Protein–RNA interactions for Protein: Q4G0J3

LARP7, La-related protein 7, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 582 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LARP7Q4G0J3 TH2LCRR-201ENST00000417516 390 ntTSL 26.05□□□□□ -1.444e-6■■■■■ 36.7
LARP7Q4G0J3 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC19.11■□□□□ 0.651e-323■■■■■ 36.7
LARP7Q4G0J3 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC16.33■□□□□ 0.21e-323■■■■■ 36.7
LARP7Q4G0J3 SNHG9-201ENST00000531523 275 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.081e-323■■■■■ 36.7
LARP7Q4G0J3 NOP58-207ENST00000478941 508 ntTSL 35.87□□□□□ -1.475e-29■■■■■ 36.6
LARP7Q4G0J3 SNORD70.1-201ENST00000391007 85 ntBASIC5.31□□□□□ -1.565e-29■■■■■ 36.6
LARP7Q4G0J3 TAF1D-207ENST00000527169 1127 ntTSL 516.84■□□□□ 0.292e-41■■■■■ 36.5
LARP7Q4G0J3 TAF1D-214ENST00000530089 1429 ntTSL 39□□□□□ -0.972e-41■■■■■ 36.5
LARP7Q4G0J3 TAF1D-218ENST00000533794 505 ntTSL 28.73□□□□□ -1.012e-41■■■■■ 36.5
LARP7Q4G0J3 TAF1D-212ENST00000529794 1123 ntTSL 28.68□□□□□ -1.022e-41■■■■■ 36.5
LARP7Q4G0J3 SNORD3C-201ENST00000580533 581 ntBASIC11.23□□□□□ -0.611e-15■■■■■ 36.3
LARP7Q4G0J3 SNORD3C-203ENST00000625845 217 nt10.67□□□□□ -0.71e-15■■■■■ 36.3
LARP7Q4G0J3 SNORD3C-202ENST00000620446 218 nt10.51□□□□□ -0.731e-15■■■■■ 36.3
LARP7Q4G0J3 NOP58-201ENST00000264279 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.217e-16■■■■■ 35.1
LARP7Q4G0J3 RN7SKP98-201ENST00000517070 156 ntBASIC7.36□□□□□ -1.233e-10■■■■■ 35.1
LARP7Q4G0J3 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.221e-7■■■■■ 33.9
LARP7Q4G0J3 RC3H2-205ENST00000423239 3623 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.262e-9■■■■■ 33.9
LARP7Q4G0J3 RC3H2-201ENST00000335387 3081 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.282e-9■■■■■ 33.9
LARP7Q4G0J3 RC3H2-210ENST00000498479 5746 ntTSL 212.75□□□□□ -0.372e-9■■■■■ 33.9
LARP7Q4G0J3 RC3H2-202ENST00000357244 3991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.672e-9■■■■■ 33.9
LARP7Q4G0J3 RC3H2-203ENST00000373670 9248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.41□□□□□ -1.72e-9■■■■■ 33.9
LARP7Q4G0J3 SNORD90-201ENST00000391145 111 ntBASIC1.15□□□□□ -2.232e-9■■■■■ 33.9
LARP7Q4G0J3 RPL4-201ENST00000307961 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.613e-48■■■■■ 33.7
LARP7Q4G0J3 RPL4-214ENST00000567229 2003 ntTSL 511.11□□□□□ -0.633e-48■■■■■ 33.7
LARP7Q4G0J3 RPL4-215ENST00000568588 1864 ntTSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.73e-48■■■■■ 33.7
LARP7Q4G0J3 RPL4-217ENST00000569696 569 ntTSL 510.57□□□□□ -0.723e-48■■■■■ 33.7
LARP7Q4G0J3 RPL4-210ENST00000566039 1099 ntTSL 28.69□□□□□ -1.023e-48■■■■■ 33.7
LARP7Q4G0J3 RPL4-203ENST00000561775 1396 ntTSL 57.35□□□□□ -1.233e-48■■■■■ 33.7
LARP7Q4G0J3 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.976e-7■■■■■ 33.5
LARP7Q4G0J3 TBC1D22A-204ENST00000394449 2048 ntTSL 520.54■□□□□ 0.886e-7■■■■■ 33.5
LARP7Q4G0J3 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.866e-7■■■■■ 33.5
LARP7Q4G0J3 TBC1D22A-205ENST00000406733 2267 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.196e-7■■■■■ 33.5
LARP7Q4G0J3 TBC1D22A-201ENST00000337137 3787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.066e-7■■■■■ 33.5
LARP7Q4G0J3 TBC1D22A-207ENST00000441162 2636 ntTSL 213.96□□□□□ -0.176e-7■■■■■ 33.5
LARP7Q4G0J3 TBC1D22A-203ENST00000380995 3934 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.256e-7■■■■■ 33.5
LARP7Q4G0J3 RPL4-216ENST00000569438 565 ntTSL 514.04□□□□□ -0.165e-48■■■■■ 31.9
LARP7Q4G0J3 RPL4-212ENST00000566622 817 ntTSL 213.34□□□□□ -0.275e-48■■■■■ 31.9
LARP7Q4G0J3 RPL4-205ENST00000564439 582 ntTSL 310.29□□□□□ -0.765e-48■■■■■ 31.9
LARP7Q4G0J3 RPL23A-207ENST00000578181 593 ntTSL 25.18□□□□□ -1.588e-11■■■■■ 31.8
LARP7Q4G0J3 SNORD45A-201ENST00000384512 84 ntBASIC0.58□□□□□ -2.321e-323■■■■■ 31.7
LARP7Q4G0J3 GAS5-207ENST00000422207 643 ntTSL 25.91□□□□□ -1.467e-52■■■■■ 31.3
LARP7Q4G0J3 GAS5-225ENST00000454813 621 ntTSL 35.83□□□□□ -1.487e-52■■■■■ 31.3
LARP7Q4G0J3 GAS5-217ENST00000444470 424 ntTSL 25.4□□□□□ -1.547e-52■■■■■ 31.3
LARP7Q4G0J3 GAS5-212ENST00000434796 575 ntTSL 24.51□□□□□ -1.697e-52■■■■■ 31.3
LARP7Q4G0J3 GAS5-202ENST00000414075 413 ntTSL 2 BASIC5.81□□□□□ -1.482e-30■■■■■ 30.1
LARP7Q4G0J3 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.671e-6■■■■■ 29.6
LARP7Q4G0J3 ING5-206ENST00000482774 2376 ntTSL 318.29■□□□□ 0.521e-6■■■■■ 29.6
LARP7Q4G0J3 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.41e-6■■■■■ 29.6
LARP7Q4G0J3 ING5-213ENST00000636051 4199 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.161e-6■■■■■ 29.6
LARP7Q4G0J3 ING5-210ENST00000492488 822 ntTSL 214.82□□□□□ -0.041e-6■■■■■ 29.6
LARP7Q4G0J3 ING5-209ENST00000489509 920 ntTSL 214.65□□□□□ -0.061e-6■■■■■ 29.6
LARP7Q4G0J3 ING5-211ENST00000493261 543 ntTSL 210.78□□□□□ -0.681e-6■■■■■ 29.6
LARP7Q4G0J3 ING5-204ENST00000445620 662 ntTSL 36.18□□□□□ -1.421e-6■■■■■ 29.6
LARP7Q4G0J3 TAF1D-205ENST00000526015 1735 ntTSL 1 (best)17.8■□□□□ 0.441e-41■■■■■ 29.5
LARP7Q4G0J3 TAF1D-201ENST00000323981 2540 ntTSL 213.96□□□□□ -0.181e-41■■■■■ 29.5
LARP7Q4G0J3 TAF1D-204ENST00000525928 1710 ntTSL 29.88□□□□□ -0.831e-41■■■■■ 29.5
LARP7Q4G0J3 TAF1D-210ENST00000529435 1011 ntTSL 57.82□□□□□ -1.161e-41■■■■■ 29.5
LARP7Q4G0J3 TAF1D-215ENST00000530769 4358 ntTSL 27.18□□□□□ -1.261e-41■■■■■ 29.5
LARP7Q4G0J3 TAF1D-221ENST00000540232 483 ntTSL 36.92□□□□□ -1.31e-41■■■■■ 29.5
LARP7Q4G0J3 TAF1D-202ENST00000393259 547 ntTSL 36.49□□□□□ -1.371e-41■■■■■ 29.5
LARP7Q4G0J3 TAF1D-222ENST00000546088 1728 ntTSL 36.13□□□□□ -1.431e-41■■■■■ 29.5
LARP7Q4G0J3 EPB41L4A-AS1-202ENST00000427306 1367 ntTSL 222.63■■□□□ 1.217e-17■■■■■ 29.4
LARP7Q4G0J3 EPB41L4A-AS1-203ENST00000442823 578 ntTSL 217.09■□□□□ 0.337e-17■■■■■ 29.4
LARP7Q4G0J3 EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 2969 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.287e-17■■■■■ 29.4
LARP7Q4G0J3 EPB41L4A-AS1-204ENST00000508590 292 ntTSL 316.07■□□□□ 0.167e-17■■■■■ 29.4
LARP7Q4G0J3 SNORA13-201ENST00000458790 133 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.467e-17■■■■■ 29.4
LARP7Q4G0J3 RABGGTB-201ENST00000319942 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.899e-54■■■■■ 28.8
LARP7Q4G0J3 RABGGTB-205ENST00000462042 569 ntTSL 39.27□□□□□ -0.939e-54■■■■■ 28.8
LARP7Q4G0J3 RABGGTB-209ENST00000473406 721 ntTSL 58.8□□□□□ -19e-54■■■■■ 28.8
LARP7Q4G0J3 RABGGTB-210ENST00000485459 788 ntTSL 57.76□□□□□ -1.179e-54■■■■■ 28.8
LARP7Q4G0J3 RABGGTB-212ENST00000491266 961 ntTSL 37.74□□□□□ -1.179e-54■■■■■ 28.8
LARP7Q4G0J3 RABGGTB-207ENST00000470201 848 ntTSL 37.31□□□□□ -1.249e-54■■■■■ 28.8
LARP7Q4G0J3 RABGGTB-208ENST00000471759 2137 ntTSL 27.24□□□□□ -1.259e-54■■■■■ 28.8
LARP7Q4G0J3 RABGGTB-202ENST00000370826 512 ntTSL 2 BASIC6.76□□□□□ -1.339e-54■■■■■ 28.8
LARP7Q4G0J3 RABGGTB-213ENST00000496055 3863 ntTSL 25.26□□□□□ -1.579e-54■■■■■ 28.8
LARP7Q4G0J3 SLC2A1-201ENST00000372500 533 ntTSL 315.44■□□□□ 0.061e-6■■■■■ 28.6
LARP7Q4G0J3 PID1-202ENST00000392054 2745 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.071e-8■■■■■ 28.6
LARP7Q4G0J3 PID1-204ENST00000409462 2387 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.231e-8■■■■■ 28.6
LARP7Q4G0J3 PID1-203ENST00000392055 2533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.31e-8■■■■■ 28.6
LARP7Q4G0J3 PID1-206ENST00000534952 553 ntTSL 413.08□□□□□ -0.321e-8■■■■■ 28.6
LARP7Q4G0J3 PID1-205ENST00000482518 479 ntTSL 29.31□□□□□ -0.921e-8■■■■■ 28.6
LARP7Q4G0J3 PID1-201ENST00000354069 839 ntTSL 3 BASIC8.37□□□□□ -1.071e-8■■■■■ 28.6
LARP7Q4G0J3 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.263e-7■■■■■ 28.4
LARP7Q4G0J3 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.093e-7■■■■■ 28.4
LARP7Q4G0J3 HSP90B1-203ENST00000548462 3032 ntTSL 211.91□□□□□ -0.53e-7■■■■■ 28.4
LARP7Q4G0J3 RNA5SP149-201ENST00000364952 92 ntBASIC7.68□□□□□ -1.183e-50■■■■■ 27.9
LARP7Q4G0J3 ALB-208ENST00000495173 445 ntTSL 35.82□□□□□ -1.481e-9■■■■■ 27.9
LARP7Q4G0J3 ALB-213ENST00000508932 369 ntTSL 34.35□□□□□ -1.711e-9■■■■■ 27.9
LARP7Q4G0J3 AFP-203ENST00000506820 476 ntTSL 26.08□□□□□ -1.447e-35■■■■■ 27.6
LARP7Q4G0J3 SNHG16-208ENST00000591956 556 ntTSL 211.02□□□□□ -0.657e-31■■■■■ 27.6
LARP7Q4G0J3 SNHG16-201ENST00000448136 3607 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.77e-31■■■■■ 27.6
LARP7Q4G0J3 SNHG16-204ENST00000586942 568 ntTSL 4 BASIC9.73□□□□□ -0.857e-31■■■■■ 27.6
LARP7Q4G0J3 SNHG16-207ENST00000590435 1947 ntTSL 5 BASIC9.1□□□□□ -0.957e-31■■■■■ 27.6
LARP7Q4G0J3 SNHG16-202ENST00000493536 2424 ntTSL 1 (best)8.29□□□□□ -1.087e-31■■■■■ 27.6
LARP7Q4G0J3 SNHG16-206ENST00000587838 884 ntTSL 35.13□□□□□ -1.597e-31■■■■■ 27.6
LARP7Q4G0J3 RPL23A-206ENST00000496182 636 ntTSL 3 BASIC14.39□□□□□ -0.114e-11■■■■■ 27.3
LARP7Q4G0J3 RPL23A-204ENST00000422514 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.374e-11■■■■■ 27.3
LARP7Q4G0J3 RPL23A-205ENST00000472628 639 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.714e-11■■■■■ 27.3
LARP7Q4G0J3 RPL23A-202ENST00000394935 580 ntTSL 39.53□□□□□ -0.884e-11■■■■■ 27.3
LARP7Q4G0J3 RPL23A-201ENST00000355731 587 ntTSL 59.07□□□□□ -0.964e-11■■■■■ 27.3
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