Protein–RNA interactions for Protein: Q3SX64

ODF3L2, Outer dense fiber protein 3-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 289 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODF3L2Q3SX64 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC19.35■□□□□ 0.69
ODF3L2Q3SX64 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
ODF3L2Q3SX64 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
ODF3L2Q3SX64 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
ODF3L2Q3SX64 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
ODF3L2Q3SX64 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
ODF3L2Q3SX64 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
ODF3L2Q3SX64 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
ODF3L2Q3SX64 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
ODF3L2Q3SX64 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
ODF3L2Q3SX64 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC19.34■□□□□ 0.69
ODF3L2Q3SX64 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC19.34■□□□□ 0.69
ODF3L2Q3SX64 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
ODF3L2Q3SX64 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
ODF3L2Q3SX64 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC19.33■□□□□ 0.68
ODF3L2Q3SX64 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
ODF3L2Q3SX64 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ODF3L2Q3SX64 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ODF3L2Q3SX64 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ODF3L2Q3SX64 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ODF3L2Q3SX64 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ODF3L2Q3SX64 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ODF3L2Q3SX64 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ODF3L2Q3SX64 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ODF3L2Q3SX64 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ODF3L2Q3SX64 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ODF3L2Q3SX64 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
ODF3L2Q3SX64 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ODF3L2Q3SX64 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ODF3L2Q3SX64 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ODF3L2Q3SX64 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ODF3L2Q3SX64 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ODF3L2Q3SX64 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ODF3L2Q3SX64 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ODF3L2Q3SX64 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
ODF3L2Q3SX64 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
ODF3L2Q3SX64 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
ODF3L2Q3SX64 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
ODF3L2Q3SX64 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
ODF3L2Q3SX64 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
ODF3L2Q3SX64 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
ODF3L2Q3SX64 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
ODF3L2Q3SX64 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
ODF3L2Q3SX64 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
ODF3L2Q3SX64 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
ODF3L2Q3SX64 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC19.26■□□□□ 0.67
ODF3L2Q3SX64 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
ODF3L2Q3SX64 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ODF3L2Q3SX64 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ODF3L2Q3SX64 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
ODF3L2Q3SX64 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
ODF3L2Q3SX64 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
ODF3L2Q3SX64 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
ODF3L2Q3SX64 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
ODF3L2Q3SX64 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
ODF3L2Q3SX64 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
ODF3L2Q3SX64 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
ODF3L2Q3SX64 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
ODF3L2Q3SX64 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
ODF3L2Q3SX64 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
ODF3L2Q3SX64 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
ODF3L2Q3SX64 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ODF3L2Q3SX64 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ODF3L2Q3SX64 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
ODF3L2Q3SX64 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
ODF3L2Q3SX64 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
ODF3L2Q3SX64 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
ODF3L2Q3SX64 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ODF3L2Q3SX64 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ODF3L2Q3SX64 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
ODF3L2Q3SX64 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
ODF3L2Q3SX64 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
ODF3L2Q3SX64 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ODF3L2Q3SX64 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ODF3L2Q3SX64 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ODF3L2Q3SX64 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ODF3L2Q3SX64 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ODF3L2Q3SX64 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
ODF3L2Q3SX64 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
ODF3L2Q3SX64 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
ODF3L2Q3SX64 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ODF3L2Q3SX64 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ODF3L2Q3SX64 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
ODF3L2Q3SX64 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ODF3L2Q3SX64 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
ODF3L2Q3SX64 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
ODF3L2Q3SX64 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ODF3L2Q3SX64 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
ODF3L2Q3SX64 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
ODF3L2Q3SX64 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
ODF3L2Q3SX64 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
ODF3L2Q3SX64 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ODF3L2Q3SX64 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
ODF3L2Q3SX64 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
ODF3L2Q3SX64 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ODF3L2Q3SX64 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ODF3L2Q3SX64 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
ODF3L2Q3SX64 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ODF3L2Q3SX64 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ODF3L2Q3SX64 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.2 ms