Protein–RNA interactions for Protein: Q5NUL3

FFAR4, Free fatty acid receptor 4, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FFAR4Q5NUL3 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
FFAR4Q5NUL3 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
FFAR4Q5NUL3 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
FFAR4Q5NUL3 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
FFAR4Q5NUL3 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
FFAR4Q5NUL3 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
FFAR4Q5NUL3 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
FFAR4Q5NUL3 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
FFAR4Q5NUL3 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
FFAR4Q5NUL3 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
FFAR4Q5NUL3 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
FFAR4Q5NUL3 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
FFAR4Q5NUL3 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
FFAR4Q5NUL3 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
FFAR4Q5NUL3 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
FFAR4Q5NUL3 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
FFAR4Q5NUL3 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
FFAR4Q5NUL3 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
FFAR4Q5NUL3 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
FFAR4Q5NUL3 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
FFAR4Q5NUL3 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
FFAR4Q5NUL3 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
FFAR4Q5NUL3 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
FFAR4Q5NUL3 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
FFAR4Q5NUL3 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
FFAR4Q5NUL3 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
FFAR4Q5NUL3 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
FFAR4Q5NUL3 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
FFAR4Q5NUL3 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
FFAR4Q5NUL3 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
FFAR4Q5NUL3 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
FFAR4Q5NUL3 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
FFAR4Q5NUL3 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
FFAR4Q5NUL3 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
FFAR4Q5NUL3 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
FFAR4Q5NUL3 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
FFAR4Q5NUL3 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
FFAR4Q5NUL3 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
FFAR4Q5NUL3 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
FFAR4Q5NUL3 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
FFAR4Q5NUL3 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
FFAR4Q5NUL3 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
FFAR4Q5NUL3 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
FFAR4Q5NUL3 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
FFAR4Q5NUL3 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
FFAR4Q5NUL3 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
FFAR4Q5NUL3 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
FFAR4Q5NUL3 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
FFAR4Q5NUL3 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
FFAR4Q5NUL3 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
FFAR4Q5NUL3 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
FFAR4Q5NUL3 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
FFAR4Q5NUL3 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
FFAR4Q5NUL3 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
FFAR4Q5NUL3 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
FFAR4Q5NUL3 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
FFAR4Q5NUL3 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
FFAR4Q5NUL3 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
FFAR4Q5NUL3 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
FFAR4Q5NUL3 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
FFAR4Q5NUL3 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
FFAR4Q5NUL3 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
FFAR4Q5NUL3 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
FFAR4Q5NUL3 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
FFAR4Q5NUL3 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
FFAR4Q5NUL3 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
FFAR4Q5NUL3 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
FFAR4Q5NUL3 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
FFAR4Q5NUL3 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
FFAR4Q5NUL3 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
FFAR4Q5NUL3 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
FFAR4Q5NUL3 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
FFAR4Q5NUL3 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
FFAR4Q5NUL3 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
FFAR4Q5NUL3 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
FFAR4Q5NUL3 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
FFAR4Q5NUL3 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
FFAR4Q5NUL3 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
FFAR4Q5NUL3 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
FFAR4Q5NUL3 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.84
FFAR4Q5NUL3 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
FFAR4Q5NUL3 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
FFAR4Q5NUL3 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
FFAR4Q5NUL3 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
FFAR4Q5NUL3 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
FFAR4Q5NUL3 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
FFAR4Q5NUL3 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
FFAR4Q5NUL3 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
FFAR4Q5NUL3 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
FFAR4Q5NUL3 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
FFAR4Q5NUL3 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
FFAR4Q5NUL3 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
FFAR4Q5NUL3 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
FFAR4Q5NUL3 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
FFAR4Q5NUL3 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
FFAR4Q5NUL3 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
FFAR4Q5NUL3 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
FFAR4Q5NUL3 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
FFAR4Q5NUL3 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
FFAR4Q5NUL3 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.1 ms