Protein–RNA interactions for Protein: Q5VUG0

SFMBT2, Scm-like with four MBT domains protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 894 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFMBT2Q5VUG0 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
SFMBT2Q5VUG0 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
SFMBT2Q5VUG0 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
SFMBT2Q5VUG0 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
SFMBT2Q5VUG0 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
SFMBT2Q5VUG0 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
SFMBT2Q5VUG0 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
SFMBT2Q5VUG0 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
SFMBT2Q5VUG0 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
SFMBT2Q5VUG0 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
SFMBT2Q5VUG0 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
SFMBT2Q5VUG0 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
SFMBT2Q5VUG0 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC27.94■■■□□ 2.06
SFMBT2Q5VUG0 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
SFMBT2Q5VUG0 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
SFMBT2Q5VUG0 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
SFMBT2Q5VUG0 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
SFMBT2Q5VUG0 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
SFMBT2Q5VUG0 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
SFMBT2Q5VUG0 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC27.91■■■□□ 2.06
SFMBT2Q5VUG0 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
SFMBT2Q5VUG0 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
SFMBT2Q5VUG0 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
SFMBT2Q5VUG0 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
SFMBT2Q5VUG0 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
SFMBT2Q5VUG0 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
SFMBT2Q5VUG0 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.05
SFMBT2Q5VUG0 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
SFMBT2Q5VUG0 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
SFMBT2Q5VUG0 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
SFMBT2Q5VUG0 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
SFMBT2Q5VUG0 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
SFMBT2Q5VUG0 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
SFMBT2Q5VUG0 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
SFMBT2Q5VUG0 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
SFMBT2Q5VUG0 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
SFMBT2Q5VUG0 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
SFMBT2Q5VUG0 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
SFMBT2Q5VUG0 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
SFMBT2Q5VUG0 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
SFMBT2Q5VUG0 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
SFMBT2Q5VUG0 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
SFMBT2Q5VUG0 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
SFMBT2Q5VUG0 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
SFMBT2Q5VUG0 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
SFMBT2Q5VUG0 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
SFMBT2Q5VUG0 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
SFMBT2Q5VUG0 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
SFMBT2Q5VUG0 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
SFMBT2Q5VUG0 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
SFMBT2Q5VUG0 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
SFMBT2Q5VUG0 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
SFMBT2Q5VUG0 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
SFMBT2Q5VUG0 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
SFMBT2Q5VUG0 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
SFMBT2Q5VUG0 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
SFMBT2Q5VUG0 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
SFMBT2Q5VUG0 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
SFMBT2Q5VUG0 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
SFMBT2Q5VUG0 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
SFMBT2Q5VUG0 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
SFMBT2Q5VUG0 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
SFMBT2Q5VUG0 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
SFMBT2Q5VUG0 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
SFMBT2Q5VUG0 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
SFMBT2Q5VUG0 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
SFMBT2Q5VUG0 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
SFMBT2Q5VUG0 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
SFMBT2Q5VUG0 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
SFMBT2Q5VUG0 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
SFMBT2Q5VUG0 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
SFMBT2Q5VUG0 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
SFMBT2Q5VUG0 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.03
SFMBT2Q5VUG0 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
SFMBT2Q5VUG0 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
SFMBT2Q5VUG0 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
SFMBT2Q5VUG0 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
SFMBT2Q5VUG0 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
SFMBT2Q5VUG0 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
SFMBT2Q5VUG0 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
SFMBT2Q5VUG0 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
SFMBT2Q5VUG0 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
SFMBT2Q5VUG0 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
SFMBT2Q5VUG0 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
SFMBT2Q5VUG0 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
SFMBT2Q5VUG0 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
SFMBT2Q5VUG0 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
SFMBT2Q5VUG0 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
SFMBT2Q5VUG0 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
SFMBT2Q5VUG0 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC27.72■■■□□ 2.03
SFMBT2Q5VUG0 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
SFMBT2Q5VUG0 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
SFMBT2Q5VUG0 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
SFMBT2Q5VUG0 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
SFMBT2Q5VUG0 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
SFMBT2Q5VUG0 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
SFMBT2Q5VUG0 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.7■■■□□ 2.03
SFMBT2Q5VUG0 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
SFMBT2Q5VUG0 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
SFMBT2Q5VUG0 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.3 ms