Protein–RNA interactions for Protein: Q5T9S5

CCDC18, Coiled-coil domain-containing protein 18, humanhuman

Predictions only

Length 1,454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC18Q5T9S5 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC40.98■■■■■ 4.15
CCDC18Q5T9S5 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC40.97■■■■■ 4.15
CCDC18Q5T9S5 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC40.97■■■■■ 4.15
CCDC18Q5T9S5 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.95■■■■■ 4.15
CCDC18Q5T9S5 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.95■■■■■ 4.15
CCDC18Q5T9S5 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.94■■■■■ 4.14
CCDC18Q5T9S5 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC40.94■■■■■ 4.14
CCDC18Q5T9S5 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC40.94■■■■■ 4.14
CCDC18Q5T9S5 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC40.93■■■■■ 4.14
CCDC18Q5T9S5 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC40.92■■■■■ 4.14
CCDC18Q5T9S5 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.91■■■■■ 4.14
CCDC18Q5T9S5 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.91■■■■■ 4.14
CCDC18Q5T9S5 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC40.9■■■■■ 4.14
CCDC18Q5T9S5 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.9■■■■■ 4.14
CCDC18Q5T9S5 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC40.9■■■■■ 4.14
CCDC18Q5T9S5 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC40.9■■■■■ 4.14
CCDC18Q5T9S5 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC40.9■■■■■ 4.14
CCDC18Q5T9S5 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC40.9■■■■■ 4.14
CCDC18Q5T9S5 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.9■■■■■ 4.14
CCDC18Q5T9S5 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC40.9■■■■■ 4.14
CCDC18Q5T9S5 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.88■■■■■ 4.13
CCDC18Q5T9S5 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC40.85■■■■■ 4.13
CCDC18Q5T9S5 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.85■■■■■ 4.13
CCDC18Q5T9S5 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC40.85■■■■■ 4.13
CCDC18Q5T9S5 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC40.83■■■■■ 4.13
CCDC18Q5T9S5 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.83■■■■■ 4.13
CCDC18Q5T9S5 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC40.82■■■■■ 4.13
CCDC18Q5T9S5 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.82■■■■■ 4.13
CCDC18Q5T9S5 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC40.82■■■■■ 4.12
CCDC18Q5T9S5 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC40.82■■■■■ 4.12
CCDC18Q5T9S5 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC40.82■■■■■ 4.12
CCDC18Q5T9S5 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC40.82■■■■■ 4.12
CCDC18Q5T9S5 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC40.82■■■■■ 4.12
CCDC18Q5T9S5 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.82■■■■■ 4.12
CCDC18Q5T9S5 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.82■■■■■ 4.12
CCDC18Q5T9S5 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.82■■■■■ 4.12
CCDC18Q5T9S5 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC40.81■■■■■ 4.12
CCDC18Q5T9S5 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.81■■■■■ 4.12
CCDC18Q5T9S5 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.8■■■■■ 4.12
CCDC18Q5T9S5 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC40.8■■■■■ 4.12
CCDC18Q5T9S5 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.8■■■■■ 4.12
CCDC18Q5T9S5 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC40.79■■■■■ 4.12
CCDC18Q5T9S5 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC40.78■■■■■ 4.12
CCDC18Q5T9S5 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC40.78■■■■■ 4.12
CCDC18Q5T9S5 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.78■■■■■ 4.12
CCDC18Q5T9S5 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.78■■■■■ 4.12
CCDC18Q5T9S5 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC40.77■■■■■ 4.12
CCDC18Q5T9S5 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.75■■■■■ 4.11
CCDC18Q5T9S5 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC40.73■■■■■ 4.11
CCDC18Q5T9S5 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC40.73■■■■■ 4.11
CCDC18Q5T9S5 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC40.72■■■■■ 4.11
CCDC18Q5T9S5 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC40.71■■■■■ 4.11
CCDC18Q5T9S5 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.71■■■■■ 4.11
CCDC18Q5T9S5 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC40.7■■■■■ 4.11
CCDC18Q5T9S5 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC40.7■■■■■ 4.11
CCDC18Q5T9S5 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.68■■■■■ 4.1
CCDC18Q5T9S5 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC40.68■■■■■ 4.1
CCDC18Q5T9S5 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC40.66■■■■■ 4.1
CCDC18Q5T9S5 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC40.66■■■■■ 4.1
CCDC18Q5T9S5 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.66■■■■■ 4.1
CCDC18Q5T9S5 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC40.65■■■■■ 4.1
CCDC18Q5T9S5 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC40.64■■■■■ 4.1
CCDC18Q5T9S5 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC40.64■■■■■ 4.1
CCDC18Q5T9S5 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC40.64■■■■■ 4.1
CCDC18Q5T9S5 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC40.63■■■■■ 4.09
CCDC18Q5T9S5 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC40.62■■■■■ 4.09
CCDC18Q5T9S5 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.61■■■■■ 4.09
CCDC18Q5T9S5 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC40.61■■■■■ 4.09
CCDC18Q5T9S5 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC40.6■■■■■ 4.09
CCDC18Q5T9S5 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC40.59■■■■■ 4.09
CCDC18Q5T9S5 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.59■■■■■ 4.09
CCDC18Q5T9S5 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.59■■■■■ 4.09
CCDC18Q5T9S5 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.58■■■■■ 4.09
CCDC18Q5T9S5 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC40.58■■■■■ 4.09
CCDC18Q5T9S5 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.58■■■■■ 4.09
CCDC18Q5T9S5 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.58■■■■■ 4.09
CCDC18Q5T9S5 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC40.58■■■■■ 4.09
CCDC18Q5T9S5 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC40.58■■■■■ 4.09
CCDC18Q5T9S5 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40.57■■■■■ 4.08
CCDC18Q5T9S5 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC40.57■■■■■ 4.08
CCDC18Q5T9S5 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC40.56■■■■■ 4.08
CCDC18Q5T9S5 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.56■■■■■ 4.08
CCDC18Q5T9S5 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC40.56■■■■■ 4.08
CCDC18Q5T9S5 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC40.55■■■■■ 4.08
CCDC18Q5T9S5 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.55■■■■■ 4.08
CCDC18Q5T9S5 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC40.54■■■■■ 4.08
CCDC18Q5T9S5 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.53■■■■■ 4.08
CCDC18Q5T9S5 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.51■■■■■ 4.08
CCDC18Q5T9S5 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC40.51■■■■■ 4.07
CCDC18Q5T9S5 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.51■■■■■ 4.07
CCDC18Q5T9S5 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC40.5■■■■■ 4.07
CCDC18Q5T9S5 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC40.5■■■■■ 4.07
CCDC18Q5T9S5 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC40.5■■■■■ 4.07
CCDC18Q5T9S5 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC40.5■■■■■ 4.07
CCDC18Q5T9S5 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC40.49■■■■■ 4.07
CCDC18Q5T9S5 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC40.49■■■■■ 4.07
CCDC18Q5T9S5 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC40.49■■■■■ 4.07
CCDC18Q5T9S5 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC40.49■■■■■ 4.07
CCDC18Q5T9S5 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC40.49■■■■■ 4.07
CCDC18Q5T9S5 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.49■■■■■ 4.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 92.3 ms