Protein–RNA interactions for Protein: Q4G0J3

LARP7, La-related protein 7, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 582 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LARP7Q4G0J3 TH2LCRR-201ENST00000417516 390 ntTSL 26.05□□□□□ -1.444e-6■■■■■ 36.7
LARP7Q4G0J3 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC19.11■□□□□ 0.651e-323■■■■■ 36.7
LARP7Q4G0J3 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC16.33■□□□□ 0.21e-323■■■■■ 36.7
LARP7Q4G0J3 SNHG9-201ENST00000531523 275 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.081e-323■■■■■ 36.7
LARP7Q4G0J3 NOP58-207ENST00000478941 508 ntTSL 35.87□□□□□ -1.475e-29■■■■■ 36.6
LARP7Q4G0J3 SNORD70.1-201ENST00000391007 85 ntBASIC5.31□□□□□ -1.565e-29■■■■■ 36.6
LARP7Q4G0J3 TAF1D-207ENST00000527169 1127 ntTSL 516.84■□□□□ 0.292e-41■■■■■ 36.5
LARP7Q4G0J3 TAF1D-214ENST00000530089 1429 ntTSL 39□□□□□ -0.972e-41■■■■■ 36.5
LARP7Q4G0J3 TAF1D-218ENST00000533794 505 ntTSL 28.73□□□□□ -1.012e-41■■■■■ 36.5
LARP7Q4G0J3 TAF1D-212ENST00000529794 1123 ntTSL 28.68□□□□□ -1.022e-41■■■■■ 36.5
LARP7Q4G0J3 SNORD3C-201ENST00000580533 581 ntBASIC11.23□□□□□ -0.611e-15■■■■■ 36.3
LARP7Q4G0J3 SNORD3C-203ENST00000625845 217 nt10.67□□□□□ -0.71e-15■■■■■ 36.3
LARP7Q4G0J3 SNORD3C-202ENST00000620446 218 nt10.51□□□□□ -0.731e-15■■■■■ 36.3
LARP7Q4G0J3 NOP58-201ENST00000264279 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.217e-16■■■■■ 35.1
LARP7Q4G0J3 RN7SKP98-201ENST00000517070 156 ntBASIC7.36□□□□□ -1.233e-10■■■■■ 35.1
LARP7Q4G0J3 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.221e-7■■■■■ 33.9
LARP7Q4G0J3 RC3H2-205ENST00000423239 3623 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.262e-9■■■■■ 33.9
LARP7Q4G0J3 RC3H2-201ENST00000335387 3081 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.282e-9■■■■■ 33.9
LARP7Q4G0J3 RC3H2-210ENST00000498479 5746 ntTSL 212.75□□□□□ -0.372e-9■■■■■ 33.9
LARP7Q4G0J3 RC3H2-202ENST00000357244 3991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.672e-9■■■■■ 33.9
LARP7Q4G0J3 RC3H2-203ENST00000373670 9248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.41□□□□□ -1.72e-9■■■■■ 33.9
LARP7Q4G0J3 SNORD90-201ENST00000391145 111 ntBASIC1.15□□□□□ -2.232e-9■■■■■ 33.9
LARP7Q4G0J3 RPL4-201ENST00000307961 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.613e-48■■■■■ 33.7
LARP7Q4G0J3 RPL4-214ENST00000567229 2003 ntTSL 511.11□□□□□ -0.633e-48■■■■■ 33.7
LARP7Q4G0J3 RPL4-215ENST00000568588 1864 ntTSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.73e-48■■■■■ 33.7
LARP7Q4G0J3 RPL4-217ENST00000569696 569 ntTSL 510.57□□□□□ -0.723e-48■■■■■ 33.7
LARP7Q4G0J3 RPL4-210ENST00000566039 1099 ntTSL 28.69□□□□□ -1.023e-48■■■■■ 33.7
LARP7Q4G0J3 RPL4-203ENST00000561775 1396 ntTSL 57.35□□□□□ -1.233e-48■■■■■ 33.7
LARP7Q4G0J3 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.976e-7■■■■■ 33.5
LARP7Q4G0J3 TBC1D22A-204ENST00000394449 2048 ntTSL 520.54■□□□□ 0.886e-7■■■■■ 33.5
LARP7Q4G0J3 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.866e-7■■■■■ 33.5
LARP7Q4G0J3 TBC1D22A-205ENST00000406733 2267 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.196e-7■■■■■ 33.5
LARP7Q4G0J3 TBC1D22A-201ENST00000337137 3787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.066e-7■■■■■ 33.5
LARP7Q4G0J3 TBC1D22A-207ENST00000441162 2636 ntTSL 213.96□□□□□ -0.176e-7■■■■■ 33.5
LARP7Q4G0J3 TBC1D22A-203ENST00000380995 3934 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.256e-7■■■■■ 33.5
LARP7Q4G0J3 RPL4-216ENST00000569438 565 ntTSL 514.04□□□□□ -0.165e-48■■■■■ 31.9
LARP7Q4G0J3 RPL4-212ENST00000566622 817 ntTSL 213.34□□□□□ -0.275e-48■■■■■ 31.9
LARP7Q4G0J3 RPL4-205ENST00000564439 582 ntTSL 310.29□□□□□ -0.765e-48■■■■■ 31.9
LARP7Q4G0J3 RPL23A-207ENST00000578181 593 ntTSL 25.18□□□□□ -1.588e-11■■■■■ 31.8
LARP7Q4G0J3 SNORD45A-201ENST00000384512 84 ntBASIC0.58□□□□□ -2.321e-323■■■■■ 31.7
LARP7Q4G0J3 GAS5-207ENST00000422207 643 ntTSL 25.91□□□□□ -1.467e-52■■■■■ 31.3
LARP7Q4G0J3 GAS5-225ENST00000454813 621 ntTSL 35.83□□□□□ -1.487e-52■■■■■ 31.3
LARP7Q4G0J3 GAS5-217ENST00000444470 424 ntTSL 25.4□□□□□ -1.547e-52■■■■■ 31.3
LARP7Q4G0J3 GAS5-212ENST00000434796 575 ntTSL 24.51□□□□□ -1.697e-52■■■■■ 31.3
LARP7Q4G0J3 GAS5-202ENST00000414075 413 ntTSL 2 BASIC5.81□□□□□ -1.482e-30■■■■■ 30.1
LARP7Q4G0J3 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.671e-6■■■■■ 29.6
LARP7Q4G0J3 ING5-206ENST00000482774 2376 ntTSL 318.29■□□□□ 0.521e-6■■■■■ 29.6
LARP7Q4G0J3 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.41e-6■■■■■ 29.6
LARP7Q4G0J3 ING5-213ENST00000636051 4199 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.161e-6■■■■■ 29.6
LARP7Q4G0J3 ING5-210ENST00000492488 822 ntTSL 214.82□□□□□ -0.041e-6■■■■■ 29.6
LARP7Q4G0J3 ING5-209ENST00000489509 920 ntTSL 214.65□□□□□ -0.061e-6■■■■■ 29.6
LARP7Q4G0J3 ING5-211ENST00000493261 543 ntTSL 210.78□□□□□ -0.681e-6■■■■■ 29.6
LARP7Q4G0J3 ING5-204ENST00000445620 662 ntTSL 36.18□□□□□ -1.421e-6■■■■■ 29.6
LARP7Q4G0J3 TAF1D-205ENST00000526015 1735 ntTSL 1 (best)17.8■□□□□ 0.441e-41■■■■■ 29.5
LARP7Q4G0J3 TAF1D-201ENST00000323981 2540 ntTSL 213.96□□□□□ -0.181e-41■■■■■ 29.5
LARP7Q4G0J3 TAF1D-204ENST00000525928 1710 ntTSL 29.88□□□□□ -0.831e-41■■■■■ 29.5
LARP7Q4G0J3 TAF1D-210ENST00000529435 1011 ntTSL 57.82□□□□□ -1.161e-41■■■■■ 29.5
LARP7Q4G0J3 TAF1D-215ENST00000530769 4358 ntTSL 27.18□□□□□ -1.261e-41■■■■■ 29.5
LARP7Q4G0J3 TAF1D-221ENST00000540232 483 ntTSL 36.92□□□□□ -1.31e-41■■■■■ 29.5
LARP7Q4G0J3 TAF1D-202ENST00000393259 547 ntTSL 36.49□□□□□ -1.371e-41■■■■■ 29.5
LARP7Q4G0J3 TAF1D-222ENST00000546088 1728 ntTSL 36.13□□□□□ -1.431e-41■■■■■ 29.5
LARP7Q4G0J3 EPB41L4A-AS1-202ENST00000427306 1367 ntTSL 222.63■■□□□ 1.217e-17■■■■■ 29.4
LARP7Q4G0J3 EPB41L4A-AS1-203ENST00000442823 578 ntTSL 217.09■□□□□ 0.337e-17■■■■■ 29.4
LARP7Q4G0J3 EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 2969 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.287e-17■■■■■ 29.4
LARP7Q4G0J3 EPB41L4A-AS1-204ENST00000508590 292 ntTSL 316.07■□□□□ 0.167e-17■■■■■ 29.4
LARP7Q4G0J3 SNORA13-201ENST00000458790 133 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.467e-17■■■■■ 29.4
LARP7Q4G0J3 RABGGTB-201ENST00000319942 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.899e-54■■■■■ 28.8
LARP7Q4G0J3 RABGGTB-205ENST00000462042 569 ntTSL 39.27□□□□□ -0.939e-54■■■■■ 28.8
LARP7Q4G0J3 RABGGTB-209ENST00000473406 721 ntTSL 58.8□□□□□ -19e-54■■■■■ 28.8
LARP7Q4G0J3 RABGGTB-210ENST00000485459 788 ntTSL 57.76□□□□□ -1.179e-54■■■■■ 28.8
LARP7Q4G0J3 RABGGTB-212ENST00000491266 961 ntTSL 37.74□□□□□ -1.179e-54■■■■■ 28.8
LARP7Q4G0J3 RABGGTB-207ENST00000470201 848 ntTSL 37.31□□□□□ -1.249e-54■■■■■ 28.8
LARP7Q4G0J3 RABGGTB-208ENST00000471759 2137 ntTSL 27.24□□□□□ -1.259e-54■■■■■ 28.8
LARP7Q4G0J3 RABGGTB-202ENST00000370826 512 ntTSL 2 BASIC6.76□□□□□ -1.339e-54■■■■■ 28.8
LARP7Q4G0J3 RABGGTB-213ENST00000496055 3863 ntTSL 25.26□□□□□ -1.579e-54■■■■■ 28.8
LARP7Q4G0J3 SLC2A1-201ENST00000372500 533 ntTSL 315.44■□□□□ 0.061e-6■■■■■ 28.6
LARP7Q4G0J3 PID1-202ENST00000392054 2745 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.071e-8■■■■■ 28.6
LARP7Q4G0J3 PID1-204ENST00000409462 2387 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.231e-8■■■■■ 28.6
LARP7Q4G0J3 PID1-203ENST00000392055 2533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.31e-8■■■■■ 28.6
LARP7Q4G0J3 PID1-206ENST00000534952 553 ntTSL 413.08□□□□□ -0.321e-8■■■■■ 28.6
LARP7Q4G0J3 PID1-205ENST00000482518 479 ntTSL 29.31□□□□□ -0.921e-8■■■■■ 28.6
LARP7Q4G0J3 PID1-201ENST00000354069 839 ntTSL 3 BASIC8.37□□□□□ -1.071e-8■■■■■ 28.6
LARP7Q4G0J3 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.263e-7■■■■■ 28.4
LARP7Q4G0J3 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.093e-7■■■■■ 28.4
LARP7Q4G0J3 HSP90B1-203ENST00000548462 3032 ntTSL 211.91□□□□□ -0.53e-7■■■■■ 28.4
LARP7Q4G0J3 RNA5SP149-201ENST00000364952 92 ntBASIC7.68□□□□□ -1.183e-50■■■■■ 27.9
LARP7Q4G0J3 ALB-208ENST00000495173 445 ntTSL 35.82□□□□□ -1.481e-9■■■■■ 27.9
LARP7Q4G0J3 ALB-213ENST00000508932 369 ntTSL 34.35□□□□□ -1.711e-9■■■■■ 27.9
LARP7Q4G0J3 AFP-203ENST00000506820 476 ntTSL 26.08□□□□□ -1.447e-35■■■■■ 27.6
LARP7Q4G0J3 SNHG16-208ENST00000591956 556 ntTSL 211.02□□□□□ -0.657e-31■■■■■ 27.6
LARP7Q4G0J3 SNHG16-201ENST00000448136 3607 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.77e-31■■■■■ 27.6
LARP7Q4G0J3 SNHG16-204ENST00000586942 568 ntTSL 4 BASIC9.73□□□□□ -0.857e-31■■■■■ 27.6
LARP7Q4G0J3 SNHG16-207ENST00000590435 1947 ntTSL 5 BASIC9.1□□□□□ -0.957e-31■■■■■ 27.6
LARP7Q4G0J3 SNHG16-202ENST00000493536 2424 ntTSL 1 (best)8.29□□□□□ -1.087e-31■■■■■ 27.6
LARP7Q4G0J3 SNHG16-206ENST00000587838 884 ntTSL 35.13□□□□□ -1.597e-31■■■■■ 27.6
LARP7Q4G0J3 RPL23A-206ENST00000496182 636 ntTSL 3 BASIC14.39□□□□□ -0.114e-11■■■■■ 27.3
LARP7Q4G0J3 RPL23A-204ENST00000422514 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.374e-11■■■■■ 27.3
LARP7Q4G0J3 RPL23A-205ENST00000472628 639 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.714e-11■■■■■ 27.3
LARP7Q4G0J3 RPL23A-202ENST00000394935 580 ntTSL 39.53□□□□□ -0.884e-11■■■■■ 27.3
LARP7Q4G0J3 RPL23A-201ENST00000355731 587 ntTSL 59.07□□□□□ -0.964e-11■■■■■ 27.3
Retrieved 100 of 2,094 protein–RNA pairs in 65.6 ms