Protein–RNA interactions for Protein: Q5K4L6

SLC27A3, Long-chain fatty acid transport protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 730 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC27A3Q5K4L6 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC33.93■■■■□ 3.02
SLC27A3Q5K4L6 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
SLC27A3Q5K4L6 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC33.92■■■■□ 3.02
SLC27A3Q5K4L6 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC33.92■■■■□ 3.02
SLC27A3Q5K4L6 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.9■■■■□ 3.02
SLC27A3Q5K4L6 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
SLC27A3Q5K4L6 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.9■■■■□ 3.02
SLC27A3Q5K4L6 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
SLC27A3Q5K4L6 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.89■■■■□ 3.02
SLC27A3Q5K4L6 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.89■■■■□ 3.02
SLC27A3Q5K4L6 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
SLC27A3Q5K4L6 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.86■■■■□ 3.01
SLC27A3Q5K4L6 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.86■■■■□ 3.01
SLC27A3Q5K4L6 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
SLC27A3Q5K4L6 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
SLC27A3Q5K4L6 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
SLC27A3Q5K4L6 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.85■■■■□ 3.01
SLC27A3Q5K4L6 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
SLC27A3Q5K4L6 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.83■■■■□ 3.01
SLC27A3Q5K4L6 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
SLC27A3Q5K4L6 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC33.82■■■■□ 3
SLC27A3Q5K4L6 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC33.82■■■■□ 3
SLC27A3Q5K4L6 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC33.82■■■■□ 3
SLC27A3Q5K4L6 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC33.82■■■■□ 3
SLC27A3Q5K4L6 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
SLC27A3Q5K4L6 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
SLC27A3Q5K4L6 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.8■■■■□ 3
SLC27A3Q5K4L6 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
SLC27A3Q5K4L6 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
SLC27A3Q5K4L6 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
SLC27A3Q5K4L6 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC33.79■■■■□ 3
SLC27A3Q5K4L6 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
SLC27A3Q5K4L6 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC33.77■■■■□ 3
SLC27A3Q5K4L6 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC33.77■■■■□ 3
SLC27A3Q5K4L6 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■□□ 2.99
SLC27A3Q5K4L6 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC33.75■■■□□ 2.99
SLC27A3Q5K4L6 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC33.74■■■□□ 2.99
SLC27A3Q5K4L6 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC33.73■■■□□ 2.99
SLC27A3Q5K4L6 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC33.73■■■□□ 2.99
SLC27A3Q5K4L6 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
SLC27A3Q5K4L6 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
SLC27A3Q5K4L6 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
SLC27A3Q5K4L6 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
SLC27A3Q5K4L6 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC33.72■■■□□ 2.99
SLC27A3Q5K4L6 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
SLC27A3Q5K4L6 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
SLC27A3Q5K4L6 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.71■■■□□ 2.99
SLC27A3Q5K4L6 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
SLC27A3Q5K4L6 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC33.7■■■□□ 2.99
SLC27A3Q5K4L6 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
SLC27A3Q5K4L6 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
SLC27A3Q5K4L6 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.98
SLC27A3Q5K4L6 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
SLC27A3Q5K4L6 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
SLC27A3Q5K4L6 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
SLC27A3Q5K4L6 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC33.68■■■□□ 2.98
SLC27A3Q5K4L6 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
SLC27A3Q5K4L6 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
SLC27A3Q5K4L6 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
SLC27A3Q5K4L6 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.67■■■□□ 2.98
SLC27A3Q5K4L6 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
SLC27A3Q5K4L6 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC33.66■■■□□ 2.98
SLC27A3Q5K4L6 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
SLC27A3Q5K4L6 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC33.65■■■□□ 2.98
SLC27A3Q5K4L6 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC33.65■■■□□ 2.98
SLC27A3Q5K4L6 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC33.64■■■□□ 2.98
SLC27A3Q5K4L6 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.63■■■□□ 2.97
SLC27A3Q5K4L6 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC33.62■■■□□ 2.97
SLC27A3Q5K4L6 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC33.62■■■□□ 2.97
SLC27A3Q5K4L6 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
SLC27A3Q5K4L6 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC33.62■■■□□ 2.97
SLC27A3Q5K4L6 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC33.61■■■□□ 2.97
SLC27A3Q5K4L6 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
SLC27A3Q5K4L6 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
SLC27A3Q5K4L6 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
SLC27A3Q5K4L6 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.97
SLC27A3Q5K4L6 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC33.56■■■□□ 2.96
SLC27A3Q5K4L6 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC33.56■■■□□ 2.96
SLC27A3Q5K4L6 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
SLC27A3Q5K4L6 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.55■■■□□ 2.96
SLC27A3Q5K4L6 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
SLC27A3Q5K4L6 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC33.55■■■□□ 2.96
SLC27A3Q5K4L6 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC33.55■■■□□ 2.96
SLC27A3Q5K4L6 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
SLC27A3Q5K4L6 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC33.54■■■□□ 2.96
SLC27A3Q5K4L6 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC33.54■■■□□ 2.96
SLC27A3Q5K4L6 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
SLC27A3Q5K4L6 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC33.53■■■□□ 2.96
SLC27A3Q5K4L6 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC33.53■■■□□ 2.96
SLC27A3Q5K4L6 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
SLC27A3Q5K4L6 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
SLC27A3Q5K4L6 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.96
SLC27A3Q5K4L6 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.51■■■□□ 2.95
SLC27A3Q5K4L6 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC33.51■■■□□ 2.95
SLC27A3Q5K4L6 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC33.51■■■□□ 2.95
SLC27A3Q5K4L6 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC33.5■■■□□ 2.95
SLC27A3Q5K4L6 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC33.5■■■□□ 2.95
SLC27A3Q5K4L6 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
SLC27A3Q5K4L6 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
SLC27A3Q5K4L6 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 142.7 ms