Protein–RNA interactions for Protein: Q5T4F4

ZFYVE27, Protrudin, humanhuman

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZFYVE27Q5T4F4 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
ZFYVE27Q5T4F4 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
ZFYVE27Q5T4F4 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
ZFYVE27Q5T4F4 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
ZFYVE27Q5T4F4 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
ZFYVE27Q5T4F4 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
ZFYVE27Q5T4F4 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
ZFYVE27Q5T4F4 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
ZFYVE27Q5T4F4 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
ZFYVE27Q5T4F4 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
ZFYVE27Q5T4F4 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
ZFYVE27Q5T4F4 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
ZFYVE27Q5T4F4 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
ZFYVE27Q5T4F4 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
ZFYVE27Q5T4F4 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
ZFYVE27Q5T4F4 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.94
ZFYVE27Q5T4F4 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
ZFYVE27Q5T4F4 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
ZFYVE27Q5T4F4 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.94
ZFYVE27Q5T4F4 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
ZFYVE27Q5T4F4 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
ZFYVE27Q5T4F4 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
ZFYVE27Q5T4F4 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
ZFYVE27Q5T4F4 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
ZFYVE27Q5T4F4 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
ZFYVE27Q5T4F4 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
ZFYVE27Q5T4F4 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
ZFYVE27Q5T4F4 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
ZFYVE27Q5T4F4 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
ZFYVE27Q5T4F4 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
ZFYVE27Q5T4F4 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
ZFYVE27Q5T4F4 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
ZFYVE27Q5T4F4 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
ZFYVE27Q5T4F4 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
ZFYVE27Q5T4F4 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
ZFYVE27Q5T4F4 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
ZFYVE27Q5T4F4 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.92
ZFYVE27Q5T4F4 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
ZFYVE27Q5T4F4 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
ZFYVE27Q5T4F4 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
ZFYVE27Q5T4F4 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
ZFYVE27Q5T4F4 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
ZFYVE27Q5T4F4 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
ZFYVE27Q5T4F4 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
ZFYVE27Q5T4F4 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
ZFYVE27Q5T4F4 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
ZFYVE27Q5T4F4 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
ZFYVE27Q5T4F4 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
ZFYVE27Q5T4F4 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
ZFYVE27Q5T4F4 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
ZFYVE27Q5T4F4 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
ZFYVE27Q5T4F4 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
ZFYVE27Q5T4F4 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
ZFYVE27Q5T4F4 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
ZFYVE27Q5T4F4 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
ZFYVE27Q5T4F4 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
ZFYVE27Q5T4F4 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
ZFYVE27Q5T4F4 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
ZFYVE27Q5T4F4 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
ZFYVE27Q5T4F4 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
ZFYVE27Q5T4F4 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
ZFYVE27Q5T4F4 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
ZFYVE27Q5T4F4 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
ZFYVE27Q5T4F4 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC27■■□□□ 1.91
ZFYVE27Q5T4F4 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
ZFYVE27Q5T4F4 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
ZFYVE27Q5T4F4 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
ZFYVE27Q5T4F4 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
ZFYVE27Q5T4F4 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
ZFYVE27Q5T4F4 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC26.99■■□□□ 1.91
ZFYVE27Q5T4F4 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
ZFYVE27Q5T4F4 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
ZFYVE27Q5T4F4 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
ZFYVE27Q5T4F4 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
ZFYVE27Q5T4F4 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
ZFYVE27Q5T4F4 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
ZFYVE27Q5T4F4 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
ZFYVE27Q5T4F4 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
ZFYVE27Q5T4F4 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
ZFYVE27Q5T4F4 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
ZFYVE27Q5T4F4 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
ZFYVE27Q5T4F4 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
ZFYVE27Q5T4F4 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
ZFYVE27Q5T4F4 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
ZFYVE27Q5T4F4 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
ZFYVE27Q5T4F4 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
ZFYVE27Q5T4F4 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
ZFYVE27Q5T4F4 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
ZFYVE27Q5T4F4 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
ZFYVE27Q5T4F4 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
ZFYVE27Q5T4F4 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
ZFYVE27Q5T4F4 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
ZFYVE27Q5T4F4 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
ZFYVE27Q5T4F4 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
ZFYVE27Q5T4F4 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
ZFYVE27Q5T4F4 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
ZFYVE27Q5T4F4 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
ZFYVE27Q5T4F4 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
ZFYVE27Q5T4F4 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
ZFYVE27Q5T4F4 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 92.9 ms