Protein–RNA interactions for Protein: Q5T6S3

PHF19, PHD finger protein 19, humanhuman

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF19Q5T6S3 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PHF19Q5T6S3 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PHF19Q5T6S3 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PHF19Q5T6S3 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PHF19Q5T6S3 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PHF19Q5T6S3 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PHF19Q5T6S3 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PHF19Q5T6S3 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PHF19Q5T6S3 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PHF19Q5T6S3 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PHF19Q5T6S3 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PHF19Q5T6S3 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
PHF19Q5T6S3 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PHF19Q5T6S3 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PHF19Q5T6S3 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PHF19Q5T6S3 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PHF19Q5T6S3 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PHF19Q5T6S3 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PHF19Q5T6S3 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PHF19Q5T6S3 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
PHF19Q5T6S3 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PHF19Q5T6S3 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PHF19Q5T6S3 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PHF19Q5T6S3 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PHF19Q5T6S3 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PHF19Q5T6S3 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PHF19Q5T6S3 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PHF19Q5T6S3 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PHF19Q5T6S3 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PHF19Q5T6S3 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PHF19Q5T6S3 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PHF19Q5T6S3 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PHF19Q5T6S3 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PHF19Q5T6S3 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PHF19Q5T6S3 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PHF19Q5T6S3 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PHF19Q5T6S3 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PHF19Q5T6S3 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PHF19Q5T6S3 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PHF19Q5T6S3 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PHF19Q5T6S3 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PHF19Q5T6S3 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PHF19Q5T6S3 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PHF19Q5T6S3 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PHF19Q5T6S3 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PHF19Q5T6S3 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PHF19Q5T6S3 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PHF19Q5T6S3 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PHF19Q5T6S3 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PHF19Q5T6S3 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PHF19Q5T6S3 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PHF19Q5T6S3 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PHF19Q5T6S3 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PHF19Q5T6S3 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PHF19Q5T6S3 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PHF19Q5T6S3 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PHF19Q5T6S3 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PHF19Q5T6S3 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PHF19Q5T6S3 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
PHF19Q5T6S3 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PHF19Q5T6S3 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PHF19Q5T6S3 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PHF19Q5T6S3 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PHF19Q5T6S3 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PHF19Q5T6S3 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PHF19Q5T6S3 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PHF19Q5T6S3 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PHF19Q5T6S3 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PHF19Q5T6S3 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PHF19Q5T6S3 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PHF19Q5T6S3 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PHF19Q5T6S3 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PHF19Q5T6S3 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PHF19Q5T6S3 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PHF19Q5T6S3 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PHF19Q5T6S3 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PHF19Q5T6S3 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PHF19Q5T6S3 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PHF19Q5T6S3 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PHF19Q5T6S3 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PHF19Q5T6S3 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PHF19Q5T6S3 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
PHF19Q5T6S3 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PHF19Q5T6S3 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PHF19Q5T6S3 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PHF19Q5T6S3 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PHF19Q5T6S3 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PHF19Q5T6S3 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PHF19Q5T6S3 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
PHF19Q5T6S3 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PHF19Q5T6S3 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PHF19Q5T6S3 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
PHF19Q5T6S3 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PHF19Q5T6S3 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
PHF19Q5T6S3 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PHF19Q5T6S3 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PHF19Q5T6S3 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PHF19Q5T6S3 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
PHF19Q5T6S3 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PHF19Q5T6S3 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms