVQ6 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
YOD1Q5VVQ6 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
YOD1Q5VVQ6 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
YOD1Q5VVQ6 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
YOD1Q5VVQ6 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
YOD1Q5VVQ6 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
YOD1Q5VVQ6 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
YOD1Q5VVQ6 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
YOD1Q5VVQ6 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
YOD1Q5VVQ6 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
YOD1Q5VVQ6 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
YOD1Q5VVQ6 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
YOD1Q5VVQ6 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
YOD1Q5VVQ6 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
YOD1Q5VVQ6 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
YOD1Q5VVQ6 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
YOD1Q5VVQ6 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
YOD1Q5VVQ6 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
YOD1Q5VVQ6 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
YOD1Q5VVQ6 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
YOD1Q5VVQ6 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
YOD1Q5VVQ6 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
YOD1Q5VVQ6 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
YOD1Q5VVQ6 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
YOD1Q5VVQ6 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
YOD1Q5VVQ6 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
YOD1Q5VVQ6 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
YOD1Q5VVQ6 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
YOD1Q5VVQ6 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
YOD1Q5VVQ6 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
YOD1Q5VVQ6 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
YOD1Q5VVQ6 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
YOD1Q5VVQ6 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
YOD1Q5VVQ6 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
YOD1Q5VVQ6 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
YOD1Q5VVQ6 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
YOD1Q5VVQ6 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
YOD1Q5VVQ6 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
YOD1Q5VVQ6 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
YOD1Q5VVQ6 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
YOD1Q5VVQ6 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
YOD1Q5VVQ6 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
YOD1Q5VVQ6 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
YOD1Q5VVQ6 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
YOD1Q5VVQ6 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
YOD1Q5VVQ6 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
YOD1Q5VVQ6 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
YOD1Q5VVQ6 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
YOD1Q5VVQ6 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
YOD1Q5VVQ6 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
YOD1Q5VVQ6 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
YOD1Q5VVQ6 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
YOD1Q5VVQ6 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.3 ms