Protein–RNA interactions for Protein: Q5SGD2

PPM1L, Protein phosphatase 1L, humanhuman

Predictions only

Length 360 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPM1LQ5SGD2 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
PPM1LQ5SGD2 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
PPM1LQ5SGD2 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
PPM1LQ5SGD2 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
PPM1LQ5SGD2 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
PPM1LQ5SGD2 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
PPM1LQ5SGD2 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
PPM1LQ5SGD2 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
PPM1LQ5SGD2 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
PPM1LQ5SGD2 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
PPM1LQ5SGD2 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
PPM1LQ5SGD2 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
PPM1LQ5SGD2 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
PPM1LQ5SGD2 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
PPM1LQ5SGD2 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
PPM1LQ5SGD2 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
PPM1LQ5SGD2 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
PPM1LQ5SGD2 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
PPM1LQ5SGD2 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
PPM1LQ5SGD2 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
PPM1LQ5SGD2 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC27.56■■■□□ 2
PPM1LQ5SGD2 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
PPM1LQ5SGD2 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
PPM1LQ5SGD2 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
PPM1LQ5SGD2 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC27.56■■■□□ 2
PPM1LQ5SGD2 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
PPM1LQ5SGD2 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
PPM1LQ5SGD2 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
PPM1LQ5SGD2 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
PPM1LQ5SGD2 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC27.54■■■□□ 2
PPM1LQ5SGD2 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
PPM1LQ5SGD2 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
PPM1LQ5SGD2 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
PPM1LQ5SGD2 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
PPM1LQ5SGD2 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
PPM1LQ5SGD2 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
PPM1LQ5SGD2 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
PPM1LQ5SGD2 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
PPM1LQ5SGD2 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
PPM1LQ5SGD2 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
PPM1LQ5SGD2 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
PPM1LQ5SGD2 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
PPM1LQ5SGD2 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
PPM1LQ5SGD2 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
PPM1LQ5SGD2 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
PPM1LQ5SGD2 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
PPM1LQ5SGD2 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
PPM1LQ5SGD2 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
PPM1LQ5SGD2 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
PPM1LQ5SGD2 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
PPM1LQ5SGD2 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
PPM1LQ5SGD2 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
PPM1LQ5SGD2 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
PPM1LQ5SGD2 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
PPM1LQ5SGD2 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
PPM1LQ5SGD2 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
PPM1LQ5SGD2 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
PPM1LQ5SGD2 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
PPM1LQ5SGD2 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
PPM1LQ5SGD2 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
PPM1LQ5SGD2 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
PPM1LQ5SGD2 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
PPM1LQ5SGD2 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
PPM1LQ5SGD2 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
PPM1LQ5SGD2 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
PPM1LQ5SGD2 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
PPM1LQ5SGD2 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
PPM1LQ5SGD2 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
PPM1LQ5SGD2 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
PPM1LQ5SGD2 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
PPM1LQ5SGD2 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
PPM1LQ5SGD2 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
PPM1LQ5SGD2 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
PPM1LQ5SGD2 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
PPM1LQ5SGD2 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.98
PPM1LQ5SGD2 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
PPM1LQ5SGD2 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
PPM1LQ5SGD2 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
PPM1LQ5SGD2 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
PPM1LQ5SGD2 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
PPM1LQ5SGD2 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
PPM1LQ5SGD2 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
PPM1LQ5SGD2 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC27.36■■□□□ 1.97
PPM1LQ5SGD2 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
PPM1LQ5SGD2 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
PPM1LQ5SGD2 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
PPM1LQ5SGD2 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
PPM1LQ5SGD2 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
PPM1LQ5SGD2 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.97
PPM1LQ5SGD2 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.96
PPM1LQ5SGD2 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.96
PPM1LQ5SGD2 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.96
PPM1LQ5SGD2 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
PPM1LQ5SGD2 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
PPM1LQ5SGD2 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
PPM1LQ5SGD2 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
PPM1LQ5SGD2 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
PPM1LQ5SGD2 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
PPM1LQ5SGD2 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
PPM1LQ5SGD2 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.1 ms